水稻pi-hit-1基因的啟動(dòng)子功能分析.pdf

1、pi-hit-1基因是本實(shí)驗(yàn)室通過(guò)空間誘變找到的一個(gè)水稻新基因。該基因在空間誘變的稻瘟病敏感水稻品系972-4中的表達(dá)水平高于其地面對(duì)照水稻品系972ck，并且能夠被特定的稻瘟病生理小種誘導(dǎo)表達(dá)。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明該基因編碼ATP依賴的Clp蛋白酶。但對(duì)基因結(jié)構(gòu)分析，發(fā)現(xiàn)沒(méi)有突變位點(diǎn)，因此，有必要分析參與該基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的相關(guān)作用因子和啟動(dòng)子。為了對(duì)pi-hit-1基因啟動(dòng)子功能和結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究，本項(xiàng)目首先使用植物啟動(dòng)子分析數(shù)據(jù)庫(kù)(Pl

2、antPromDB-TSSP，TFSEARCH及PLACE)對(duì)該基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)序列進(jìn)行分析，結(jié)果顯示，該基因調(diào)控區(qū)存在多個(gè)順式元件，主要集中在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前500bp的位置，在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前200bp位置可能存在TATAbox元件。通過(guò)對(duì)pi-hit-1基因上游序列進(jìn)行EMSA實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)基因上游200bp存在轉(zhuǎn)錄因子特異結(jié)合位點(diǎn)，這與預(yù)測(cè)結(jié)果一致。同時(shí)為了研究該基因啟動(dòng)子活性與組織特異性，將500bp和1000bp兩個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上