斜帶石斑魚神經(jīng)壞死病毒B2蛋白的功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、神經(jīng)壞死病毒是養(yǎng)殖魚類的重要病原之一,能引起腦和視網(wǎng)膜壞死的病毒性神經(jīng)壞死癥(VNN),在世界范圍內(nèi)對養(yǎng)殖魚類危害很大,尤其在魚類育苗期威脅極大,能造成巨大的經(jīng)濟損失。斜帶石斑魚神經(jīng)壞死病毒(OGNNV)是β諾達病毒屬的一員,人們對其基因組和蛋白質(zhì)組的研究暫時還較少。2004年本實驗室已經(jīng)獲得OGNNV的基因組序列并預測具有B2多功能蛋白。本論文將鑒定OGNNV增殖過程中B2蛋白的存在,并對B2基因進行原核和真核表達,對其凋亡和結合核酸

2、等功能進行初步研究。 首先用生物學軟件對B2基因及其蛋白產(chǎn)物進行生物信息學分析,并構建進化樹分析其進化地位,結果與MCP基因的分析一致。根據(jù)基因組序列,將B2基因克隆至pQE30載體中進行原核表達,表達的His-B2融合蛋白經(jīng)親和層析和電泳分離雙重純化后,免疫小鼠制備了B2蛋白的多克隆抗體,抗血清效價達到1:8000以上。以該抗體運用Western blot鑒定了野生型OGNNV在增殖過程中確實表達了B2蛋白。 以OGN

3、NV感染SSN-1細胞后,通過觀察細胞病理變化、Western blot檢測病毒蛋白的表達確證了OGNNV的感染。同時采用實時熒光定量PCR檢測病毒感染后各個時間段OGNNV全部基因(mcp.RdRp、B2)的表達變化。MCP基因在感染24小時后表達迅速上升,RdRp和B2基因在各個時間點表達水平相當,增加趨勢一致,也支持了表達B2的RNA3來源于RNA1的觀點。 為研究B2蛋白結合核酸的能力,將B2基因克隆至pGEX—4T-1

4、,并進行融合表達和親和層析純化GST—B2蛋白。利用凝膠阻滯實驗發(fā)現(xiàn)GST—B2蛋白能夠結合20 bp以上的雙鏈RNA,且片段越長結合效率越高。在保護實驗中,GST—B2蛋白能結合不同序列的雙鏈RNA,證明這種結合沒有序列依賴性,能保護長鏈的雙鏈RNA免受Dicer酶的切割消化。表明在病毒增殖過程中,B2蛋白在保護病毒RNA免受宿主核酸酶攻擊方面扮演重要角色。 蛋白在細胞內(nèi)的定位與功能相關,因此構建真核表達質(zhì)粒pcB2-GFP和

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