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文檔簡介
1、內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文雞病毒性關(guān)節(jié)炎病毒分離株S1基因的克隆與序列分析及RTPCR檢測方法的研究姓名:常繼濤申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):預(yù)防獸醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師:關(guān)平原申之義20060501CloningandSequenceAnalysisoftheS1GeneofAvianViralArthritisVirusIsolatesandDetectionofAVAVbyRT—PCRAbstractTheAvianViralArthritisV
2、iDIS(AVAV)isolatedinInnerMongoliaandTianjin(AVAVB一98,C一98,G98,T98)WaSpropagated,andthetotalRNAofviruswasextractedAccordingtothepublishedS1genesequenceofARVSl133straininGeneBank,twopairsofprimerweredesigned,oneissequencin
3、gprimer,theotherisdiagnosticprimerTheS1geneofviruswasamplificatedwithsequencingprimerbyRT—PCRandthenclonedintopGEMTEasyplasmidsandthensequencedEachoftheacquiredsequencescontains1643bp,andallcongtainthreeORFs(ORFl,ORF2and
4、ORF3)andthenontranslatedregionP10P17and03proteinwasencodedbyORFl,ORF2andORF3respectivelyTheresultofsequencecomparisonindicated:therearen’tdifferencesinP10proteinandP17proteinamongthefourisolatesofAVAV,andonlythreenucleot
5、idesdifferencein03gene;theirhomologyisabove95%comparedwiththefourisolatedAVAVstrainswithotherreferencestrainSexceptARV138andNelsonBayVirusmBV)ThisindicatedthattheS1gene’SdependablityishighbetweentheAVAVisolatedfromChinaa
6、ndreferencestrainsThevirusRNAwasamplificatedwithdiagnosticprimerbyonestepRT—PCI乙thenestablishedRT—PCRdiagnosticmethod,anddetectedthismethod’SspecificityandsensitivityTheresultsindicatedthattheonestepRTPCRmethodcandetectt
7、henucleicacidofstandardstrainvirus(ARV—S1133)andloealityisolatedstrains(B98,C98,G一98,T98),whichwerepropagatedinchickembryoWegeta435bpDNAfragment,whichisthesame、Ⅳitllweexpected,whilethedetectionresultsofotherreferenceetio
8、logicalagentsfNDV,IBDV,IBV,ILTV,EDS76V)werenegative;theminimumARVRNA’SdetectionlevelofthisRTPCRmethodisO5ngthisillustratedthatthismethodisspecificandsensitiveforthedetectionofAvianreovirusKeywords:AvianHralArthritisVirus
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