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簡介:分類號UDC密級編號中南大學(xué)L737728CENTRALSOUTHUNIVERSITY碩士學(xué)位論文論文題目學(xué)科專業(yè)研究生姓名導(dǎo)師姓名及其專業(yè)技術(shù)職稱中南大學(xué)2010年5月表一復(fù)一一簍一分類號VDC碩士學(xué)位論文密級/YLLL/LLL/1LLLLLL7/L/LLLL2LLLLLLLLLUL3LLLLL/5/LLLTL5/LLLY1721355人皮膚成纖維細(xì)胞衰老過程中表觀遺傳學(xué)相關(guān)基因表達(dá)的初步研究PRELIMINARYSTUDYOFEPIGENETICSGENEEXPRESSIONSOFHUMANSKINFIBROBLASTSDURINGAGING作者姓名學(xué)科專業(yè)學(xué)院系、所指導(dǎo)教師李斌皮膚病與性病學(xué)湘雅醫(yī)院謝紅付教授答辯委員會主中南大學(xué)2010年5月
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簡介:932678J交弓I1’南京醫(yī)科大學(xué)崮熟學(xué)位論文星性煎麴照自魚痘墨變塑監(jiān)危蓬塞型丑塑照董佳堂盟窺逝指導(dǎo)教師圭建耍圭堡垂蚯型墊擯壹童基盤筮生蔓二型復(fù)堡監(jiān)生莖生冬&匿墮壘遮丑一一一一申請學(xué)位級制一亟一一專業(yè)名稱壘盤由£蘭一論文提交目期2魚。魚生臼論文答辯日期上。雌王且一學(xué)恬授了,臼期一一地生2旦一答辯委員會主霄評閱人一2006年5月15日南京醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文AⅣ【LPO05。除標(biāo)準(zhǔn)T9;22Q34;Q“易位外MFISH共檢出56種結(jié)構(gòu)異常,其中5種平衡易位、51種不平衡易位,不平衡易位包括了2種插入、6種缺失及43種易位及衍生染色體;另外還檢出23種數(shù)目異常。22例CMLBC中所有染色體均涉及異常,除標(biāo)準(zhǔn)T9;22易位外異常最多涉及的染色體是9號409%9/22、8號364%8/22、17號364%8/22、22號364%8/22。1例M。FISH未檢出CCAS核型的克隆,4例標(biāo)本檢出了傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳學(xué)CC未發(fā)現(xiàn)的異常核型的克隆。MFISH明確了14種CC未確定的異常、糾正了4種CC識別錯誤的異常,還發(fā)現(xiàn)了CC未檢出的26種染色體易位,其中DER9T1;9;1、DER9T16;6;9;22、IDER9Q10T8;9、DER18T16;18;19為既往文獻(xiàn)未見報道的易位。結(jié)論1CMLBC免疫表型復(fù)雜、多系表達(dá)常見。CMLBC中干/祖細(xì)胞階
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簡介:華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文眼科遺傳疾病的分子遺傳學(xué)分析姓名柯鐵申請學(xué)位級別博士專業(yè)生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師王擎劉木根20060714II(4)我們對一個LHON家系進(jìn)行臨床分析,發(fā)現(xiàn)家系內(nèi)患者整體預(yù)后良好,實屬罕見;對家系成員進(jìn)行了線粒體DNA的3個原發(fā)突變位點檢測,發(fā)現(xiàn)病人攜帶MTG11778A位點突變,而且多名病人和突變攜帶者呈現(xiàn)出異質(zhì)性突變;對相關(guān)繼發(fā)突變位點的檢測沒有發(fā)現(xiàn)次級突變的存在。該結(jié)果表明可能存在其它因子對該家系的表型起調(diào)節(jié)作用。所有這些分子遺傳學(xué)研究為闡明先天性白內(nèi)障和視神經(jīng)疾病的病理學(xué),以及提供更好的遺傳咨詢和最終發(fā)展有效疾病治療策略提供了有益的幫助。關(guān)鍵詞先天性白內(nèi)障常染色體視神經(jīng)萎縮LEBER’S視神經(jīng)萎縮基因突變HSF4CRYABOPA1
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簡介:自1992年首次被報道后,BRUGADA綜合征已得到醫(yī)學(xué)界的普遍認(rèn)同,根據(jù)2002年及2003年兩次歐洲心律失常工作組會議達(dá)成的共識,BRUGADA綜合征被定義為一種“疾病”。本病屬常染色體顯性遺傳病,好發(fā)于東南亞、日本等國家地區(qū),而在美國、北歐發(fā)病率相對較低,臨床特征主要包括多以心因性猝死或頻發(fā)暈厥為首發(fā)癥狀,發(fā)病時心電圖記錄到極短配對間期室性期前收縮、多形性室性心動過速、心室顫動,但常規(guī)的臨床檢查,包括體格檢查,影像學(xué)、超聲學(xué)、冠狀動脈造影等均無心臟器質(zhì)性病變的證據(jù);靜息常規(guī)12導(dǎo)聯(lián)心電圖有特征性改變右心前區(qū)V1~V3導(dǎo)聯(lián)J點抬高≥2MM02MV而形成明顯的J波,繼而ST段呈斗篷狀或鞍形抬高,T波可繼發(fā)倒置,QT間期一般正常,這種特征性心電圖表現(xiàn)也被稱作“BRUGADA心電圖征”,并且根據(jù)JSTT的不同形態(tài)可區(qū)分為3型1,2,3型;JST可呈動態(tài)變化,3型之間可互相轉(zhuǎn)變,甚至一過性正常,但在IC類抗心律失常藥物如氟卡尼等的作用下,可被重新暴露或加重;目前尚無普遍認(rèn)同的有效藥物治療方案,內(nèi)置式植入除顫轉(zhuǎn)復(fù)器IMPLANTABLECARDIOVERTERDEFIBRILLAT,ICD是唯一能夠預(yù)防BRUGADA綜合征猝死發(fā)生的治療措施。BRUGADA綜合征發(fā)病機(jī)制的研究近年來在分子遺傳學(xué)及電生理領(lǐng)域取得了較大的進(jìn)展,心臟電壓門控NA通道蛋白Α亞單位NA通道基因SCN5A的遺傳缺陷,被認(rèn)為是BRUGADA綜合征的基本病因;目前已有近100個SCN5A基因突變被發(fā)現(xiàn)與該病有關(guān),但也有證據(jù)表明另有致病基因,此外,已知鉀通道基因HERG的遺傳變異以及一些基因多態(tài)性現(xiàn)象可促使BRUGADA綜合征的發(fā)病或加重病情。關(guān)于BRUGADA綜合征發(fā)病的細(xì)胞電生理及病理生理機(jī)制尚未完全闡明,目前較普遍認(rèn)同的觀點認(rèn)為SCN5A突變導(dǎo)致NA通道結(jié)構(gòu)功能缺陷或是NA通道蛋白表達(dá)、轉(zhuǎn)運障礙,功能下降,導(dǎo)致心肌細(xì)胞總NA內(nèi)流減弱,在動作電位1相末,跨細(xì)胞膜離子流失衡,動作電位平臺期2相喪失,而不同離子通道在心臟的不均一分布使這種平臺期的消失并不一致,最終在右室流出道RIGHTVENTRICULAROUTFLOWTRACT,RVOT的心內(nèi)膜與心外膜之間形成跨室壁電壓差,形成右心導(dǎo)聯(lián)J波、ST段抬高的基礎(chǔ),并在動作電位平臺期2相形成復(fù)極的不均一,在RVOT的心肌細(xì)胞之間誘發(fā)2相折返性,導(dǎo)致室速、室顫的發(fā)生。因此,類似BRUGADA綜合征、先天性長QT綜合征等這些因為離子通道先天缺陷而導(dǎo)致的原發(fā)性心律失常性疾病,又被稱為“離子通道心肌病”IONCHANNELOPATHIES。關(guān)于發(fā)病機(jī)制,另一種觀點認(rèn)為NA內(nèi)流減弱可導(dǎo)致直接使心肌細(xì)胞的傳導(dǎo)功能受損,或者NA通道缺陷通過影響心肌細(xì)胞內(nèi)的離子平衡,繼而影響心肌細(xì)胞的代謝,導(dǎo)致心肌細(xì)胞出現(xiàn)慢性病理損害而減慢傳導(dǎo),心臟傳導(dǎo)在RVOT處從心內(nèi)膜向心外膜的傳導(dǎo)過程減慢,形成跨室壁電壓差,導(dǎo)致心電圖ST段抬高,并構(gòu)成折返途徑,傳導(dǎo)速度不同的心肌細(xì)胞交界處產(chǎn)生異位起搏點并誘發(fā)折返性室性心律失常。近年的研究表明BRUGADA綜合征的臨床表現(xiàn)、病理生理學(xué)特征、分子、電生理機(jī)制遠(yuǎn)比我們所了解的要復(fù)雜,尚有諸多問題仍未闡明。在國內(nèi),對BRUGADA綜合征的認(rèn)識正逐漸深入,已經(jīng)意識到中國人的BRUGADA綜合征發(fā)病率可能并不低,但目前缺乏更多的臨床及流行病學(xué)資料,而在分子、細(xì)胞電生理方面的研究更是滯后。中國擁有眾多人口與民族,也意味著病人數(shù)量會十分龐大,臨床表現(xiàn)及遺傳多樣性會更加復(fù)雜,這對于國人BRUGADA綜合征的研究是一項艱巨的工作。在本研究中,我們收集了10例BRUGADA綜合征病人以及9例無癥狀的BRUGADA心電圖征個人以及其家系成員的臨床資料及外周血標(biāo)本,并進(jìn)行分子遺傳學(xué)的突變檢測,研究中國人BRUGADA綜合征與SCN5A基因的遺傳缺陷是否相關(guān),若發(fā)現(xiàn)基因突變,則進(jìn)一步進(jìn)行細(xì)胞電生理學(xué)的功能表達(dá)研究,深入分析BRUGADA綜合征發(fā)病的分子遺傳學(xué),細(xì)胞電生理、病理生理學(xué)機(jī)制以及與臨床特征的關(guān)系。
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簡介:中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文兒童急性淋巴細(xì)胞白血病細(xì)胞遺傳學(xué)改變與預(yù)后相關(guān)性分析姓名張平申請學(xué)位級別碩士專業(yè)內(nèi)科學(xué)指導(dǎo)教師竺曉凡20060601中闞協(xié)和醫(yī)科大學(xué)中網(wǎng)醫(yī)學(xué)科學(xué)院碩士研競生畢業(yè)論文核型異常組中,超二倍體23例、亞二倍體13例、假二倍體17例,CR率分別為95%、83%、73%,DFS超過1年的患兒分別為20例、8例、11例,DFS超過3年的患兒分別為4例、1例、3例。3超二倍體預(yù)后較好;E2APBXL融合基因陽性,T119Q23P13預(yù)后較差;BCR腳L融合基因陽性/T922Q34Q11者預(yù)后極差。4檢出3例未見文獻(xiàn)報道的異常核型1例核型為46,XY,T412Q28P13,TDEL6Q239P22Q34,DEL8P22,DEL20Q1110/46,1『5,治療后DFS為24個月,停療后復(fù)發(fā)。1例核型為46,XY,T18Q41Q243/46,XY,ADD9P24,DEL12Q211,治療后早期復(fù)發(fā),DFS為2個月另1例核型為47,XX,T912PLOQ10,DEL9QLLQ222/46,XX10,現(xiàn)已無事件生存19個月。結(jié)論急性淋巴細(xì)胞白血病患兒的細(xì)胞遺傳學(xué)表現(xiàn)與國內(nèi)外報道的ALL患兒細(xì)胞遺傳學(xué)表現(xiàn)基本相似,細(xì)胞遺傳學(xué)表現(xiàn)可有效地用于評估ALL患兒的預(yù)后。檢出三種未見文獻(xiàn)報道的核型,其與疾病預(yù)后的關(guān)系尚需進(jìn)一步研究。關(guān)鍵詞急性淋巴細(xì)胞白血病兒童;細(xì)胞遺傳學(xué);預(yù)后
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簡介:中山大學(xué)博士學(xué)位論文四種眼球形態(tài)或結(jié)構(gòu)異常及其分子遺傳學(xué)研究姓名王攀峰申請學(xué)位級別博士專業(yè)眼科學(xué)指導(dǎo)教師張清炯20070510中山大學(xué)博士學(xué)位論文四種眼球形態(tài)或結(jié)構(gòu)異常及其分子遺傳學(xué)研究位于進(jìn)化上高度保守的蘇氨酸變成天門冬氨酸。眼部檢查發(fā)現(xiàn),小角膜眼伴有球后囊腫,對側(cè)眼具有先天性眼組織缺損。眼外檢查發(fā)現(xiàn)先天性蛛網(wǎng)膜囊腫和尿道下裂。對其家系成員的分析發(fā)現(xiàn),其父攜帶相同突變,并表現(xiàn)出單側(cè)的先天性眼組織缺損伴先天性白內(nèi)障。該突變未在其母及96例正常對照中出現(xiàn)。結(jié)論發(fā)現(xiàn)SOX2基因突變及相關(guān)眼部異常在兩代家系中存在,臨床表現(xiàn)以先天性眼組織缺損為共有特征,合并球后囊腫和先天性蛛網(wǎng)膜下腔囊腫,這些特點此前未見報道。第2部分常染色體顯性LEBER先天性黑噱與CRX基因突變目的常染色體顯性遺傳LEBER先天性黑朦LCA的分予遺傳學(xué)證據(jù)不足,目前的證據(jù)有一定缺陷。本研究的目的是尋找一個常染色體顯性遺傳LCA家系的致病基因。材料方法收集一個常染色體顯性遺傳LCA三代大家系的臨床資料,抽取靜脈血制備基因組DNA。直接測序分析CR基因。結(jié)果家系中全部6名患者具有I臨床典型的LCA特征,呈常染色體顯性遺傳。所有患者攜帶相同的CRX基因雜和突變C458DELCPR0153GINFSX34。單體型分析提示C458DELC突變與LCA共分離。正常家系成員及96例正常對照者中沒有發(fā)現(xiàn)該突變。結(jié)論結(jié)果提供了確切的證據(jù),表明CRX基因突變可以導(dǎo)致常染色體顯性LCA。結(jié)果已發(fā)表GRAEFE’SARCHCLINEXPOPHTHALMOL2007第3部分先天性無虹膜和PAX6基因突變目的研究中國人群先天性無虹膜患者PAX6基因突變特點及其相關(guān)表型。材料方法收集11個先天性無虹膜家系的先證者及其家族成員,和96例無親緣關(guān)系正常對照,抽取靜脈血制備基因組DNA。直接測序分析PAX6基因。結(jié)果在5個先天性無虹膜家系中發(fā)現(xiàn)PAX6基因突變,其中C1411GA,C1843CG,C542CASERL81X和C562CTGINL88X為新突變,C120CACYS40X為已知突變。96例正常對照中未發(fā)現(xiàn)以上5種突變。5個11
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簡介:溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文LEBER遺傳性視神經(jīng)病變家系的臨床和分子遺傳學(xué)研究姓名趙福新申請學(xué)位級別碩士專業(yè)遺傳學(xué)指導(dǎo)教師管敏鑫瞿佳20070501溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文NC7NDLND2ND3ND4ND4LND5ND6NDNA0XPHOSPCRPHEPRORFLPRNARRNATRNASERSSCPTTERTHRTRNALEUTAMTRNACYSTRNAGLYNONCODINGNUCLEOTIDESNADHDEHYDROGENASESUBUNIT1NADHDEHYDROGENASESUBUNIT2NADHDEHYDROGENASESUBUNIT3NADHDEHYDROGENASESUBUNIT4NADHDEHYDROGENASESUBUNIT4LNADHDEHYDROGENASESUBUNIT5NADHDEHYDROGENASESUBUNIT6NUCLEARDNAOXIDATIVEPHOSPHORYLATIONPOLYMERASECHAINREACTIONPHENYLALANINEPROLINERESTRICTIONFRAGMENTLENGTHPOLYMORPHISMRIBONUCLEICACIDRIBOSOMALRIBONUCLEICACIDTRANSFCRRIBONUCLEICACIDSERINESINGLESTRANDCONFORMATIONALPOLYMORPHISMTHYMINETERMINATORTHREONINETRNALEUCINETRNACYSTEINETRNAGLYCINE位于細(xì)胞色素C氧化酶亞單位II和攜帶賴氨酸的TRNA的非編碼區(qū)還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位L還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位2還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位3還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位4還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位4L還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位5還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位6核脫氧核糖核酸氧化磷酸化聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)苯丙氨酸脯氨酸限制性片段長度多態(tài)性核糖核酸核蛋白體核糖核酸轉(zhuǎn)移核糖核酸絲氨酸單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析胸腺嘧啶終止子蘇氨酸攜帶亮氨酸的TRNA攜帶半胱氨酸的TRNA攜帶甘氨酸的TRNATYRTYROSINE酪氨酸VALVALINE纈氨酸翌堡型盟P堡坐塑堂亟壟皇垡
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簡介:北京中醫(yī)藥大學(xué)碩士學(xué)位論文LEBER遺傳性視神經(jīng)病變14484位點突變的中醫(yī)體質(zhì)學(xué)研究姓名孫艷紅申請學(xué)位級別碩士專業(yè)中西醫(yī)結(jié)合臨床指導(dǎo)教師韋企平20070501中文摘要中文摘要LEBER遺傳性視神經(jīng)病變LHON是一種由線粒體DNA突變引起的母系遺傳的線粒體疾病。因其視力損害嚴(yán)重,不僅給患者心理上造成極大的痛苦和障礙,也給家庭和社會帶來沉重的負(fù)擔(dān)。本課題在中醫(yī)體質(zhì)理論指導(dǎo)下,從流行病學(xué)角度研究LHONL4484點突變的臨床特征和中醫(yī)體質(zhì)分型,進(jìn)一步探討LHON發(fā)病與體質(zhì)類型的相關(guān)性,希望從更深層次認(rèn)識LHON,為進(jìn)一步研究LHON的預(yù)防和治療奠定理論基礎(chǔ)。論文主要包括文獻(xiàn)綜述和臨床觀察兩部分。文獻(xiàn)綜述主要包括LEBER遺傳性視神經(jīng)病變和LEBER遺傳性視神經(jīng)病變中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究兩部分。在LEBER遺傳性視神經(jīng)病變中,對LEBER遺傳視神經(jīng)病變的生化基礎(chǔ),基因檢測,組織病理學(xué),臨床特征,診斷與鑒別診斷,治療,預(yù)后及遺傳咨詢等方面進(jìn)行了簡要評述。在LEBER遺傳性視神經(jīng)病變中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究中,則對LHON的中醫(yī)學(xué)病名、病因病機(jī)、辯證分型及中醫(yī)眼科各學(xué)說的認(rèn)識進(jìn)行簡要回顧。臨床觀察部分日的從流行病學(xué)角度研究LHONL4484點突變的臨床特征和中醫(yī)體質(zhì)分型,進(jìn)一步探討LHON發(fā)病與體質(zhì)類型的關(guān)系。方法對2003年7月至2006年4月間LO例來自不同家系的14484點突變患者進(jìn)行追蹤隨訪。收集169例母系親屬的相關(guān)臨床和病史資料,繪制家系圖。同時采用中醫(yī)體質(zhì)調(diào)查表,對135例母系家族成員進(jìn)行體質(zhì)類型調(diào)查。結(jié)果LO家系169位母系親屬LHON外顯率為278%47/169。所有患者均為急性或亞急性發(fā)病,雙眼受累。經(jīng)過平均23581月的隨訪,714%30/42患者視力恢復(fù),女性視力恢復(fù)率783%高于男性50%。135例母系親屬接受體質(zhì)調(diào)查,各種體質(zhì)類型的發(fā)病率由高至低依次為氣郁質(zhì)5556%、氣虛質(zhì)40%、濕熱質(zhì)3333%、陰虛質(zhì)3182%、瘀血質(zhì)20%、痰濕質(zhì)1667%、正常質(zhì)125%。對九種體質(zhì)類型發(fā)病率整體比較有統(tǒng)計學(xué)差異P005。剔除樣本量小于10的四種體質(zhì)類型后,其余五種體質(zhì)類型兩兩比較,正常質(zhì)一氣郁質(zhì)的發(fā)病率差異顯著P001,其余體質(zhì)類型間發(fā)病率無統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)論LHONL4484位點突變的臨床特征與其他位點突變相似。體質(zhì)類型與LHON發(fā)病相關(guān)。氣郁質(zhì)對LHON的發(fā)病影響顯著。主題詞LEBER遺傳性視神經(jīng)病變;14484位點突變;分子生物學(xué);流行病學(xué);中醫(yī)體質(zhì)
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簡介:第一部分非綜合征性圓錐動脈干畸形中染色體22Q112缺失調(diào)查目的調(diào)查中國人非綜合征性圓錐動脈干畸形患者染色體22Q112微缺失發(fā)生情況。方法運用熒光原位雜交方法對36名非綜合征性圓錐動脈干畸形患兒血液標(biāo)本染色體22Q112微缺失進(jìn)行檢查,其中男性23例、女性13例,年齡274±250歲,病種為法樂氏四聯(lián)征21例、右室雙出口9例、先天性校正性大動脈轉(zhuǎn)位1例、肺動脈閉鎖合并室間隔缺損1例、完全性大動脈轉(zhuǎn)位4例。探針為N25N85A3探針。結(jié)論染色體22Q112微缺失為部分非綜合征性圓錐動脈干畸形患者的致病原因。第二部分短串聯(lián)重復(fù)序列基因分型行22Q112缺失調(diào)查的方法學(xué)研究目的研究短串聯(lián)重復(fù)序列基因分型染色體22Q112微缺失篩查方法的可行性。方法研究對象同第一部分。選取22Q112中D22S1638、D22S1648、D22S941、D22S944、D22S1623、D22S264、D22S311、D22S1709等8個短串聯(lián)重復(fù)序列,通過PCR方法對該8個短串聯(lián)重復(fù)序列進(jìn)行基因分型。計算各短串聯(lián)重復(fù)序列雜合度和純合度以及按雜合度大小依次引入短串聯(lián)重復(fù)序列后不同短串聯(lián)重復(fù)序列組合純合狀態(tài)發(fā)生率和與FISH相比染色體22Q112微缺失診斷特異性。結(jié)論短串聯(lián)重復(fù)序列基因分型可以作為檢測染色體22Q112微缺失的篩查方法,短串聯(lián)重復(fù)序列組合純合發(fā)生率小于005作為選擇短串聯(lián)重復(fù)序列組合的標(biāo)準(zhǔn)具有較高的診斷特異性。第三部分圓錐動脈干畸形22Q112缺失遺傳嵌合研究目的研究遺傳嵌合現(xiàn)象在非綜合征性圓錐動脈干畸形發(fā)病機(jī)制中的作用。方法第一部分研究對象中,除4例完全性大動脈轉(zhuǎn)位患兒無法取得心肌標(biāo)本排除在本次研究之外,其余32名患兒納入本次研究,其中男性20例、女性12例,年齡270±208歲。收集患者血液和心肌標(biāo)本,通過PCR方法對血液和心肌標(biāo)本染色體22Q112及附近D22S420、D22S427、D22S1638、D22S1648、D22S941、D22S944、D22S1623、D22S264、D22S311、D22S1709、D22S306、D22S425、D22S257、D22S301、D22S1144等15個短串聯(lián)重復(fù)序列進(jìn)行基因分型,比較血液和心肌標(biāo)本短串聯(lián)重復(fù)序列基因型的異同。結(jié)論遺傳嵌合現(xiàn)象可能不是非綜合征性圓錐動脈干畸形的發(fā)病機(jī)制。第四部分圓錐動脈干畸形候選致病基因TBX1單核苷酸多態(tài)性調(diào)查目的掃描無染色體22Q112微缺失圓錐動脈干畸形患者血細(xì)胞TBX1基因外顯子,以期發(fā)現(xiàn)突變位點或單核苷酸多態(tài)性位點。方法第一部分中所有33名無染色體22Q112微缺失的患者為本部分研究對象,其中男性21例、女性12例,年齡29391±25157歲,病種為法樂氏四聯(lián)征19例、右室雙出口8例、先天性校正性大動脈轉(zhuǎn)位1例、肺動脈閉鎖合并室間隔缺損1例、完全性大動脈轉(zhuǎn)位4例;對照組為66名健康人血樣,其中男性42例、女性24例,年齡258158±50450歲。對患者血細(xì)胞TBX1基因外顯子進(jìn)行測序,對所發(fā)現(xiàn)的突變位點或單核苷酸多態(tài)性位點在患者和健康人中的分布進(jìn)行比較。結(jié)論TBX1外顯子4CDNA549位單核苷酸多態(tài)性與圓錐動脈干畸形的發(fā)生存在關(guān)聯(lián)關(guān)系。
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簡介:Y1218955分類號泰山匿學(xué)院碩士研究生學(xué)位論文論文題目腦卒中的遺傳流行病學(xué)病例對照研究系醫(yī)院、所泰山醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院研究生姓名柴永宏學(xué)科、專業(yè)老年醫(yī)學(xué)研究方向神經(jīng)內(nèi)科指導(dǎo)教師張敬軍教授入學(xué)時間2004年9月論文工作起止時間2005年8月~2007年5月腦卒中的遺傳流行病學(xué)病例對照研究碩士研究生柴永宏導(dǎo)師張敬軍教授專業(yè)老年醫(yī)學(xué)摘’要目的研究腦卒中發(fā)病過程中的遺傳因素和環(huán)境因素,初步定義腦梗死和腦出血家族,并提出腦卒中一、二級預(yù)防的新策略。方法按照第四屆全國腦血管病會議腦卒中診斷標(biāo)準(zhǔn),收集泰山醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科260例住院及門診患者,其中腦梗死不包括腦栓塞和腦出血患者各130例,對照組260例,并經(jīng)CT或MRI證實。使用統(tǒng)一的腦卒中家系調(diào)查表對所有研究對象進(jìn)行調(diào)查,內(nèi)容包括年齡、性別、民族、職業(yè)、生活習(xí)慣、過去史、家族史、輔助檢查等;家系調(diào)查范圍包括先征者非血緣親屬配偶、一級親屬子女、同胞、父母、二級親屬孫子J孫女、外孫子、外孫女、叔、伯、姑、舅、姨、祖父母、外祖父母,內(nèi)容包括各自年齡、病史、患病年齡等。采用病例對照研究的方法及遺傳流行病學(xué)家系調(diào)查的研究方法分析多種因素對腦卒中的影響。結(jié)果單因素LOGISTIC回歸分析,發(fā)現(xiàn)與腦梗死發(fā)病相關(guān)的危險因素分別是高血壓病史、糖尿病史、吸煙史、飲酒年限、卒中家族史、空腹血糖、LDLC、TC、TG和HDLC,后者為保護(hù)性因素,其它為危險因素;與腦出血發(fā)病相關(guān)的危險因素分別是高血壓病史、糖尿病史、吸煙史、飲酒史、飲酒年限、卒中家族史、高鹽飲食、高脂飲食、TO和空腹血糖。經(jīng)多因素LOGISTIC回歸分析,發(fā)現(xiàn)腦梗死組有7個因素引入最終回歸模型,分別是高血壓病史、糖尿病病史、卒中家族史、LDLC、TC、TG、玎LC;腦出血組有3個因素引入最終回歸模型,分別是高血壓病史、糖尿病病史、卒中家族史。一、二級親屬患病率腦梗死先證者親屬腦梗死患病率為577%,與對照組的240%相比,差異有統(tǒng)計學(xué)意義F30914,P0OOO,病例先證者一、二級親屬和對照組親屬的腦梗死患病率分別為669%、428%和177%、337%;腦出血先征者親屬腦出血患病率為386%,與對照組的155%相比,差異有統(tǒng)計學(xué)意義0720785,PQOOO,病例先證者一、二級親屬和對照組親屬的腦出血患病率分別為521%、175/0和161%、146%。腦梗死病例組配偶腦梗死患病率為462“/5/130,
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簡介:類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RHEUMATOIDARTHRITISRA)和強(qiáng)直性脊柱炎(ANKYLOSINGSPONDYLITISAS)是我國最常見的炎性關(guān)節(jié)炎疾病,其患病率高,致殘率高。這兩種疾病的發(fā)病機(jī)制仍不清,但已知其發(fā)病與遺傳密切相關(guān),且遺傳模式存在種族差異。本課題以RA和AS的易感基因位點入手,圍繞挖掘其致病機(jī)理這一核心環(huán)節(jié),通過各種高通量基因分型、深度測序手段,結(jié)合遺傳流行病學(xué)分析方法,進(jìn)行原創(chuàng)性、以及跨種族遺傳分析比較,對漢族人群RA和AS的遺傳模式、遺傳特點進(jìn)行研究,從而揭示中國漢族人AS和RA的遺傳免疫學(xué)發(fā)病機(jī)制(一)鑒于在RA研究領(lǐng)域尚無中國人群大規(guī)模的遺傳流行病學(xué)研究成果,進(jìn)行了首次漢族人RA大規(guī)模的全基因組關(guān)聯(lián)研究,鑒定了漢族人RA的特有基因DPP4,同時進(jìn)行了CCP陽性與CCP陰性RA病人易感基因的比較分析,以及白種人與漢族人RA遺傳基因的比較分析。豐富了研究者對RA發(fā)病易感基因及遺傳模式的認(rèn)識。(二)在AS研究領(lǐng)域,基于歐洲人、漢族人大規(guī)模全基因組關(guān)聯(lián)研究的工作基礎(chǔ),針對發(fā)病核心易感基因IL23R在不同種族中存在較明顯的遺傳差異的情況,利用進(jìn)行深度測序研究手段,發(fā)現(xiàn)了IL23R基因存在罕見變異與發(fā)病風(fēng)險相關(guān),使得對AS致病機(jī)理的研究有了更新認(rèn)識。(三)以優(yōu)化漢族人全基因組關(guān)聯(lián)研究的平臺為目的,比較在常用全基因分析的兩個平臺ILLUMINA和AFFYMETRIX中檢測漢族人遺傳變異的性能,從而為漢族人中進(jìn)行大規(guī)模遺傳研究提供了方法學(xué)參考。目的進(jìn)行漢族RA患者的大規(guī)模全基因組關(guān)聯(lián)研究,比較與歐洲RA患者遺傳模式的差異;篩選漢族強(qiáng)直性脊柱炎(ANKYLOSINGSPONDYLITISAS)AS患者與AS相關(guān)的白介素23受體(IL23RECEPT,IL23R)基因罕見突變。比較GWAS分型平臺ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60差異;方法研究對象為來自中國上海和北京等省級城市醫(yī)院的無關(guān)聯(lián)門診病人,AS或RA由風(fēng)濕病??漆t(yī)生進(jìn)行診斷確定,對照為來自上海血庫的相應(yīng)的健康獻(xiàn)血人群。應(yīng)用GWAS技術(shù)從2132個病例和2553個對照中篩選了952個病例、943個對照和32個變異。應(yīng)用MACH通過兩步法應(yīng)用1000基因組計劃推算SNP數(shù)據(jù),其中原始數(shù)據(jù)作為第一步,然后再推算頻率信息中。應(yīng)用GRAIL技術(shù)探尋新基因之間以及與已知基因之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系。應(yīng)用GCTA技術(shù)估算RA易感突變的比例??缛巳篗ETA分析技術(shù)用于比較兩個遠(yuǎn)距離遺傳隔離的漢族人和歐洲人的RA遺傳結(jié)構(gòu)差異。AS研究中,應(yīng)用靶向高通量測序技術(shù)進(jìn)行測序。應(yīng)用TAQMANOPENARRAY平臺進(jìn)行基因分型,用APPLIEDBIOSYSTEMSOPENARRAYSNP基因分型軟件驗證。對50個AS病例和59個種族匹配的健康漢族人的包含IL23R基因區(qū)和鄰近區(qū)域的170KB進(jìn)行測序。另外,對650個AS病例和1300個健康對照的,在歐洲人中高相關(guān)的30KB區(qū)域也進(jìn)行測序。用846個病例和1308個健康對照進(jìn)行基因分型驗證。應(yīng)用ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60平臺對非HAPMAP(NONHAPMAP)漢族人N396進(jìn)行基因分型,用IMMUNOCHIP對子集進(jìn)行基因分型。ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60平臺獲得的基因型標(biāo)記用于基于HAPMAP2JPT日本東京的日本人)CHB(中國北京的漢族人基因數(shù)據(jù)庫的基因推算。應(yīng)用ILLUMINASBEADSTUDIO軟件進(jìn)行基因型聚類。從樣本中分析得出SNPS,其中的低質(zhì)量樣本被剔除。得到的SNPS類集進(jìn)行手工檢索和驗證。PLINKVERSION107軟件的合并模式7的合并功能用于基因分析的符合性分析,它可以比較不計缺失基因型時的符合性。結(jié)果全基因組水平篩選到3個有統(tǒng)計學(xué)差異的NONMHC(NONMAJHISTOCOMPATIBILITYCOMPLEX,非主要組織相容性復(fù)合體)位點,且抗瓜氨酸蛋白抗體(ANTICITRULLINATEDPEPTIDEANTIBODY,ACPA)陽性病例(ACPA)中的該位點比ACPA陰性病例(ACPA)效應(yīng)值要大。其中,有2個是新的突變子,RS12617656,位于二肽基肽酶(DIPEPTIDYLPEPTIDASE4,4DPP4)基因內(nèi)含子區(qū),優(yōu)勢比(ODDSRATIO,)156,P161021;RS12379034,位于CDK5調(diào)節(jié)亞基相關(guān)蛋白2(CDK5REGULATYSUBUNITASSOCIATEDPROTEIN2,CDK5RAP2)基因編碼區(qū),149,P111016;另一個是已知的人趨化因子受體6(HUMANCHEMOKINERECEPT6,CCR6)位點(RS1854853,071,P651015)。ACPA病例與ACPA對照研究顯示,RS12617656與APCA強(qiáng)關(guān)聯(lián)P531018,與主要組織相容性復(fù)合體(MAJHISTOCOMPATIBILITYCOMPLEX,MHC)位點關(guān)聯(lián)性也很強(qiáng)RS7748270P59108??缛巳篗ETA分析顯示關(guān)聯(lián)信號區(qū)的重疊和富集。對3個分型平臺進(jìn)行比較,AFFYMETRIX和ILLUMINA平臺包括IMMUNOCHIP的符合性很高。OMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60的推算能力有差異,而且MACH的推算效率與先前的報道相比總體偏低很多,但OMNIEXPRESS平臺可推算更多的SNPS,其最小等位基因頻率(MINALLELEFREQUENCY,MAF)是5%。OMNIEXPRESS平臺比AFFYMETRIX60平臺有更高的HAPMAPSNPS覆蓋率(各為736和659,MAF5)。AFFYMETRIX60芯片的推算數(shù)據(jù)與OMNIEXPRESS或ILLUMINO芯片的比較時的錯誤率比OMNIEXPRESS的基因型推算與直接分型的AFFYMETRIX60或ILLUMINO芯片SNPS比較時的錯誤率略大。低MAF幾乎對R2評估的推算質(zhì)量或符合性沒有影響,說明這些GWAS芯片雖然不是特異設(shè)計用來捕獲罕見變異,但是實際上也可以捕獲有意義的部分低頻變異的遺傳突變。本研究鑒別了1047個突變,其中729個未出現(xiàn)在DBSNPGENOMICBUILD130數(shù)據(jù)庫中。鑒別了若干有潛在功能的罕見IL23R基因突變,包括1非同義替換SNP(NONSYNONOMOUSSINGLENUCLEOTIDEPOLYMPHISM,NSSNP),GLY149ARG(1號染色體,位置67421184GA)。驗證基因分型顯示GLY149ARG與AS相關(guān)(061,P00054),且預(yù)測算法發(fā)現(xiàn)這個氨基酸的變化會破壞蛋白的功能。與AS相關(guān)的IL23RGLY149ARG突變參與了漢族人AS易感的IL23信號通路,IL23R與先前發(fā)現(xiàn)的STAT3結(jié)合構(gòu)成IL23的新的信號通路。結(jié)論本研究拓展了RA的風(fēng)險等位基因列表,證實DPP4和CDK5RAP2與RA存在遺傳關(guān)聯(lián),且CDK5RAP2是一個與RA相關(guān)的重要的不同于TRAF1C5的新的基因位點,提示不同人群中新型多基因復(fù)雜性狀變異的本質(zhì)實際上都是由常見的偶發(fā)變驅(qū)動的,這為研究RA發(fā)病機(jī)理提供了新的途徑,為常見基因變異驅(qū)動的新型多基因復(fù)雜特性增加了實踐證據(jù)。首次提出與AS發(fā)病機(jī)理相關(guān)的IL23R基因突變,并鑒定了一個低頻的NSSNP,該突變可能導(dǎo)致IL23R失能,從而對漢族人AS具有保護(hù)效應(yīng)。這提示功能下降的IL23R可預(yù)防AS。這個發(fā)現(xiàn)進(jìn)而支持IL23信號在AS發(fā)病過程中中起重要作用,這提示IL23信號通路這條通路可作為AS潛在的治療靶點。本研究還發(fā)現(xiàn)進(jìn)行深度測序有助于鑒別與復(fù)雜疾病易感性相關(guān)的罕見或低頻突變,同時這種技術(shù)方法也有助于候選基因偶發(fā)突變的精確定位。ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60平臺有相似的基因分型準(zhǔn)確性和相似的推算SNPS準(zhǔn)確性。雖然OMNIEXPRESS平臺的HAPMAPSNPS覆蓋率中等,但是對亞洲人來說,它能提供覆蓋率更好一些。研究也提示只要有適當(dāng)?shù)馁|(zhì)量控制,不管是AFFYMETRIX60或OMNIEXPRESS芯片,研究中聯(lián)合推算SNPS或分型SNPS都是可行的。
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簡介:目的慢性炎癥與腫瘤關(guān)系密切,血管內(nèi)皮細(xì)胞在炎癥和腫瘤的病理過程中發(fā)揮重要作用。本研究以內(nèi)毒素(LPS)激活血管內(nèi)皮細(xì)胞,釋放炎癥介質(zhì)和粘附分子,探索內(nèi)皮細(xì)胞NFΚBJMJD3信號軸在內(nèi)皮細(xì)胞炎癥反應(yīng)過程的的作用,并分析其可能的表觀遺傳學(xué)調(diào)控機(jī)制,為有效抑制血管炎癥反應(yīng),尋找相關(guān)疾病治療靶點,提供實驗依據(jù)。方法1細(xì)胞培養(yǎng)及分組復(fù)蘇并常規(guī)培養(yǎng)原代人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞(HUVECS),隨機(jī)分為對照組與LPS實驗組,實驗組按照不同檢測指標(biāo)要求,予LPS刺激不同時間段后取樣待測。2、LPS誘導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞炎性介質(zhì)和粘附分子的表達(dá)釋放ELISA試劑盒檢測細(xì)胞上清液中IL6、MMP9和ICAM1與表達(dá)變化;3、NFΚBP65、JMJD3的表達(dá)與定位免疫熒光實驗觀察NFΚBP65、JMJD3的表達(dá)與定位變化;RTPCR檢測JMJD3RNA水平的表達(dá)變化;蛋白質(zhì)免疫印跡法驗證NFΚBP65,IΚBΑ和JMJD3的表達(dá)變化;4、NFΚBP65轉(zhuǎn)錄因子活性測定MILLIPE轉(zhuǎn)錄因子試劑盒檢測胞核NFΚBP65蛋白活性;5、染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)分析目標(biāo)基因的轉(zhuǎn)錄起始結(jié)合位點區(qū)域NFΚBP65、JMJD3、H3K27ME3的募集關(guān)系應(yīng)用MILLIPE染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒建立目標(biāo)DNA文庫,CHIPQPCR分析在目標(biāo)基因IL6、MMP9和ICAM1轉(zhuǎn)錄起始結(jié)合位點NFΚBP65、JMJD3、H3K27ME3的募集關(guān)系。結(jié)果1、LPS誘導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞炎性介質(zhì)和粘附分子的表達(dá)釋放細(xì)胞上清液中IL6、MMP9和ICAM1分別與相應(yīng)的對照組相比表達(dá)顯著升高,差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P2、NFΚBJMJD3信號通路的活化(1)NFΚBP65免疫熒光實驗中LPS各組與空白對照組(0H組)相比,隨著刺激時間增加整體熒光強(qiáng)度逐漸增加,NFΚBP65表達(dá)上調(diào),并逐漸向轉(zhuǎn)胞核內(nèi)聚集,核轉(zhuǎn)位高峰為2H。(2)NFΚBP65轉(zhuǎn)錄因子活性測定LPS刺激2H組中NFΚBP65蛋白相對活性顯著高于對照組(0H組)(P005。(3)RTPCR檢測JMJD3RNA水平變化LPS2H組RNA水平顯著高于對照組(0H組),差異有統(tǒng)計學(xué)意義P005。(4)JMJD3免疫熒光實驗中LPS各組與對照組(0H組)相比JMJD3的表達(dá)均上調(diào),其中于1H和2H上調(diào)明顯。(5)蛋白質(zhì)免疫印跡法驗證總NFΚBP65蛋白隨著LPS刺激時間增加表達(dá)逐漸上調(diào);胞核NFΚBP65蛋白于2H和6H表達(dá)明顯上調(diào);IΚBΑ蛋白于LPS2H和4H組表達(dá)明顯下調(diào);JMJD3表達(dá)亦上調(diào),于1H和2H上調(diào)明顯。(6)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)分析目標(biāo)基因轉(zhuǎn)錄起始結(jié)合位點NFΚBP65、JMJD3和H3K27ME3的募集關(guān)系NFΚBP65關(guān)聯(lián)DNA文庫中IL6、MMP9的相對擴(kuò)增量與相應(yīng)的對照組相比顯著升高(P005);JMJD3關(guān)聯(lián)DNA文庫、H3K27ME3關(guān)聯(lián)DNA文庫中目標(biāo)基因擴(kuò)增結(jié)果與NFΚBP65關(guān)聯(lián)DNA文庫擴(kuò)增結(jié)果一致。結(jié)論LPS誘導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞中NFΚBJMJD3信號通路激活,活化高峰時間為2HNFΚB信號通路活化后釋放轉(zhuǎn)錄因子入核結(jié)合到JMJD3相應(yīng)啟動子區(qū)域,調(diào)控JMJD3表達(dá),上調(diào)的JMJD3入核作用于目標(biāo)基因區(qū)域組蛋白H3K27ME3使其去甲基化、改變構(gòu)象,從而暴露目標(biāo)基因轉(zhuǎn)錄起始序列,NFΚB通路的活化時也調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子本身表達(dá),上調(diào)的核因子ΚB結(jié)合到暴露的轉(zhuǎn)錄起始序列上調(diào)控目標(biāo)基因的轉(zhuǎn)錄,引起炎癥介質(zhì)和粘附分子的表達(dá)影響內(nèi)皮細(xì)胞微環(huán)境,導(dǎo)致炎癥相關(guān)病理過程。
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簡介:1962年NEEL提出了“節(jié)儉基因”假說并于1982年進(jìn)行了修正,該假說認(rèn)為引發(fā)糖尿病的易感基因有一定遺傳優(yōu)勢,并能使具有這種遺傳基因的個體產(chǎn)生某些生存優(yōu)勢,即“節(jié)儉基因”可以使人類在進(jìn)食期間盡量儲備能量,以備饑餓期間消耗,而在饑荒年代又能夠盡可能減少能量消耗的基因。具有這種基因的人群具有相對的生存優(yōu)勢,即可以通過飽餐期或營養(yǎng)豐盛期盡量將多余的能量以脂肪的形式儲備起來,為饑荒期提供能量供應(yīng),抵抗食物短缺。但隨著社會經(jīng)濟(jì)迅速發(fā)展,在原來經(jīng)常出現(xiàn)食物短缺的地區(qū),食物突然可以長期穩(wěn)定豐富供應(yīng)后,人們在開始接受高熱量食物同時擺脫了繁重的體力勞動,采用少動的生活方式,節(jié)儉基因作用就從有益于人類變成了人類的負(fù)擔(dān),促使了肥胖及Ⅱ型糖尿病的發(fā)生率顯著增加。然而,節(jié)儉基因不應(yīng)僅包括能量代謝相關(guān)基因,水鹽代謝等相關(guān)基因只要受到特定選擇壓力的影響均可成為節(jié)儉基因。本研究基于水鹽代謝通路腎素血管緊張素醛固酮系統(tǒng)RAAS中的幾個關(guān)鍵基因,提出如下假設(shè)“人類走出非洲前,為適應(yīng)干旱高溫環(huán)境在RAAS通路中存在優(yōu)勢基因,走出非洲后,離開干旱高溫環(huán)境,優(yōu)勢基因?qū)⒊蔀榱觿莼颍ü?jié)儉基因?qū)W說),帶有該基因的人將處于生存劣勢,部分被淘汰。因此,相關(guān)基因突變頻率應(yīng)以非洲為中心沿人類遷移路線呈明顯的地理遺傳梯度分布,世界人群的RAAS通路關(guān)鍵基因突變頻率的地理遺傳梯度應(yīng)與全球氣候變化梯度存在空間依賴性”。本研究在空間遺傳學(xué)、空間統(tǒng)計學(xué)和空間生態(tài)學(xué)的框架內(nèi),應(yīng)用探索性和驗證性因子分析提取全球氣候地理因素的潛變量因子,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了氣候因子和等位基因基因頻率的空間自相關(guān)分析、空間克里格插值分析、空間疊加分析、多元線性回歸分析以及地理權(quán)重回歸分析,以此探索“基因節(jié)儉學(xué)說”的進(jìn)化生態(tài)學(xué)證據(jù)。結(jié)果如下⑴全球地理氣候指標(biāo)可提取2個潛變量因子溫度因子,支配著年均平均大氣氣溫(標(biāo)準(zhǔn)化因子載荷095),溫度氣候帶(標(biāo)準(zhǔn)化因子載荷096)和地理緯度帶(標(biāo)準(zhǔn)化因子載荷094)這三個變量,溫度因子得分越高,表示溫度越高;濕度因子,支配著年均降雨量(標(biāo)準(zhǔn)化因子載荷084)和地理氣候帶(標(biāo)準(zhǔn)化因子載荷083)這兩個變量,濕度因子得分越高,表示濕度越大。⑵空間自相關(guān)分析顯示,溫度因子、濕度因子、ACED等位基因、AGT235T等位基因和AT1RC等位基因的空間自相關(guān)系數(shù)分別為061、033、059、057和07,且均有統(tǒng)計學(xué)意義,氣候潛在因子和腎素血管緊張素醛固酮系統(tǒng)關(guān)鍵基因基因頻率具有空間正相關(guān)關(guān)系。⑶ACED等位基因、AGT235T等位基因、AT1RC等位基因、溫度因子和濕度因子均存在二階趨勢,分析比較平均誤差、均方根誤差、標(biāo)準(zhǔn)平均值、標(biāo)準(zhǔn)化平均誤差和標(biāo)準(zhǔn)化均方根誤差,分別選取SPHERICAL模型作為ACED等位基因、溫度因子和濕度因子、GAUSSIAN模型作為AGT235T等位基因、AT1RC等位基因的半方差函數(shù)進(jìn)行空間克里格插值分析。⑷氣候潛在因子(溫度因子和濕度因子)與腎素血管緊張素醛固酮通路內(nèi)關(guān)鍵基因突變位點基因頻率之間的全局回歸模型表明,溫度因子、濕度因子與ACE基因D等位基因基因頻率、AGT基因235T等位基因基因頻率、AT1R基因C等位基因基因頻率有關(guān),并且溫度因子、濕度因子分別正向和負(fù)向影響著D等位基因基因頻率;溫度因子、濕度因子均正向影響著235T等位基因基因頻率;溫度因子、濕度因子均負(fù)向影響著C等位基因基因頻率。⑸氣候潛在因子(溫度因子和濕度因子)與腎素血管緊張素醛固酮通路內(nèi)關(guān)鍵基因突變位點基因頻率之間的局域回歸模型表明,溫度越高,D等位基因地理權(quán)重回歸模型的溫度因子系數(shù)越大,即溫度越高,D等位基因基因頻率越高;濕度越大,D等位基因地理權(quán)重回歸模型的濕度因子系數(shù)越小,即濕度越大,D等位基因基因頻率越低。并且,溫度因子與ACE基因D等位基因的這種空間依賴關(guān)系與人類走出非洲的遷移路線之間也呈現(xiàn)出明顯的空間依賴關(guān)系。本研究表明①全球地理氣候指標(biāo)可提取2個潛變量因子溫度因子,支配著年均平均大氣氣溫,溫度氣候帶和地理緯度帶這三個變量,溫度因子得分越高,表示溫度越高;濕度因子,支配著年均降雨量和地理氣候帶這兩個變量,濕度因子得分越高,表示濕度越大。通過因子分析,避免了后續(xù)回歸分析中存在的多重共線性問題。②ACE基因D等位基因的地理遺傳梯度以非洲為中心沿人類遷移路線呈現(xiàn)明顯的地理遺傳梯度分布。③綜合氣候潛在因子對ACE基因D等位基因的空間依賴關(guān)系呈現(xiàn)出明顯的空間結(jié)構(gòu)性和空間異質(zhì)性特征,且這種空間依賴關(guān)系與人類走出非洲的遷移路線基本吻合。表明其受到氣候因素的自然選擇作用。④通過本研究證明了ACE基因D等位基因是一個“節(jié)儉”基因,這為“節(jié)儉”學(xué)說提供了新的進(jìn)化生態(tài)學(xué)證據(jù)。本研究的創(chuàng)新點⑴擴(kuò)展了“節(jié)儉”基因概念,認(rèn)為與水鈉平衡調(diào)節(jié)有關(guān)的基因也應(yīng)該作為節(jié)儉基因的很好的候選者。這為從非能量代謝途徑證明“節(jié)儉”基因的存在提供了新思路。⑵采用空間遺傳學(xué)新方法,證明了ACE基因D等位基因是一個“節(jié)儉”基因,這為“節(jié)儉”基因?qū)W說提供了新的進(jìn)化生態(tài)學(xué)證據(jù)。⑶將空間遺傳學(xué)、空間統(tǒng)計學(xué)、空間流行病學(xué)、進(jìn)化生態(tài)學(xué)和氣候?qū)W等學(xué)科的理論方法交叉融合,為探索“節(jié)儉”基因提供了新的進(jìn)化生態(tài)學(xué)分析方法。不足之處對于AGT基因和AT1R基因的研究,因其樣本含量不足和樣本點空間分布不均勻,尚未發(fā)現(xiàn)AGT基因和AT1R基因能夠作為“節(jié)儉”基因的進(jìn)化生態(tài)學(xué)證據(jù)。進(jìn)一步的研究尚需繼續(xù)搜集數(shù)據(jù)并優(yōu)化分布格局,以證明二者是否為“節(jié)儉”基因。
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簡介:研究目的通過對男性原發(fā)不育患者的染色體核型以及Y染色體基因微缺失的分析研究,尋找男性原發(fā)不育的遺傳學(xué)依據(jù),以及中國男性原發(fā)不育患者AZF基因突變的熱點,為臨床進(jìn)行男性不育的診斷、治療以及輔助生殖技術(shù)提供相應(yīng)的理論依據(jù)和技術(shù)支持。方法和材料以2008~2011年于天津市中心婦產(chǎn)科醫(yī)院就診的無精子癥或是少精子癥患者83例為研究對象。所有患者均按照世界衛(wèi)生組織WHO推薦的方法和診斷標(biāo)準(zhǔn)加以確診,并排除內(nèi)分泌失調(diào)、輸精管阻塞、隱睪等因素。對所有研究對象進(jìn)行外周血染色體核型分析,將83例患者分成染色體核型正常組和染色體核型異常組。抽取患者2MLEDTA抗凝外周血,采用酚一氯仿的方法提取DNA并保存于20℃?zhèn)溆?。與大多數(shù)研究通常選用AZF區(qū)612個位點進(jìn)行檢測不同,在本研究中選取15個位點進(jìn)行研究,包括AZFΑ區(qū)的SY82、SY84、SY86,AZFB區(qū)的SY124、SY127、SY128、SY133、SY134、SY143,AZFC區(qū)的SY239、SY242、SY254、SY255,AZFD區(qū)的SY145、SY152。將這15個位點組成4套多重PCR系統(tǒng),分別為系統(tǒng)ⅠSRY、SY254、SY143、SY242、SY255,系統(tǒng)ⅡSRY、SY84、SY239、SY152,系統(tǒng)ⅢSRY、SY86、SY127、SY145、SY124,系統(tǒng)ⅣSRY、SY134、SY82、SY128、SY133。為排除假陽性的結(jié)果,在每套系統(tǒng)中以SRY基因作為內(nèi)對照,同時以空白和健康男性作外對照。結(jié)果1DNA提取的質(zhì)量用酚氯仿的方法提取所有研究對象的外周血DNA,DNA的濃度在4461NGΜL~1612NGΜL962±86NGΜL,A260280在165~185之間。213例異常染色體核型分析在83例患者中有13例患者存在染色體核型的異常,其中7例為無精子癥患者,核型分別為3例47,XXY;1例45,XY,ROB13;21P10;Q10;1例45,XY,ROB14;15DELYPTER→Q112;1例48,XXYY;1例46,XY,INV9P11Q12,21PSS,15P。6例為少精子癥患者,核型分別為2例47,XXY;1例46,XY,DELYQ1123;1例46,XY,T622Q15;P11;1例46,XY,T15,22Q112,Q112;還有1例患者染色體核型為46,XY,T4;18Q35;Q112。3微缺失發(fā)生的區(qū)域在染色體核型正常的70例無精子癥及少精子癥患者中共有8例AZF的微缺失,總?cè)笔蕿?14%870。其中無精子癥患者共32例,有4例有AZF的微缺失,缺失率為125%432;少精子癥患者共38例,有4例有AZF微缺失,缺失率為105%438。在有AZF微缺失的8例患者中,5例有AZFC的微缺失,4例有AZFB的微缺失,3例有AZFΑ的微缺失,1例有AZFD的微缺失。4染色體正?;颊呶⑷笔Оl(fā)生的位點8例有微缺失的病例中包含了14個位點的缺失,其中1例是AZFBAZFCAZFD的微缺失,缺失位點包括SY124、SY127、SY128、SY133、SY134、SY143、SY145、SY152、SY239、SY242、SY254、SY255,占缺失病例的125%18;1例是AZFB4ZFC的微缺失,缺失位點為SY254、SY134,占缺失病例的125%18;1例是AZFΑAZFBAZFC的微缺失,缺失位點為SY254、SY134、SY82,占缺失病例的125%18;2例是AZFΑ的微缺失,缺失位點為SY84,占缺失病例的250%28;1例是AZFB的微缺失,缺失位點為SY127,占缺失病例的125%18;2例是AZFC的微缺失,缺失位點為SY254,占缺失病例的250%28。在8例AZF微缺失的患者中未檢測到SY86的缺失。5對1例46,XY,YQH的檢測該患者的染色體核型為46,XY,DELYQ1123,臨床表現(xiàn)為少精子癥,通過Y染色體基因微缺失的檢測發(fā)現(xiàn)該患者存在SY254AZFC和SY134AZFB的缺失。結(jié)論1染色體異常是引起男性原發(fā)不育的一個重要因素,對不育男性常規(guī)進(jìn)行外周血染色體核型分析既可以幫助病人尋找不育的遺傳因素,也可以減少患者將變異染色體傳給后代的幾率,降低染色體異?;純撼錾臋C(jī)率。2在本研究中男性原發(fā)性無精子癥和少精子癥的患者中AZF基因微缺失率高達(dá)114%,說明對于此類患者特別是尋求輔助生殖技術(shù)的患者應(yīng)常規(guī)做Y染色體基因微缺失的檢測;同時也說明本研究選取的15個STSS位點涵蓋了中國人群Y染色體微缺失的熱點,可以作為基因檢測的靶位點。3對有遺傳病家族史的人群,在懷孕前應(yīng)進(jìn)行產(chǎn)前咨詢,在懷孕期間應(yīng)根據(jù)個人情況進(jìn)行絨毛或羊水的產(chǎn)前染色體及基因診斷,降低遺傳病患兒出生的機(jī)率。
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