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1、中國農(nóng)業(yè)科學院博士后學位論文豬骨骼肌LongSAGE文庫生物信息學分析及MMPs、RBPs家族相關(guān)基因初步研究姓名:唐中林申請學位級別:博士后專業(yè):動物遺傳育種與繁殖指導(dǎo)教師:李奎20080501AbstractGeneticimprovmentofmeatproductiontraitsisalwaysresearchhotspotinthefieldofanimalgeneticandbreedingItiscriticaltoun
2、coverthemechanismofthemeatproductiontraitsformolecularlypigdesignbreedingTherearesignificantdifferencesinmeatproductiontraitbetweenindigenousChineseandexoticbreedpigsThedevelopmentofprenatalskeletalmusclegeneticlydetermi
3、nedpostnatalperformanceInthisstudywewouldtrytounderstandthemolecularmechanismofthedifferenceinthemeatproductionbetweenTongcheng(indigenousChinesetype)andLandrace(exoticleantype)throughtranscriptomeanalysisofprenatalskele
4、talmuscleusingLongSAGEmethodManygenesofdifferentexpressionwereidentifiedinaboveexperiment。andseveralgenesfromMMPsandRBPsfamilieswereselectedtofurtherinvestigateItisaimtounderstanditsstructurebiologicalfunctionandrelation
5、shipbetweengeneandtraitsThesestudieswerehelpfultounpuzzlethemechanismofthemeatproductiontrait,andsupplythebiomarkerformarkerassistantselection(MAS)inpigbreedingSolutionspresentedinthisthesiscanbesummarizedasfollows:1Ther
6、eweresignificantdifierencesingeneexpressionphenotypeofprenatalskeletalmusclebetweenTongchengandLandracepigs2AslowermusclegrowthrateandmorecomplicatedmolecularchangeswerefoundinTongchengpigs3Genesresponsibleforincreasedce
7、lluargrowthandmyoblastSHrVivalwereupregulatedinLandracepigs4MMP19andMMP23genesweremappingtochromosomeSsc5andSSC8,therehighexpressioninliverandheartofadultpig,respectivelySMMP19andMMP23geneswereup—regulatedduringprenata、s
8、keletalmuscledevelopmentinbothTongchengandLandrace,andtherewerehigherexpressioninTongchengthanLandrace6TheSNP(203bpsite)atfifthextronofI徹ZP19genewassignificantlyassociatedwitheyemusclearea俾005),theSNP(150bpstie)atfourthe
9、xtronwassignificantlyassociatedwithbackfat『thicknesslattheloin(PO05)7SevengenesinRBPsfamilywereclonedmappedtochromosomeThetemporalandspatialexpression,SNPandcorrelationshipbetweengeneandtraitswereanalyzedinthisstudyKeywo
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