梅花bZIP基因家族生物信息學鑒定及表達分析.pdf

1、分類號：單位代碼：10364密級：學號：13720106安徽農(nóng)業(yè)大學安徽農(nóng)業(yè)大學學位論文梅花bZIP基因家族生物信息學鑒定及表達分析BioinfmaticsExpressionAnalysisoftheBasicLeucineZipperGeneFamilyinPlum研究生：嚴松濤指導(dǎo)教師：王冬良副教授申請學位門類級別：碩士專業(yè)名稱：園林植物與觀賞園藝研究方向：園林植物應(yīng)用所在學院：林學與園林學院答辯委員會主席：年月日摘要梅花（Pru

2、nusmume）作為中國傳統(tǒng)名花之一，它與蘭、竹、菊并稱為四君子，又與松、竹一起被稱為歲寒三友。梅花基因組序列的發(fā)布為在基因組水平上鑒定梅花的優(yōu)良觀賞性狀、抗逆相關(guān)基因提供了重要資料。在各種植物的生理抗性過程中bZIP轉(zhuǎn)錄因子都有比較廣泛的參與。迄今為止，雖然在很多植物中關(guān)于bZIP轉(zhuǎn)錄因子已有很多的研究報道，但是在梅花中關(guān)于bZIP基因暫時并無研究，所以在我們針對梅花進行相關(guān)生物信息學研究，探究bZIP轉(zhuǎn)錄因子的生物信息學功能，具有非

3、常大的研究意義。在研究中通過生物信息學分析鑒定出梅花基因組中的bZIP家族基因，通過進化樹分析、染色體定位分析、MEME蛋白基序分析、外顯子內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析等生物信息學分析方法來預(yù)測了梅花bZIP基因家族的進化和功能；通過熒光定量PCR表達量的分析研究在非生物、激素處理下梅花bZIP基因的表達狀態(tài)，同時克隆梅花相關(guān)的抗逆基因。獲得的主要結(jié)果如下：1、在已知的梅花基因組中通過生物信息學分析、比對，利用Pfam在線工具驗證，最終獲得37個梅花

4、bZIP基因，根據(jù)在染色體定位的結(jié)果分別將37個bZIP基因命名為PmbZIP1到PmbZIP37，氨基酸長度在117到1382之間分布，平均長度為415個氨基酸。2、通過得到的梅花和擬南芥bZIP基因家族基因的氨基酸序列進行重組建樹，根據(jù)拓撲學和聚類情況，將梅花bZIP基因劃分為10個亞族。3、通過對梅花bZIP基因生物信息學的各種分析結(jié)果如：進化樹分析、外顯子內(nèi)含子分析等表明梅花bZIP聚類在相同結(jié)構(gòu)中表現(xiàn)的更近一些，同時也表明在進

5、化過程中梅花bZIP基因家族比較保守。4、為了獲得bZIP蛋白我們通過MEME在線網(wǎng)站，對其進行保守基序分析。分析的結(jié)果表明在PmbZIP基因中可以找到多個保守基序，在同一類型中，bZIP基因在基序類型和基序數(shù)目上表現(xiàn)出一定的相似性。同時，1、2、3、4和6號保守基序被鑒定為PmbZIP蛋白核心序列，這些序列廣泛的分布于梅花bZIP基因家族中。5、梅花bZIP基因在非生物、外源激素處理表達下的結(jié)果顯示梅花bZIP基因在高鹽、干旱處理下有