番茄GRAS基因家族生物信息學(xué)分析及部分抗性相關(guān)基因鑒定分析.pdf

1、GRAS轉(zhuǎn)錄因子是植物中特有的，已有研究表明GRAS轉(zhuǎn)錄因子參與包括草本植物、木本植物、水生植物在內(nèi)的多種植物的復(fù)雜生物學(xué)過程，尤其與植物逆境脅迫應(yīng)答調(diào)控關(guān)系密切，該基因家族的研究目前多集中在模式植物擬南芥中，在番茄中的相關(guān)研究較少。本研究利用生物信息學(xué)方法和軟件，對番茄基因組中GRAS家族成員進(jìn)行全面鑒定挖掘，并對該家族進(jìn)行了系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析，同時對部分家族成員進(jìn)行了組織特異性及逆境脅迫下的表達(dá)模式分析，為該家族基因的深入研究奠定

2、基礎(chǔ)。
　　研究結(jié)果表明:
　　1.番茄基因組共編碼53條GRAS轉(zhuǎn)錄子基因，并且被定位到12條染色體上，系統(tǒng)進(jìn)化分析得到GRAS基因家族可被劃分為八個亞族，分別為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ，染色體定位分析顯示GRAS基因在12條染色體中呈不均勻分布。且并不是所有的GRAS基因家族的蛋白序列都是高度保守的，保守元件分析表明部分番茄GRAS基因家族成員是高度保守的。
　　2.對部分典型的GRAS基因進(jìn)行組織特異性表達(dá)

3、模式分析，結(jié)果表明，這些基因在番茄的不同組織器官中均有表達(dá)，但總體上，根中相對表達(dá)量較高，莖和果中相對表達(dá)量較低。
　　3.在逆境脅迫應(yīng)答分析中所選的12條基因在不同的逆境脅迫誘導(dǎo)下，表達(dá)量均有不同程度的增加，其中GRAS家族成員SLGRAS43的表達(dá)量提高最為顯著。
　　4.成功構(gòu)建了pTRV-SLGRAS43沉默載體并轉(zhuǎn)化至番茄植株體內(nèi)，獲得SLGRAS43基因沉默植株，對基因沉默植株進(jìn)行抗性相關(guān)生理指標(biāo)檢測，結(jié)果表明: