胃癌易感基因以及預(yù)后相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析.pdf

1、渺型炒必必 Y 3 2 7 8 2 0 8多之京倆和嚼學(xué)院中國醬髫針芬豫碩士研究生學(xué)位論文北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院研究生院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文目錄中文摘要?????????????????????????????????。1A b s t r a c t ?????????????????????????????????????????．3第一部分；前言????????????????????????????51 胃癌概述?????????

2、???????????????????????。51 ．1 胃癌的發(fā)病原因及早期癥狀????????????????????51 ．2 胃癌的分型及預(yù)后??????????????????????????52 癌癥基因組變異概述???????????????????????????62 ．1 胃癌遺傳因素的研究進展?????????????????????72 ．2 胃癌預(yù)后相關(guān)基因研究進展????????????????????83d

3、 、結(jié)?????????????????????????????????????????????．．8第二部分：胃癌遺傳性基因突變的研究????????????????91 數(shù)據(jù)概覽?????????????????????????????????．91 ．1 癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)集??????????????????????91 ．2 E B I 中國人胃癌測序數(shù)據(jù)??????????????????????1 11 ．3 千人基因組對

4、照人群突變數(shù)據(jù)?????????????????．1 11 ．4 8 5 5 4 個非癌癥患者對照人群的突變數(shù)據(jù)????????????????1 22 分析方法?????????????????????????????????．1 22 ．1 軟件及版本列表????????????????????????1 22 ．2 分析所需參考文件列表????????????????????．1 22 ．3 序列比對及突變識別??????????

5、????????????～1 32 ．2 樣本過濾???????????????????????????．1 92 ．3 突變篩選??????????????????????????．??????1 92 ．5 突變統(tǒng)計??????????????????????????????2 02 ．6 T C G A 突變數(shù)據(jù)的L O H 分析??????????????????????．．2 02 ．7 K E G G 通路富集分析?????