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文檔簡介
1、目的:本研究通過鑒定與不同分化程度人胃癌細(xì)胞株密切相關(guān)的miRNA,探討了胃癌可能的發(fā)病機(jī)制;并初步分析絲裂霉素(MMC)對(duì)胃癌細(xì)胞miRNA表達(dá)譜的影響,為進(jìn)一步探討MMC治療胃癌的分子機(jī)制奠定一定的理論基礎(chǔ)。
方法:體外培養(yǎng)中分化人胃癌細(xì)胞株SGC-7901、低分化人胃癌細(xì)胞株MKN-45及正常胃粘膜上皮細(xì)胞GES-1,使用MTT法檢測SGC-7901增殖情況,根據(jù)MTT的結(jié)果計(jì)算出MMC的IC50濃度來干預(yù)SGC-790
2、1;提取各樣本總RNA,并驗(yàn)證RNA質(zhì)量,利用miRNA芯片技術(shù),分別檢測分析SGC-7901,MKN-45差異表達(dá)的miRNA,及用藥物干預(yù)后SGC-7901差異表達(dá)的miRNA;采用實(shí)時(shí)定量RT-PCR對(duì)部分miRNA進(jìn)行驗(yàn)證;運(yùn)用DIANAmT,miRanda,miRDB,miRWalk,PICTAR4,PITA,RNA22,RNAhybrid及Targetscan軟件預(yù)測miRNA-498可能調(diào)控的靶基因。
結(jié)果:1.
3、與正常胃粘膜細(xì)胞GES-1相比,胃癌細(xì)胞株SGC-7901及MKN-45中有119個(gè)miRNA存在兩倍及以上差異表達(dá),其中SGC-7901有30個(gè)miRNA表達(dá)上調(diào),25個(gè)miRNA表達(dá)下調(diào);MKN-45有58個(gè)miRNA表達(dá)上調(diào),33個(gè)miRNA表達(dá)下調(diào);MKN-45與SGC-7901的miRNA表達(dá)譜有明顯差異。2.MMC與SGC-7901細(xì)胞生長抑制率之間有濃度依賴關(guān)系,MMC48h的IC50為1.33μmol/L;MMC的IC5
4、0干預(yù)48h后的SGC-7901細(xì)胞與干預(yù)前SGC-7901細(xì)胞比較,存在60個(gè)差異表達(dá)的miRNA,其中miR-498、miR-1247等11個(gè)miRNA的表達(dá)明顯上調(diào),而在胃癌中的表達(dá)明顯下調(diào),另外miR-205*,miR-39242個(gè)明顯下調(diào)的miRNA,在胃癌中的表達(dá)卻是明顯上調(diào)的。3.選取miR-33b,miR-498,miR-7,miR-185,miR-3924進(jìn)行實(shí)時(shí)定量RT-PCR驗(yàn)證,其結(jié)果與芯片結(jié)果一致,證明miRN
5、A芯片結(jié)果可靠。4.DIANAmT,miRanda,miRDB,miRWalk,PICTAR4,PITA,RNA22,RNAhybrid和Targetscan軟件分析顯示癌基因MDTH為miR-498的靶基因之一。
結(jié)論:1.胃癌細(xì)胞中存在差異表達(dá)的miRNA,且分化程度不同的胃癌細(xì)胞中亦存在差異表達(dá)的miRNA;2.MMC可以改變SGC-7901細(xì)胞中部分miRNA的表達(dá)水平;3.MMC對(duì)包括miR-498在內(nèi)的這些miRN
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