星星草GAPDH和OPDR基因的克隆與表達分析.pdf

1、星星草(Puccinellia tenuiflora)作為一種生長在北方地區(qū)的禾本科牧草,具有較強的耐鹽堿性。在分子水平研究鹽堿脅迫下星星草的耐鹽堿基因和相關(guān)的抗逆機制對提高植物耐鹽性、提高鹽堿土壤利用率具有重要的意義。前期試驗采用芯片雜交技術(shù)從星星草中篩選出了一批在鹽堿脅迫下高豐度表達的基因,其中包括代謝過程中的關(guān)鍵酶GAPDH和OPDR。本試驗主要是通過星星草抑制性消減雜交文庫(suppressionsubtractive hybr

2、idization library,SSH)中GAPDH和OPDR的基因片段,對其進行全長的克隆。并利用生物信息學手段分析其基因序列、蛋白序列并構(gòu)建基因的系統(tǒng)進化樹。同時研究在不同Na2CO3脅迫下這兩個基因的表達變化情況,為進一步研究星星草耐鹽堿機理奠定一定的基礎(chǔ)。本研究的結(jié)果如下:
　　 (1)以耐鹽堿植物星星草為試材,構(gòu)建星星草RACE cDNA文庫。然后采用RACE技術(shù)從星星草中克隆出GAPDH和OPDR這兩個基因的全長

3、序列。
　　 (2)通過克隆獲得的GAPDH和OPDR基因全長分別為1030 bp和978 bp,然后對這兩個基因進行生物信息學分析得知:GAPDH和OPDR基因的開放閱讀框內(nèi)可分別編碼含339和326個氨基酸的多肽鏈。GAPDH蛋白含有兩個保守區(qū)它們分別屬于Gp dh C superfamily和Gp dh N superfamily。經(jīng)Blast分析得知:GAPDH基因與高羊茅,大麥中該基因同源性高達97％;OPDR基因與日