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1、根據(jù)GenBank中已經(jīng)發(fā)表的羊傳染性膿皰病毒毒株NZ2株的VIR基因序列,設(shè)計合成1對引物。采用PCR技術(shù)對內(nèi)蒙古分離株OV/nm-05的VIR基因進行特異性擴增,然后將其克隆到pEASY-T1載體中。將經(jīng)過PCR鑒定和酶切鑒定后的陽性重組質(zhì)粒進行測序,得到大小為779bp的核苷酸片段,其中完整的VIR基因長為552bp。序列分析表明,OV/nm-05株與1710/03株同源性最高,達98.0%,與513/04株的同源性最低,為95.
2、4%,與其他8株參考毒株的同源性都在95.5%以上,說明羊傳染性膿皰病毒各株之間VIR基因的差異不大。
用上述引物進行PCR退火溫度的優(yōu)化。采用該PCR方法對OV/nm-05株、犢牛睪丸細胞和山羊痘病毒GVX/nm株的DNA進行PCR擴增,結(jié)果只有OV/nm-05株能擴增出相應(yīng)的片段,其余均為陰性,說明該PCR反應(yīng)體系具有良好的特異性;對OV/nm-05株的DNA模板10倍梯度稀釋后進行PCR擴增,結(jié)果最低可檢測出38pg的模
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