CpG島甲基化表型結(jié)直腸癌新標記物及臨床病理特征研究.pdf

1、目的:CpG島甲基化表型(OMP)是一種特殊的結(jié)直腸癌亞型，其特征在于基因啟動子中的CpG島大量甲基化，導致一些腫瘤抑制基因或腫瘤相關(guān)的基因失活。CIMP被發(fā)現(xiàn)與多種不同的臨床和分子特征有關(guān)，比如對5-FU和西妥昔單敏感性低，患者預后更差等。然而，迄今CIMP結(jié)直腸癌的臨床和分子特征之間仍然存在爭議。造成這種爭議的原因包括:研究人群的種族差異、病例對照選擇標準，用于定義CIMP甲基化表型的基因marker不同，和DNA甲基化檢測的方法不

2、同。尋找新的CIMP marker和更為靈敏的檢測方法是研究和評估CIMP腫瘤的主要挑戰(zhàn)。本研究選擇了5個新的基因SHISA3，STC2，TMEM200B，CTSL1和LRIF1，從散發(fā)性結(jié)直腸癌中篩選和鑒定CpG島甲基化表型。
　　方法:我們前期利用MBP沉淀測序的方法，比較了3對普通結(jié)直腸癌和正常對照，3對CIMP（利用經(jīng)典的CIMP marker）的DNA甲基化譜，最終選擇了5個僅在CIMP腫瘤中甲基化的基因作為標記分子，S

3、HISA3，STC2，TMEM200B，CTSL1 LRIF1。分別收集216對結(jié)直腸癌和正常對照組織，抽提DNA后進行重亞硫酸鹽處理，分別檢測新的5對分子marker SHISA3，STC2，TMEM200B，CTSL1 LRIF1和經(jīng)典的分子marker CACNA1G，IGF2，NEUROG1，RUNX3，SOCS1的甲基化情況。為了更準確地量化甲基化，我們使用數(shù)字PCR(ddPCR)新技術(shù)來檢測甲基化情況。
　　結(jié)果:在我

4、們分析的216個腫瘤，我們選擇新的基因SHISA3，STC2，TMEM200B，CTSL1 LRIF1敏感性，特異性，PPV和NPV分別是80％，95.3％，85.7％和93.2％，比之前驗證5個經(jīng)典的基因CACNA1G，IGF2，NEUROG1，RUNX3，SOCS1有更高的敏感性和特異性;CIMP腫瘤中BRAF突變更為常見，但K-RAS突變低于非CIMP腫瘤。CIMP生存率顯著低于非CIMP腫瘤。
　　結(jié)論:新CIMP基因組合