豬SLA抗原遞呈相關(guān)新基因的克隆及功能分析.pdf

1、四川I農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文豬SLA抗原遞呈相關(guān)新基因的克隆及功能分析指導(dǎo)教師學(xué)科專業(yè)研究方向李波奎堂篚—j蛀虹墮址壅些盤赴至坐副亟氌i監(jiān)山整堂堇壟堂睦2鹽物監(jiān)籃篚匝邀盆王遺掛皇啦毖直煎2006年5月推測編碼219個氨基酸。為了驗證電子克隆序列的正確性，在其起始密碼子區(qū)域和終止密碼區(qū)域設(shè)計特異引物，經(jīng)RTPCR進行克隆、序列分析驗證，結(jié)果表明與電子克隆序列完全一致(GenBank登錄號為DQ333333)。通過序列同源比對及系統(tǒng)發(fā)育進化分

2、析，發(fā)現(xiàn)克隆到的序列與其他物種LMP2基因具有很高的同源性。應(yīng)用生物信息學(xué)的方法對LMP2基因編碼氨基酸進行蛋白質(zhì)基本性質(zhì)、結(jié)構(gòu)及功能預(yù)測，結(jié)果顯示該分子不具備信號肽特征和跨膜結(jié)構(gòu)，功能預(yù)測表明它應(yīng)該是20s蛋白酶體中巨大多功能蛋白酶13組分蛋白。對豬LMP2基因第2外顯子進行了LISSSCP多態(tài)性掃描，結(jié)果顯示豬LMP2基因第2外顯子在4個中國小型豬品種中高度保守，未發(fā)現(xiàn)任何多態(tài)。利用LISSSCP技術(shù)對豬LMP2基因第3外顯予進行多