基因1b型慢性丙型肝炎患者抗病毒治療過程中氨基酸序列分析.pdf

1、目的：探討基因1b型慢性丙型肝炎患者氨基酸序列變異與聚乙二醇干擾素α(PEG-IFNα)2a聯(lián)合利巴韋林(RBV)抗病毒治療療效的關(guān)系。
　　方法：回顧性選擇18例應(yīng)用PEG-IFNα2a/RBV抗病毒治療48周的基因1b型慢性丙型肝炎患者(9例為快速應(yīng)答者，9例為無應(yīng)答者)，應(yīng)用RT-PCR法擴(kuò)增接近全長的HCV基因組序列，用克隆測序方法進(jìn)行核苷酸序列測定。通過在多聚蛋白和各個蛋白水平比對兩組序列氨基酸突變數(shù)目及去除T細(xì)胞表位后

2、的氨基酸突變數(shù)目，計(jì)算遺傳距離等方法以比較兩組序列的差別。
　　結(jié)果：抗病毒治療前序列分析未發(fā)現(xiàn)與治療應(yīng)答相關(guān)的單個氨基酸變異，且系統(tǒng)進(jìn)化分析未顯示與應(yīng)答相關(guān)的變異簇集現(xiàn)象。進(jìn)一步比對發(fā)現(xiàn)NS5B區(qū)尤其是拇指區(qū)域的部分氨基酸序列(aa371-458)及NS5A-V3區(qū)(aa384-407)序列變異與PEG-IFNα2a聯(lián)合RBV抗病毒應(yīng)答情況密切相關(guān)(P值分別為0.002和0.029)。NS5B區(qū)氨基酸突變數(shù)目與V3區(qū)氨基酸突變數(shù)

3、目存在正相關(guān)(r=0.568，.P=0.027)。NR組患者抗病毒治療12周后的序列與基線序列相比，Core、NS3、NS4B和NS5B區(qū)域氨基酸突變數(shù)目較抗病毒治療前略有增加，而E1、E2、P7、NS2和NS4A的氨基酸突變數(shù)目在抗病毒治療12周后有所減少，但差別并無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，抗病毒治療后并未發(fā)現(xiàn)與應(yīng)答相關(guān)的單個氨基酸突變。
　　結(jié)論：NS5B區(qū)尤其是拇指區(qū)域的部分氨基酸序列及V3區(qū)序列變異與干擾素療效密切相關(guān)，且NS5B區(qū)氨