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文檔簡介
1、目的:
研究2,2',4,4',5,5'-六氯聯(lián)苯(2,2',4,4',5,5'-hexachlorobiphenyl,PCB153)對人B淋巴母細胞基因表達譜的影響,篩選獲得差異表達基因,并驗證體外篩測獲得的差異表達基因在多氯聯(lián)苯高污染地區(qū)人群外周血中的表達改變。
方法:
采用0(對照)和25、100、200μM的PCB153分別處理人B淋巴母細胞2、24、48 h,收集細胞后提取總RNA。PCB153處
2、理24 h的RNA樣本用Illumina人HT-12 v4全基因組表達譜芯片篩測差異表達基因,并對差異表達基因進行基因GO(geneontology)分類分析。在PCB153處理2、24、48 h樣本中用實時定量PCR對候選差異表達基因進行驗證。
采集32例電子垃圾拆解地居民和48例對照人群外周血樣,提取總RNA,用實時熒光定量PCR檢測候選差異表達基因的表達水平。
結(jié)果:
芯片結(jié)果顯示,各劑量PCB153
3、處理樣本中分別發(fā)現(xiàn)161、191、1006個差異表達基因,三個劑量組重疊差異表達基因數(shù)為15個,其中,上調(diào)基因4個、下調(diào)基因11個。選取6個差異表達基因用定量PCR進行驗證,發(fā)現(xiàn)2個上調(diào)基因(CCDC92和TMEM175)及3個下調(diào)基因(CCL22、STK38L和GZMK)的表達改變與芯片結(jié)果一致。CCDC92、CCL22、GZMK和TMEM175等可影響多種淋巴細胞功能,STK38L可作用于細胞周期和細胞凋亡等,CCL22和MTDH的
4、異常表達則與多種癌癥密切相關(guān)。
拆解地居民CCL22基因的表達水平明顯低于對照組(為對照組的66.7%,P=0.016),而GZMK和MTDH基因的表達水平則顯著高于對照組(為對照組的144.9%、163.3%, P=0.048,0.032)。
結(jié)論:
體外急性染毒PCB153干擾了人B淋巴母細胞某些重要功能基因的表達,芯片篩測和定量PCR驗證均表明,PCB153可致人B淋巴母細胞系CCDC92和TMEM1
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