淋巴瘤寡核苷酸芯片的制備及其在淋巴瘤細胞系基因表達譜研究中的應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究目的:該研究制備了含116條淋巴瘤相關(guān)基因的寡核苷酸芯片,并以此篩選了在Burkitt's淋巴瘤(BL)和皮膚T細胞性淋巴瘤(CTCL)細胞系細胞與正常淋巴細胞間差異表達的基因,并將對其功能進行了初步的生物信息學分析,以期為探討淋巴瘤的發(fā)病機制、篩選和鑒定腫瘤相關(guān)基因、早期診斷和分子分型、發(fā)現(xiàn)和確定治療新途徑等方面提供一些線索和理論依據(jù).研究內(nèi)容:1)淋巴瘤寡核苷酸基因表達譜芯片的制備:以熒光素酶、惡性淋巴瘤相關(guān)基因為研究對象,采用

2、計算機軟件設(shè)計并經(jīng)BLAST分析篩選基因特異寡核苷酸探針,探針長度40nt,GC含量45-55﹪,5'或3'氨基修飾,濃度為0.5ug/μl,質(zhì)控方法采用定量陽性對照結(jié)合定量內(nèi)標的方法對雜交過程和檢測結(jié)果進行監(jiān)測;2)淋巴瘤基因芯片在淋巴瘤細胞系基因表達譜研究中的初步應(yīng)用:用淋巴瘤寡核苷酸基因表達譜芯片對BL(Namalwa、Daudi、Raji)和CTCL(H9、Hut-78)的基因表達譜進行了檢測,并對篩選出的差異表達基因進行初步的

3、生物信息學分析.結(jié)果:該實驗從BL和CTCL細胞系細胞/正常淋巴細胞中成功篩選出16個差異表達的基因.在Burkitt's淋巴瘤細胞中發(fā)現(xiàn)11條差異表達基因(9.48﹪):上調(diào)表達7條,下調(diào)表達4條;在皮膚T淋巴瘤細胞中發(fā)現(xiàn)8條差異表達基因(6.89﹪):上調(diào)表達6條,下調(diào)表達2條.經(jīng)生物信息學初步分析,發(fā)現(xiàn)這些基因與細胞的信號轉(zhuǎn)導、周期調(diào)控及增殖、分化、凋亡調(diào)控等密切相關(guān).結(jié)論:寡核苷酸芯片是一種篩選差異表達基因的有效工具,惡性淋巴瘤

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