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1、背景:艱難梭菌(Clostridium difficile,CD)是革蘭陽(yáng)性、有芽孢的厭氧桿菌,艱難梭菌引起的感染可從輕微腹瀉發(fā)展至偽膜性腸炎甚至死亡[1]。目前認(rèn)為艱難梭菌是抗生素相關(guān)腹瀉的主要致病菌,約占抗生素相關(guān)腹瀉的20%-25%左右。近年來(lái)由于高毒力菌株STl/BI/NAP1/027 CD在美國(guó)和部分歐洲國(guó)家出現(xiàn)爆發(fā)流行,其較高的病死率給艱難梭菌的感染控制帶來(lái)巨大挑戰(zhàn)[2]。全球流行病學(xué)數(shù)據(jù)分析顯示,不同地區(qū)不同時(shí)間艱難梭菌的
2、流行情況和艱難梭菌感染的危險(xiǎn)因素不同。本研究分為兩個(gè)部分:
第一部分:艱難梭菌的臨床和分子流行特征。
目的:研究艱難梭菌上海教學(xué)醫(yī)院不同科室不同時(shí)間的流行傳播及其毒力基因攜帶和耐藥情況,分析艱難梭菌感染病人的臨床信息,從而系統(tǒng)全面地了解上海教學(xué)醫(yī)院艱難梭菌感染現(xiàn)狀。
方法:2014年5月至2015年8月,收集仁濟(jì)醫(yī)院臨床懷疑為CDI的糞便標(biāo)本直接接種在CDIF培養(yǎng)基上進(jìn)行選擇性培養(yǎng),采用API20A板條進(jìn)行
3、鑒定,MALDI-TOF MS進(jìn)行進(jìn)一步確認(rèn)。利用多位點(diǎn)序列分型方法(MLST)調(diào)查艱難梭菌菌株的流行傳播、傳統(tǒng)PCR的方法檢測(cè)艱難梭菌的毒力基因(tcdA、tcdB、ctdA和ctdB)
和瓊脂稀釋法測(cè)定艱難梭菌的藥物敏感性。同時(shí)將ST81型艱難梭菌感染的病人與非ST81型艱難梭菌感染的病人進(jìn)行臨床特征比較,從臨床的角度分析主要流行菌株ST81型艱難梭菌的感染特點(diǎn)。
結(jié)果:⑴從菌株進(jìn)化分析,臨床分離的91株艱難梭菌
4、被分成26STs,多樣性為28.6%(26/91),eBURST分析將其分成7個(gè)cc群(clone complex)。本醫(yī)院主要流行的菌株為ST81型的艱難梭菌,占總數(shù)目的30.8%(28/91),其次為ST2(9,9.9%)、ST54(8,8.8%)和 ST129(8,8.8%)。未分離到美國(guó)和部分歐洲國(guó)家流行的高毒力菌株ST1型(RT027型)和ST11型(RT078型)。⑵排除11株非產(chǎn)毒艱難梭菌,共計(jì)分離出A-B+型的艱難梭菌3
5、0株,主要的ST型為ST81型(93.3%,28/30),其余兩株為ST37型,兩者之間只有一個(gè)管家基因atpA不同,剩余菌株均為A+B+型。所有菌株均未檢出二元毒素。80株產(chǎn)毒株對(duì)克林霉素、莫西沙星和四環(huán)素的耐藥率為56.3%、32.5%和6.3%,有1株對(duì)甲硝唑耐藥,所有菌株均對(duì)氯霉素、氨芐西林、萬(wàn)古霉素和美羅培南敏感。ST81型艱難梭菌與非 ST81型艱難梭菌相比,對(duì)克林霉素耐藥率為分別為71.4%和48.1%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(
6、P=0.03)。ST81型艱難梭菌對(duì)莫西沙星的耐藥率是非ST81型的五倍多(67.9%和13.5%,P<0.01)。5株ST81型艱難梭菌對(duì)四環(huán)素耐藥,而非ST81型艱難梭菌均表現(xiàn)敏感。⑶不同科室內(nèi)檢出的艱難梭菌型別組成不同。ST81、 ST54、ST2和 ST3至少在三個(gè)科室檢出。艱難梭菌主要在消化內(nèi)科和急診內(nèi)科檢出,這兩科室的主要流行菌株均為ST81型艱難梭菌。從時(shí)間上分析,艱難梭菌的檢出率呈現(xiàn)上升趨勢(shì),在2015年5月到6月出現(xiàn)了
7、爆發(fā)流行,隨后在7月份下降,發(fā)現(xiàn)急診分離的ST81型的艱難梭菌是這次流行傳播的主要原因。集中調(diào)查2015年5月到6月ST81型的艱難梭菌的病房分布,發(fā)現(xiàn)15例病人包括8例來(lái)自急診內(nèi)科,剩余7例中4例來(lái)自消化內(nèi)科,1例來(lái)自心內(nèi)科和2例來(lái)自腎內(nèi)科。8例急診病人均去過(guò)急診觀察室,再轉(zhuǎn)移至其病房。7例非急診病人中,有5例有去急診觀察室就醫(yī)經(jīng)歷,剩余2例消化內(nèi)科病人與2例病人有住院時(shí)間交叉。同時(shí)檢測(cè)急診觀察室病房環(huán)境中的艱難梭菌,從廁所中分離出的
8、2株艱難梭菌均為ST81型艱難梭菌,核糖體分型顯示均為同一型別。⑷將25例ST81型艱難梭菌感染的病人和34例非ST81型感染的病人進(jìn)行了臨床信息的比較。ST81型組的病人與非 ST81型組的病人相比,平均年齡較大(68.4±15.7 vs47.0±21.2,P<0.01),且>65歲的病人較多(60.0% vs20.6%,p=0.03)。查爾森共患病合并癥指數(shù)顯示,ST81型組的病人共患基礎(chǔ)疾病比非ST81型組的多(2.8±2.1 v
9、s0.7±1.0,P<0.01),ST81型組中48.0%的病人患有三種或者三種以上的基礎(chǔ)病,而非ST81型組只有2.9%,兩者有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.01)。在性別、住院周期、質(zhì)子泵抑制劑使用、抗生素的使用總數(shù)及種類方面,沒(méi)有表現(xiàn)出明顯不同。為了評(píng)估CDI的嚴(yán)重程度,比較了兩組中發(fā)熱、低白蛋白(<20 g/L)、高白細(xì)胞計(jì)數(shù)(>12×109 cells/L)、糞便中有無(wú)紅白細(xì)胞和糞便隱血。前三項(xiàng)發(fā)熱、血清白蛋白(<20g/L)和白細(xì)胞計(jì)
10、數(shù)(>12×109 cells/L)兩組比較沒(méi)有顯著差別(p=0.07,p=1.00,p=1.00)。但是,ST81型組病人的糞便中檢出白細(xì)胞和隱血的機(jī)率比非ST81組病人例數(shù)少(4% vs24.7%,p=0.03和8% vs47.1%,p<0.01)。
結(jié)論:本醫(yī)院2015年5月-2015年6月發(fā)生了以急診觀察室為中心的ST81型艱難梭菌的流行傳播。ST81型的艱難梭菌不僅檢出數(shù)目最多同時(shí)在多科室檢出,其對(duì)克林霉素、莫西沙星
11、和四環(huán)素的耐藥率均比非ST81型的艱難梭菌高。ST81型的艱難梭菌較非ST81型菌株相比,更易感染基礎(chǔ)病較多的老年患者,但引起的臨床癥狀卻沒(méi)有非ST81型的艱難梭菌嚴(yán)重。應(yīng)密切關(guān)注該型艱難梭菌在本醫(yī)院的克隆傳播,同時(shí)也不能放松對(duì)高毒力菌株ST1型(RT027型)和ST11型(RT078型)的監(jiān)測(cè)。
第二部分:艱難梭菌感染的危險(xiǎn)因素研究。
目的:立足于本院通過(guò)回顧性研究分析艱難梭菌感染的危險(xiǎn)因素,希望在治療基礎(chǔ)疾病時(shí)提
12、前干預(yù),避免危險(xiǎn)因素,從而在源頭上降低艱難梭菌的感染率。
方法:采用1:2的病例對(duì)照研究,入組CDI病人59例,同一住院時(shí)間同一病房的非CDI腹瀉病人作為對(duì)照組,入組118例。通過(guò)回顧電子病歷的方式探究?jī)山M中臨床特征的不同,并尋找潛在的危險(xiǎn)因素。
結(jié)果:CDI組和非 CDI組相比,性別構(gòu)成、基礎(chǔ)疾病、臨床癥狀和實(shí)驗(yàn)室檢查沒(méi)有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,CDI組病人的住院時(shí)間比非CDI組病人住院時(shí)間延長(zhǎng)(26.1±21.2 vs
13、20.8±12.6,p=0.03)。經(jīng)單因素分析,頭孢類抗生素的使用時(shí)間(OR=3.69,95%CI1.22-11.11,p=0.02)、6個(gè)月前有住院史(OR=1.52,95%CI1.09-2.14,p=0.02)和六周前有細(xì)胞毒性藥物史(OR=2.78,95%CI1.31-5.87,p=0.01)是CDI的危險(xiǎn)因素。經(jīng)多因素logistic回歸分析,頭孢類抗生素的使用時(shí)間是CDI的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(OR=5.86,95%CI1.43-2
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