蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜分析的方法學(xué)研究.pdf

1、細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)豐度動(dòng)態(tài)的變化對(duì)生命過程有重要影響。精確的對(duì)生物體蛋白質(zhì)進(jìn)行定量研究，對(duì)于探索以及發(fā)現(xiàn)疾病標(biāo)志物是非常重要的。定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究的最終目的是對(duì)某體系不同狀態(tài)下的所有復(fù)雜蛋白進(jìn)行鑒定和定量，這一方向是當(dāng)前生物科學(xué)領(lǐng)域研究的重要內(nèi)容。
　　目前，研究定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法主要分兩類:一類是無標(biāo)記定量方法，主要是通過比較質(zhì)譜峰的強(qiáng)度和質(zhì)譜分析的次數(shù)，從而實(shí)現(xiàn)分析不同來源的蛋白樣品的量的變化。在本課題中，我們利用Skyline結(jié)

2、合Diffprot軟件對(duì)Waters公司的Q-TOF儀器的MSE數(shù)據(jù)進(jìn)行進(jìn)一步的蛋白質(zhì)組定量分析。通過數(shù)據(jù)分析證明，與商用軟件和手動(dòng)分析方法相比，Skyline軟件的計(jì)算結(jié)果更加可靠省時(shí)，這使得蛋白質(zhì)通過MSE方法進(jìn)行無標(biāo)定量的研究變的更加快速方便;另一類定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法是基于標(biāo)記技術(shù)的定量方法，是用針對(duì)某一類蛋白所具有的特異性化學(xué)探針標(biāo)記目的肽段或蛋白，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)表達(dá)蛋白質(zhì)差異性以及修飾蛋白的差異進(jìn)行精確的定量和進(jìn)一步的分析。在