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文檔簡(jiǎn)介
1、本論文主要針對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)中肽段定量相關(guān)的生物信息學(xué)問(wèn)題進(jìn)行了研究,包括了基于保留時(shí)間的譜圖匹配校正和質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)與蛋白質(zhì)濃度關(guān)系的研究。
1988年,應(yīng)用于生物質(zhì)譜的軟電離技術(shù)發(fā)明。2001年,人類基因組測(cè)序完成。蛋白質(zhì)組學(xué)隨之進(jìn)入了飛速發(fā)展的黃金期。
目前在蛋白質(zhì)組學(xué)的研究中,極大程度上受到了鑒定技術(shù)的限制,尚沒(méi)有合適的方法能夠簡(jiǎn)便地一步實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜蛋白混合的鑒定分析,所以必須把樣品預(yù)處理、分離、鑒定以及數(shù)據(jù)處理等環(huán)
2、節(jié)進(jìn)行整合,綜合分析。
本文的工作領(lǐng)域?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)非標(biāo)記絕對(duì)定量新方法的研究,主要嘗試?yán)帽緦?shí)驗(yàn)室的工作流程與產(chǎn)出數(shù)據(jù),建立一套流程化高效率的定量方法。
第一章,通過(guò)利用譜圖校正提高色譜質(zhì)譜聯(lián)用數(shù)據(jù)的分析效率,為后續(xù)定量方法的研究提供可靠的肽段信息以及整合數(shù)據(jù)。
第二章,通過(guò)發(fā)展新的數(shù)學(xué)公式描述了肽段濃度的對(duì)數(shù)值與質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)的對(duì)數(shù)值在一定數(shù)量級(jí)范圍內(nèi)呈線性關(guān)系,以此來(lái)幫助蛋白質(zhì)定量過(guò)程中的計(jì)算模擬。
3、> 第三章,通過(guò)查閱文獻(xiàn)和借助數(shù)理編程方法,嘗試編寫用于肽段保留時(shí)間預(yù)測(cè)的程序,并應(yīng)用于設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)中的分析和定量。
本文的主要貢獻(xiàn)及創(chuàng)新點(diǎn)在于:充分了解目前通用的蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理流程的現(xiàn)狀與不足,深入理解蛋白質(zhì)定量分析的數(shù)據(jù)處理要求后,改進(jìn)和發(fā)展了新的方案,并熟練使用國(guó)內(nèi)外先進(jìn)軟件,最終從各方面提高了數(shù)據(jù)處理的質(zhì)量;對(duì)肽段濃度與質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)的定量關(guān)系進(jìn)行了分析并提出了新的數(shù)學(xué)公式幫助計(jì)算;編寫的程序能夠在條件實(shí)驗(yàn)中逐漸實(shí)現(xiàn)肽
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