長牡蠣糖原代謝酶基因多態(tài)性與生長及糖原含量相關(guān)性研究.pdf

1、糖原是牡蠣生長和發(fā)育的主要能源物質(zhì)，并且影響長牡蠣貝肉的質(zhì)地和味道。糖原合酶和糖原磷酸化酶是參與糖原代謝的一對關(guān)鍵酶。糖原代謝的短期調(diào)節(jié)主要是通過反饋機(jī)制而進(jìn)行的各種酶的調(diào)控作用，而長期調(diào)節(jié)則是由參與糖原代謝通路編碼酶基因的表達(dá)水平而調(diào)控的。糖原合酶基因和糖原磷酸化酶基因的表達(dá)水平已被發(fā)現(xiàn)與長牡蠣糖原含量在糖原代謝中的季節(jié)性變化相一致，符合牡蠣將糖原作為主要能量物質(zhì)用于配子發(fā)生和性腺成熟過程的自然生理現(xiàn)象。
　　長牡蠣基因組中存在

2、的大量SNPs標(biāo)記為候選基因的多態(tài)性與長牡蠣經(jīng)濟(jì)性狀之間的相關(guān)性研究提供了豐富的材料基礎(chǔ)。單倍型是同一染色體上多個(gè)SNPs位點(diǎn)中核苷酸堿基的線性排列，以其為分子遺傳標(biāo)記進(jìn)行相關(guān)性分析比單個(gè)SNP標(biāo)記更加有效。
　　本研究隨機(jī)選取來自5個(gè)全同胞家系的322個(gè)長牡蠣個(gè)體，以長牡蠣糖原合酶基因（Cg-GYS）和長牡蠣糖原磷酸化酶基因（Cg-GPH）作為糖原代謝相關(guān)性分析的候選基因，將其編碼區(qū)單核苷酸多態(tài)性（SNPs）與生長性狀（包括殼高

3、、殼長、殼寬、總體重以及軟體部重）和糖原含量（％干重）進(jìn)行了相關(guān)性研究。
　　1.長牡蠣糖原合酶基因多態(tài)性與生長及糖原含量相關(guān)性研究
　　在長牡蠣糖原合酶基因的1420bp擴(kuò)增片段中共檢測到41個(gè)SNPs位點(diǎn)，全部位于外顯子編碼區(qū)域，編碼區(qū)SNPs平均密度為1/35bp。6個(gè)編碼區(qū)SNPs位點(diǎn)與糖原含量存在顯著相關(guān)性（P<0.01）。與生長性狀相關(guān)聯(lián)的SNPs由于數(shù)量較少，因此未進(jìn)行后續(xù)單倍型與性狀之間的相關(guān)性分析。通過連鎖

4、不平衡所構(gòu)建的4種SNP單倍型中，長牡蠣糖原合酶基因的H3（GGAATC）單倍型在糖原含量方面顯著低于其他3種SNP單倍型（P<0.05）。其中，具有H2（GAGGAT）單倍型個(gè)體的糖原含量極顯著高于具有H3單倍型個(gè)體的糖原含量（P<0.0001），因此，H2單倍型可能是導(dǎo)致長牡蠣高糖原含量的SNP單倍型。
　　2.長牡蠣糖原磷酸化酶基因多態(tài)性與生長及糖原含量相關(guān)性研究
　　在長牡蠣糖原磷酸化酶基因的1940bp擴(kuò)增片段中共

5、檢測到82個(gè)SNPs位點(diǎn)，其中63個(gè)SNPs位點(diǎn)位于外顯子區(qū)域，1個(gè)SNPs位點(diǎn)位于5'-UTR區(qū)，18個(gè)SNPs位點(diǎn)位于3'-UTR區(qū)，編碼區(qū)SNPs平均密度為1/25bp；5個(gè)SNPs位點(diǎn)與生長性狀存在顯著相關(guān)性（P<0.05），未檢測到與糖原含量相關(guān)SNPs。生長性狀關(guān)聯(lián)SNPs位點(diǎn)構(gòu)建的6個(gè)SNP單倍型中，Cg-GPH基因的H6（CTGAT）單倍型在總體重性狀方面均顯著高于其他5種SNP單倍型（P<0.05），表明H6單倍型可能