肉雞冷應激相關基因的mRNA表達譜分析及差異表達基因的研究.pdf

1、冷應激是高寒地區(qū)的主要應激源，嚴重制約著畜牧業(yè)的發(fā)展。目前，人們普遍從激素水平來研究冷應激對動物的影響，但不同動物或同一動物所處的生長階段不同，激素水平亦不相同，且激素含量容易受到取樣方式、抓捕方式等外界因素的影響。因此，用激素水平作為評價動物受應激的影響，結果并不十分準確。
　　 本試驗選擇48只3周齡的AA肉雞，隨機分為3個處理組和1個對照組，每組設有4個重復。其中，處理組1：降溫幅度為7℃連續(xù)處理6 h；處理組2：降溫幅度

2、為7℃連續(xù)處理3h，處理組3：降溫幅度為5℃連續(xù)處理6h，3個處理組的處理周期為1周。運用高通量測序技術篩選出與肉雞慢性冷應激相關的特異性基因，分析基因功能，并利用熒光定量PCR技術進一步分析，不同冷刺激條件下，冷刺激相關基因在肉雞組織中的表達規(guī)律。研究結果表明：
　　 1)通過Solexa測序，我們得到15779個差異表達的tag，通過與雞的基因組數(shù)據(jù)庫進行比對，具有生物學意義的差異表達基因共有4721個，其中有992個上調(diào)表

3、達，有3088個下調(diào)表達，僅在對照組中表達的基因有469個，僅在試驗組中表達的基因有172個。
　　 2)GO分析結果表明，差異表達基因主要分布于部分細胞、細胞器、突觸以及膜性細胞器等11個細胞組件中；差異表達基因在結合、催化活性、分子傳感器、轉運活性、核酸結合轉錄因子活性等12個分子功能方面顯著富集；這些差異表達基因主要參與細胞過程、發(fā)展過程、生物調(diào)節(jié)及代謝等23個生物過程。
　　 3)Pathway分析結果表明，差異

4、表達基因主要富集在癌癥途徑、MAPK信號通路、氧化磷酸化通路、細胞凋亡通路及PPAR信號通路等39個通路中。
　　 4)冷應激時，處理組1中，心臟和腎臟中HSP70基因的相對表達量顯著高于其它各組織(P<0.05)。處理組2中，腎臟中HSP70基因的相對表達量顯著高于其它各組織(P<0.05)，心臟中HSP70基因的相對表達量顯著高于肝臟、脾臟、肺和十二指腸(P<0.05)。處理組3中，十二指腸中HSP70基因的相對表達量顯著高

5、于其它各組織(P<0.05)。對照組肉雞心臟、肝臟、脾臟和肺中HSP70基因的相對表達量顯著高于所有冷刺激處理組(P<0.05)，降溫5℃處理6 h條件下，肉雞十二指腸中的HSP70基因與對照組相比顯著升高(P<0.05)。當降溫幅度均為7℃，冷刺激持續(xù)時間分別為6 h和3h條件下，HSP70基因在心臟、脾臟、腎臟和十二指腸中的相對表達量呈現(xiàn)增加的趨勢，但肝臟和肺中HSP70基因相對表達量呈現(xiàn)下降趨勢。當冷刺激持續(xù)時間相同時，降溫幅度分

6、別為7℃和5℃條件下，除了心臟和腎臟中HSP70基因相對表達呈現(xiàn)下降的趨勢外，其它各組織中的HSP70基因相對表達量均呈現(xiàn)不同程度的增加。
　　 5)冷應激時，處理組1中，十二指腸Fas基因的相對表達量顯著高于其它組織(P<0.05)。肝臟中Fas基因的相對表達量顯著高于心臟、肺和腎臟(P<0.05)。處理組2中，肺和十二指腸Fas基因的相對表達量顯著高于其它組織(P<0.05)，肝臟中Fas基因的相對表達量顯著高于脾臟(P<0

7、.05)。處理組3中，十二指腸Fas基因的相對表達量顯著高于其它組織(P<0.05)。對照組肉雞心臟、肝臟、脾臟和肺中Fas基因的相對表達量顯著高于所有冷刺激處理組(P<0.05)。當降溫幅度均為7℃時，冷刺激持續(xù)時間分別為6 h和3h條件下，F(xiàn)as基因在心臟、脾臟、肺和腎臟中的相對表達量呈現(xiàn)增加趨勢，肝臟和十二指腸中Fas基因的相對表達量呈現(xiàn)下降趨勢。當冷刺激持續(xù)時間相同時，降溫幅度分別為7℃和5℃條件下，除了肝臟中Fas基因的相對表

8、達量呈現(xiàn)出下降的趨勢外，其它各組織中Fas基因的表達均增加。
　　 6)冷應激時，處理組1中，肝臟中PPAR-α基因的相對表達量顯著高于其它各組織(P<0.05)，心臟和腎臟中PPAR-α基因的相對表達量顯著高于脾臟和肺(P<0.05)。處理組2和3中，肝臟和腎臟中PPAR-α基因的相對表達量顯著高于其它各組織(P<0.05)，心臟和十二指腸中PPAR-α基因的相對表達量顯著高于脾臟和肺(P<0.05)。對照組肉雞肝臟、肺和腎臟

9、中PPAR-α基因的相對表達量顯著高于各冷刺激處理組(P<0.05)。當降溫幅度均為7℃時，冷刺激時間分別為6 h和3h條件下，心臟和肝臟中PPAR-α基因的相對表達量呈現(xiàn)增加的趨勢，脾臟、肺、腎臟和十二指腸中PPAR-α基因的相對表達量呈現(xiàn)下降的趨勢。當冷刺激的持續(xù)時間相同時，降溫幅度分別為7℃和5℃條件下，除了肝臟中PPAR-α基因的相對表達量呈現(xiàn)出增加的趨勢，其它各組織中的PPAR-α基因相對表達量均呈現(xiàn)下降趨勢。