擬南芥和水稻錨蛋白（ANKP）基因家族初步研究.pdf

1、錨蛋白是一類十分重要的結聯蛋白家族，其結構的主要特征是含有數量不一的錨定重復序列模體，主要作用是介導蛋白質與蛋白質的相互作用，廣泛參與細胞生命活動的調節(jié)。本論文在擬南芥和水稻基因組測序工作完成的基礎上，利用生物信息學的方法，鑒定和分析了兩種模式植物基因組的錨定蛋白基因。研究結果如下： 1.鑒定得到108個擬南芥基因組錨定蛋白基因，并根據蛋白質二級結構分析，將它們進行聚類分析，共分成3個大組10個小組。擬南芥基因芯片數據庫的查詢和

2、分析，得到一些植物特有的錨定蛋白基因，主要表現在對植物病原體、逆境、光節(jié)律以及蛋白質合成等方面，但它們的功能需要實驗進一步確定。 2.基于基因芯片的分析結果，選擇10個擬抗病相關基因，在轉錄水平上初步研究了擬南芥擬抗性基因受植物病原體誘導后的表達情況，發(fā)現Atlg10340對鐮刀菌(Fusariumoxysporum)敏感，在其侵染后的第2天出現表達高峰。 3.克隆和初步分析了擬南芥基因Atlg10340，基因表達模式分

3、析表明Atlg10340在除角果外均有表達，亞細胞定位分析發(fā)現Atlg10340定位于質膜上。 4.鑒定得到142個水稻基因組錨蛋白基因，并根據蛋白質二級結構分析，將它們進行聚類分析，共分成3個大組14個小組。并用RT-PCR的方法分析了水稻錨定膜蛋白基因ANKTM的表達模式。 5.比較和分析了擬南芥和水稻基因組的錨蛋白基因。首先，跟動物或其它生物比較，有些錨蛋白基因在各生物體比較保守，這些保守基因可能存在于所有生物中，