擬南芥、水稻和楊樹(shù)ACTIN家族全基因組分析.pdf

1、肌動(dòng)蛋白(ACTIN)家族是一個(gè)在動(dòng)植物中廣泛存在的基因家族。這個(gè)家族成員眾多并且在動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起到十分重要的調(diào)控作用。但目前，這個(gè)家族成員的功能在植物中的研究還比較少。近年來(lái)，擬南芥、水稻和楊樹(shù)的全基因組測(cè)序工作的完成，為從基因組水平研究和比較開(kāi)花植物的ACTIN基因家族提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索和分析，在擬南芥、水稻和楊樹(shù)三種植物基因組中找到了60個(gè)可能的ACTIN基因家族成員。系統(tǒng)發(fā)生分析表明，這些ACTIN基因可

2、以依據(jù)支持度劃分成多個(gè)亞家族。同時(shí)，多項(xiàng)信息學(xué)分析的結(jié)果初步揭示了這個(gè)家族的成員在進(jìn)化和功能上的相關(guān)性。ACTIN家族成員在水稻和擬南芥基因組上的分布和復(fù)制(Duplication)分析也為染色體區(qū)域復(fù)制的理論提供了有力證據(jù)。此外，對(duì)擬南芥、水稻和楊樹(shù)中ACTIN成員所做的系統(tǒng)發(fā)生分析表明，ACTIN基因含有的共同的祖先。這一分析也支持了基因家族進(jìn)化的“發(fā)生和消亡”理論。本研究有助于揭示植物ACTIN基因家族的進(jìn)化歷史，為后續(xù)ACTIN