水稻和擬南芥中堿性-螺旋—環(huán)—螺旋轉(zhuǎn)錄因子家族基因組水平分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文分析了水稻和擬南芥中堿性/螺旋—環(huán)—螺旋轉(zhuǎn)錄因子家族基因組水平。 堿性/螺旋—環(huán)—螺旋(bHLH)轉(zhuǎn)錄因子家族是一個(gè)在動(dòng)植物中廣泛存在的基因家族。這個(gè)家族成員眾多并且在動(dòng)植物的生長發(fā)育過程中也起到十分重要的調(diào)控作用。但目前，這個(gè)家族成員的功能在植物中的研究還比較少。近年來，植物模式生物擬南芥和水稻的全基因組測序工作，為從基因組水平研究和比較開花植物的bHLH基因家族提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。通過數(shù)據(jù)庫搜索和分析，在水稻基因組中找到了

2、165個(gè)可能的bHLH基因家族成員。系統(tǒng)發(fā)生分析表明，這些bHLH基因可以依據(jù)支持度劃分成多個(gè)亞家族。同時(shí)，bHLH轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合DNA活性預(yù)測、bHLH結(jié)構(gòu)域外的保守基序(motif)分析、內(nèi)含子/外顯子保守結(jié)構(gòu)分析等多項(xiàng)信息學(xué)分析的結(jié)果初步揭示了這個(gè)家族的成員在進(jìn)化和功能上的相關(guān)性。bHLH家族成員在水稻和擬南芥基因組上的分布和復(fù)制(duplication)分析也為染色體區(qū)域復(fù)制的理論提供了有力證據(jù)。此外，對擬南芥和水稻中bHLH成員

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