毒力島的分析與研究.pdf

1、毒力島是病原菌的主要元件，病原菌導(dǎo)致疾病是由其上的毒力島引起的，毒力島存在于多種動(dòng)植物病原細(xì)菌中，對(duì)細(xì)菌的毒力變異、遺傳進(jìn)化甚至新病原亞種形成有重要意義。在病原菌基因組中毒力島是一段外源DNA序列，通常毒力島通過(guò)水平轉(zhuǎn)移插入基因組序列中。典型毒力島的結(jié)構(gòu)包含毒力基因、整合酶基因、插入序列、同向重復(fù)序列等。此外，它的G+C含量、密碼子使用與宿主基因組不同。
　　 本文首先從病原菌與相關(guān)疾病、相關(guān)菌株的基因組、毒力島序列、相關(guān)網(wǎng)站和

2、文獻(xiàn)四方面搜集資料建立了毒力島數(shù)據(jù)庫(kù)，并做了毒力島數(shù)據(jù)庫(kù)主頁(yè)界面。接著利用fisher判別分析法對(duì)大腸桿菌CFT073、豬霍亂沙門(mén)氏菌SC-B67、沙門(mén)氏菌CT18、鼠傷寒沙門(mén)氏菌LT2、金黃色葡萄球菌MU50、霍亂弧菌六種病原菌的毒力島進(jìn)行識(shí)別，為了訓(xùn)練識(shí)別算法，將正負(fù)樣本分成十份，取其中九份作為檢驗(yàn)集。訓(xùn)練結(jié)果顯示，霍亂弧菌的識(shí)別率高達(dá)94.1[％]，金黃色葡萄球菌的識(shí)別率達(dá)到84.8[％]，即使是最低的鼠傷寒沙門(mén)氏菌識(shí)別率也達(dá)到了