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文檔簡介
1、作為甜瓜生產與消費大國,我國甜瓜種植面積和產量位于世界第一位,作為重要的水果型蔬菜,選育口感佳,果肉厚以及耐貯運等優(yōu)質性狀的高品質甜瓜品種一直是育種者的工作重點。本研究首先通過觀察甜瓜果皮的顯微結構,了解果皮各部分在發(fā)育過程中的生理變化。再通過高通量測序技術及生物信息學分析手段,在全基因組上開發(fā)多態(tài)性CAPS分子標記,挖掘與甜瓜果皮相關性狀的位點,從兩方面共同揭示影響甜瓜果皮厚度的遺傳機理,為從分子手段選育優(yōu)質甜瓜奠定理論與材料基礎。<
2、br> 本實驗親本材料為差異顯著的厚皮甜瓜伊麗莎白(M4-5)與薄皮甜瓜(M1-15),通過兩親本雜交獲得F1代,F(xiàn)1代自交獲得F2代群體,利用掃描電子顯微鏡對其進行顯微結構觀察,初步探究遺傳規(guī)律。結合高通量測序,開發(fā)CAPS引物,在兩親本間篩選有多態(tài)性的引物,構建甜瓜遺傳連鎖圖譜,對甜瓜果皮相關性狀基因進行定位,同時也對果實相關性狀進行QTL分析,具體結果如下:
1.甜瓜果皮顯微結構觀察
甜瓜果皮分為外果皮,中果
3、皮和內果皮三部分,其中中果皮和內果皮肉質,為食用部分,被稱之為果肉。在外果皮上存在表皮毛和氣孔器,表皮毛隨果實發(fā)育逐漸脫落,并形成脫落傷口,傷口隨時間愈合。食用果皮部分(中果皮和內果皮)為薄壁細胞層,其間貫穿維管束。
通過對比發(fā)現(xiàn),薄皮甜瓜和厚皮甜瓜在外果皮類型上差異顯著,厚皮甜瓜外果皮栓化,為栓化類型,薄皮甜瓜外果皮不栓化,為非栓化類型,但是薄皮甜瓜和厚皮甜瓜外果皮均為一層細胞構成,食用果皮(中果皮和內果皮)也都為薄壁細胞,
4、無明顯差異。
2.果皮及果實相關性狀遺傳分析
果皮相關性狀包括外果皮類型,外果皮厚度,食用果皮厚度,果皮硬度以及裂果。研究發(fā)現(xiàn)外果皮類型為質量性狀,外果皮厚度、食用果皮厚度與果皮硬度為數(shù)量性狀,同時外果皮厚度與外果皮類型高度關聯(lián)。果實相關性狀包括果實形狀、產量、可溶性固形物,研究表明這些與果實相關的性狀均為數(shù)量性狀。通過遺傳分析和相關性研究發(fā)現(xiàn)果皮及果實相關性狀密切相關。
3.遺傳連鎖圖譜的構建
5、通過測序結果,利用生物信息學分析軟件挖掘SNP位點,對M4-5和M1-15兩親本間存在SNP突變位點的序列進行CAPS檢測,共設計CAPS標記523對,篩選出在親本間有多態(tài)性的CAPS標記223對,多態(tài)率43.8%。利用多態(tài)性引物對F2代群體標記,構建了一張?zhí)鸸线z傳連鎖圖譜,該圖譜包含195個標記,12個連鎖群,覆蓋基因組長度1702.55cM,標記間平均距離8.78cM。
4.果皮及果實相關性狀CAPS標記分析
利
6、用IciMapping V3.3軟件進行定位分析,共檢測到關于果皮及果實相關位點40個。其中與果皮相關性狀的位點12個(關于外果皮類型2個,關于外果皮厚度2個,關于食用果皮厚度4個,關于食用果皮硬度1個,關于裂果3個),分布在連鎖群LG3、LG5、LG6、LG7、LG9和LG11。貢獻率介于3.6743%-72.9145%。檢測到關于果實相關位點共計28個,貢獻率介于3.4974%-17.9684%。其中與果實形狀相關的位點共計14個,
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