香豬鼻腔細菌和真菌群落分析.pdf

1、微生態(tài)學的理論與實踐推動著人們對呼吸道中固有微生物群落的研究與認識。上呼吸道的鼻腔黏膜表面和其他與外界相通的黏膜組織一樣，定植著結(jié)構相對穩(wěn)定和組成十分復雜的微生物菌群。鼻腔由于受到組織結(jié)構、生理功能以及外界諸多因素的影響，構成了有別于呼吸道其他部位的獨特生態(tài)環(huán)境。本研究采用PCR-DGGE和Real-time PCR的方法，結(jié)合Quantity one圖象分析軟件對DGGE圖譜進行分析和 UPGMA進行聚類分析，并計算多樣性指數(shù)（香濃指

2、數(shù)、均勻性指數(shù)、豐富度指數(shù)和優(yōu)勢度指數(shù)）。數(shù)據(jù)使用SPSS19.0進行分析來測定群落結(jié)構之間的相關性。得到以下結(jié)果：
　　1.通過DNA酶結(jié)合CTAB法提取DNA更能客觀反映鼻腔黏膜上定植的微生物多樣性的真實情況；
　　2.菌群指紋圖譜中反應了香豬鼻腔內(nèi)微生物菌群的動態(tài)變化情況，不同生長階段的香豬鼻腔真菌、細菌菌群組成穩(wěn)定差異不顯著（P>0.05)，同時感染組與健康組香豬鼻腔內(nèi)真菌和細菌群落組成差異不顯著（P>0.05).<

3、br>　　3．處于微生物定植高峰期的二月齡香豬鼻腔黏膜內(nèi)，細菌群落多樣性指數(shù)明顯高于其它月齡；穩(wěn)定期的五月齡香豬，鼻腔細菌群落多樣性指數(shù)最低；
　　4. DGGE圖譜中檢測到大量未培養(yǎng)真菌和細菌，也檢測到莫拉克斯氏菌屬（Moraxella sp.）、肺炎鏈球菌（Streptococcus pneumoniae）、副豬嗜血桿菌屬(H. parasuis)、金黃色釀膿葡萄球菌屬（Staphylococcus aureus）、流感嗜血桿

4、菌屬（Haemophilus influenza）、白色念珠菌屬（Candida.sp）等常見的條件致病性微生物。
　　5.群落測序結(jié)果中的微生物主要分為六大類：酵母亞門（Saccharomycotina）、子囊菌門（ Ascomycota）、放線菌門（ Actinobacteria）、盤菌亞門（Pezizomycotina）、厚壁菌門（Firmicutes）、變形菌門（Proteobacteria）。
　　6.感染組中香豬