福建地區(qū)水痘—帶狀皰疹病毒臨床分離株基因型分析.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、目的:從福建地區(qū)水痘和帶狀皰疹患者中分離水痘-帶狀皰疹病毒(VZV),鑒別其野毒株或疫苗株屬性,并分析野毒株的基因型。
  方法:1、將病人的水皰液直接接種于單層人胚肺纖維母細(xì)胞系MRC-5細(xì)胞,傳代1~3次。待病毒感染細(xì)胞出現(xiàn)特征性細(xì)胞病變(CPE)后,制備細(xì)胞懸液涂片并以VZV即刻早期蛋白62(IE62)單克隆抗體做免疫組化染色以鑒定VZV臨床分離株。
  2、提取VZV基因組DNA,以高保真PCR擴(kuò)增ORF21、ORF

2、22和ORF62基因片段。分別以限制性?xún)?nèi)切酶Sma、BssH Ⅱ和NaeⅠ酶切ORF62的PCR產(chǎn)物,并與VZV野毒株(pOka)和疫苗株(vOka)ORF62 PCR產(chǎn)物的酶切圖譜比較以鑒別VZV臨床分離株為野毒株或疫苗株。
  3、將ORF21和ORF22的PCR產(chǎn)物測(cè)序后與日本參考株vOka以及基因庫(kù)中Dumas、11.8、DR、CA123等參考株比對(duì)以確定福建地區(qū)VZV野毒株的基因型。
  結(jié)果:
  1、從6

3、9例水痘和帶狀皰疹病人中成功分離44株VZV臨床分離株,分離陽(yáng)性率63.8%。
  2、44株VZV臨床分離株ORF62的PCR產(chǎn)物均不被Sma、BssH Ⅱ或NaeⅠ酶切,酶切圖譜為Sma-BssH Ⅱ-NaeⅠ-,與野毒株pOka一致。
  3、44株VZV臨床分離株ORF21中33725和33728,ORF22中37902、38055、38081和38177等6個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(diǎn)的堿基序列與日本參考株vO

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