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文檔簡介
1、除了豐富蛋白質oleosin,油菜種子油體中還存在有三種微量蛋白質,caleosin,steroleosin和Sop3。編碼兩親性oleosin蛋白的基因已經(jīng)在甘藍型油菜中被分離克隆。本論文應用同源序列克隆法設計同源簡并引物,結合RT-PCR和RACE-PCR等技術首次從甘藍型油菜中成功分離克隆了編碼caleosin蛋白的基因,分析了ealeosin蛋白和caleosin基因的結構特征。從甘藍型油菜各種發(fā)育階段的種子中提取mRNA,用甘
2、藍型油菜caleosin基因特異性探針進行Northern雜交研究了caleosin基因mRNA的表達特征和表達轉錄體帶型。Caleosin基因被成功插入到表達載體pTYB12中,并在大腸桿菌ER2566中完成了原核表達。本論文主要的研究結果如下。 提出了一種從油菜種子中有效地提取高質量總RNA的方法──熱CTAB-LiCL聯(lián)用法。提取的RNA樣品具有較高的純度和完整性。變性膠電泳后為28S和18SrRNA二條完整的帶型,A26
3、0/A280比值在1.8-2.0之間,得率高約為1mg<,(RNA)>/g<,(樣品)>。提取的。RNA完整無降解,并克服了多酚、多糖及次生物質等的干擾,完全適合RT-PCR、全長基因的克隆及Northern Blotting等分子生物學實驗的要求。 甘藍型油菜caleosin基因mRNA序列登陸GenBank,序列號為AY966447。mRNA全長序列為1058bp,包含了完整的開放閱讀框和3’末端Poly(A)尾巴結構。mR
4、NA開放閱讀框區(qū)域為第37位至774位之間的738bp的序列片斷,能夠編碼245個氨基酸殘基的caleosin蛋白。Caleosin基因mRNA序列已經(jīng)達到了3’最末端。但是通過序列分析沒有發(fā)現(xiàn)caleosin基因mRNA序列5’端具有帽子結構。這有兩種可能:一種是5’RACE-PCR并沒有擴增到caleosin基因mRNA序列5’最末端;另一種是甘藍型油菜caleosin基因轉錄mRNA后序列5’端本身就沒有加上帽子結構。 甘
5、藍型油菜caleosin基因組DNA序列長為1676bp,登陸GenBank,序列號為DQ140380。Caleosin基因在基因組序列結構上具有6個外顯子和5個內含子。內含子的剪接符合真核生物內含子剪接的GT/AG規(guī)則:即內含子的5’端總是GT和3’端總是AG。 甘藍型油菜caleosin基因編碼的油體結合蛋白caleosin在GenBank上的序列號為AAY40837。Caleosin蛋白由245個氨基酸殘基組成,包含了20
6、種常見氨基酸,分子量為28.096kD,等電點5.81。蛋白質性質分析表明甘藍型油菜caleosin蛋白為兩性蛋白質,帶電荷氨基酸和疏水性氨基酸的含量比較高且基本相同。親水性圖和二級結構分析表明caleosin蛋白主要可以劃分為三個結構域:由N末端1-16位氨基酸殘基組成的α-螺旋(Alpha helix)和17-61位氨基酸殘基組成的強親水性的隨機卷曲(Random coil)構成的N-末端親水性結構域;由80-120位氨基酸殘基組成
7、的中間疏水性結構域和C-末端親水性結構域。N-末端親水性結構域包含一個潛在的結合Ca<'2+>的EF-手結構。中間疏水性結構域包含有一個潛在的脯氨酸-結(Proline-Knot)模體,在92-114位氨基酸殘基組成的α-螺旋跨膜區(qū)域,推測在caleosin蛋白與單層磷脂層和油體錨定結合上起到重要的作用。 甘藍型油菜胚胎中caleosin基因mRNA的轉錄表達是由胚胎發(fā)育來調控的,具有顯著的“時、空”特性。Northern雜交結
8、果表明caleosin基因在甘藍型油菜花后前20天左右發(fā)育的種子中檢測不到mRNA的表達,直到花后發(fā)育25天左右的種子中才開始有mRNA的表達,并且只有一條mRNA表達帶型?;ê蟀l(fā)育30天左右的種子中caleosin基因mRNA的表達量急劇增加到最高值,之后caleosin基因一直保持著很高的mRNA表達水平。推測甘藍型油菜中caleosin基因在種子胚胎發(fā)育中期開始表達,在種子胚胎發(fā)育后期即種子脫水期高量穩(wěn)定地表達。在油菜種子胚胎發(fā)育
9、期間,caleosin基因mRNA的轉錄表達的時間模式類似于oleosin基因。推測在其它含油植物中油體結合蛋白基因oleosin,caleosin和Sop2轉錄的mRNA的富集時間模式也可能是一致的。 甘藍型油菜caleosin基因在大腸桿菌中成功完成小量誘導表達。優(yōu)化的誘導條件為:在100ml無菌三角瓶中加入50ml含100μg/ml Amp的LB液體培養(yǎng)基,500μl重組表達載體轉化的大腸桿菌ER2566細胞菌液,于37℃
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