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文檔簡介
1、第一部分熒光定量PCR檢測兒童NPA人偏肺病毒方法的建立
目的:觀察比較實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real-time PCR)方法與普通反轉(zhuǎn)錄酶-聚合酶鏈鎖反應(yīng)(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法檢測人偏肺病毒(human Metapneumovirus,hMPV)的特異性、靈敏性,以建立能準(zhǔn)確定量檢測兒童深部鼻咽吸取物(nasopharyngeal a
2、spirate,NPA)hMPV感染的分子生物學(xué)檢測方法。
方法:用DNAstar軟件分析hMPV原型株及亞型的基因片段,找出相對保守的基因位點(diǎn),根據(jù)保守基因位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)出針對hMPV F基因的引物及探針,建立檢測hMPV F基因的Real-time PCR方法,并同時(shí)根據(jù)引物設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)RT-PCR的引物,對兩種方法的特異性、靈敏性、重復(fù)性以及是否實(shí)用于兒童深部鼻咽吸取物hMPV感染的檢測等指標(biāo)進(jìn)行比較評價(jià)。
結(jié)果
3、:Real-time PCR方法能夠特異性的的檢測兒童深部鼻咽吸取物hMPV,并且能進(jìn)行定量分析,定量的敏感度可達(dá)到102拷貝,比較Real-time PCR方法與RT-PCR方法,其檢出率分別為16%及9.8%,相對于Real-time PCR,RT-PCR的靈敏度及特異度分別為31.3%及94.3%。
結(jié)論: Real-time PCR檢測hMPV敏感性明顯高于RT-PCR方法,為臨床開展兒童深部鼻咽吸取物hMPV感染的定
4、量檢測及貴陽地區(qū)hMPV感染流行病學(xué)調(diào)查建立了有效的分子生物學(xué)檢測方法。
第二部分貴陽市500例兒童人偏肺病毒感染特征調(diào)查研究
目的:采用已建立的Real-time PCR方法檢測貴陽地區(qū)兒童急性下呼吸道感染(Acute lower respiratory tract infections,ALRTI)住院患兒人偏肺病毒(human Metapneumovirus,hMPV)感染情況,并對hMPV感染的流行病學(xué)特點(diǎn)和
5、臨床特征進(jìn)行總結(jié)分析。
方法:收集2014年1月~2014年12月全年間500例ALRTI患兒深部鼻咽吸取物(nasopharyngeal aspirate,NPA)和2ml靜脈血標(biāo)本,Real-time PCR方法對NPA進(jìn)行hMPV F基因檢測,陽性標(biāo)本擴(kuò)增產(chǎn)物行核苷酸序列測定,同時(shí)取NPA進(jìn)行細(xì)菌培養(yǎng),并采用間接免疫熒光方法對血標(biāo)本進(jìn)行7種常見呼吸道病毒病原檢測,收集病例臨床資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
結(jié)果:500例N
6、PA標(biāo)本中共檢測到80例實(shí)時(shí)Real-time PCR陽性,陽性率16%,陽性標(biāo)本測序結(jié)果與GeneBank中hMPV同源性達(dá)91%-99%。80例hMPV陽性患兒中,感染年齡0~6歲,其中1歲以下感染率最高,6歲以上合并基礎(chǔ)疾病患兒也易受hMPV感染;hMPV流行特點(diǎn)為全年散發(fā),發(fā)病高峰出現(xiàn)在2/3/5/6/12月;hMPV感染后喘息癥狀發(fā)生率較高;hMPV可協(xié)同感染其它呼吸道病原體,當(dāng)hMPV患兒協(xié)同其他病原感染時(shí),部分病例病情較重
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