雞DNA甲基化組織特異性及親本與子代甲基化差異性研究.pdf

1、本文對雞DNA甲基化組織特異性及親本與子代甲基化差異性進行了研究。結(jié)果如下： (1)為了更準(zhǔn)確靈敏地檢測基因組水平的DNA甲基化狀態(tài)，使用熒光標(biāo)記替代甲基敏感擴增片段多態(tài)性(MSAP)方法中的同位素標(biāo)記，優(yōu)化了實驗條件，建立了熒光標(biāo)記的甲基敏感擴增片段多態(tài)性方法(F-MSAP)。 (2)根據(jù)F-MSAP擴增片段在泳道的出現(xiàn)情況，個體基因組的甲基化模式可分為三類：TypeⅠ，在兩個泳道都出現(xiàn)為非甲基化模式；TypeⅡ，只在

2、MspⅠ泳道出現(xiàn)為全甲基化模式；TypeⅢ，只在HpaⅡ泳道出現(xiàn)為半甲基化模式。 (3)以F-MSAP方法檢測了雞肌肉、心臟、肝臟和腎臟4個不同組織基因組在CCGG位點的甲基化狀態(tài)。肌肉組織的甲基化程度約為29.4％，肝臟組織約為27.2％，心臟組織的約為27.2％，腎臟組織的約為26.1％。 (4)以F-MSAP方法檢測了AA、EE、EA、F1AA、F1EE以及F1AE三個組合基因組CCGG位點的甲基化狀態(tài)以及每個組合

3、中親本與子代的甲基化差異模式。 (5)進一步對三個組合進行比較，研究發(fā)現(xiàn)：AA和EE兩個純種組合的雙親和子代的甲基化水平?jīng)]有差別，而雜種組合EA的F1子代低于兩個親本。 (6)隨機抽取三個組合不同家系的F1代各30個個體，以F-MSAP方法進行檢測。結(jié)果顯示：雜種F1EA基因組的甲基化程度(31.4％)低于純種F1AA(35.7％)和F1EE(32.6％)；在F1EA、F1AA和F1EE基因組中共檢測到537個甲基化多態(tài)

4、位點。 (7)進一步將三個子代在537個位點上的甲基化模式進行比較：雜種與2個純種相比，甲基化程度相同的模式約為65.9％，甲基化程度增強的模式約為4.0％，甲基化程度降低的模式約為30.1％。 (8)在甲基化程度相同的模式中，F(xiàn)1EA與F1AA一致的模式為36.7％，與F1EE一致的模式為63.3％。說明F1EA群體與F1EE群體基因組的甲基化狀態(tài)更為一致。 (9)獲得了15個親本與子代甲基化差異片段，BLAS