莆田黑豬DNA甲基化差異研究.pdf

1、本研究采用MSAP技術(shù)檢測莆田黑豬不同生長發(fā)育階段不同組織基因組甲基化模式，并應(yīng)用 BSP技術(shù)分析莆田黑豬、杜洛克豬及其與莆田黑豬雜種杜莆豬的不同組織H-FABP基因啟動子甲基化狀態(tài)，旨在為地方豬選育和豬脂肪沉積的分子育種研究提供科學(xué)理論依據(jù)。
　　1、采用 MSAP技術(shù)，選擇16對引物組合對莆田黑豬不同生長發(fā)育階段基因組甲基化模式檢測，主要結(jié)果如下：
　?。?）1日齡甲基化水平，一共擴增條帶12324個，其中半甲基化條帶2

2、510個，全甲基化條帶3557個，非甲基化條帶6257個。半甲基化水平中，肝臟的半甲基化水平分別顯著高于心臟、肌肉、尾（P<0.05）。全甲基化水平中，心臟的全甲基化水平顯著高于肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾（P<0.05）?？偧谆交校呐K的總甲基化水平顯著高于肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾（P<0.05）；尾的總甲基化水平分別顯著高于肌肉、脂肪和耳（P<0.05），分別顯著低于心臟和肝臟（P<0.05）。
　　（2）25日齡甲基化水平

3、，一共擴增條帶11505個，其中半甲基化條帶1997個，全甲基化條帶3740個，非甲基化條帶5768個。半甲基化水平中，心臟的半甲基化水平顯著高于肌肉（P<0.05）；肝臟的半甲基化水平顯著低于脂肪（P<0.05）；肌肉的半甲基化水平分別顯著低于心臟、脂肪和耳（P<0.05）。全甲基化水平中，心臟、肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾之間無顯著差異性?？偧谆街?，心臟的總甲基化水平顯著高于肌肉（P<0.05），顯著低于脂肪和耳（P<0.05）；

4、肌肉的總甲基化水平分別顯著低于心臟、脂肪、耳和尾（P<0.05）。
　?。?）210日齡甲基化水平，一共擴增條帶11850個，其中半甲基化條帶2294個，全甲基化條帶2867個，非甲基化條帶6689個。半甲基化水平中，心臟的半甲基化水平顯著低于脂肪、耳和尾（P<0.05）；肝臟的半甲基化水平顯著低于脂肪、耳和尾（P<0.05）；肌肉的半甲基化水平顯著低于脂肪和耳（P<0.05）。全甲基化水平中，心臟、肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾之間無

5、顯著差異性。總甲基化水平中，心臟的總甲基化水平顯著低于尾（P<0.05）；肝臟的總甲基化水平顯著低于脂肪、耳和尾（P<0.05）；肌肉的總甲基化水平顯著低于脂肪和尾。
　　2、莆田黑豬不同生長發(fā)育階段心臟、肝臟、肌肉、脂肪、耳和尾的全甲基化水平都高于半甲基化水平。
　　3、莆田黑豬1日齡、25日齡和210日齡階段平均總甲基化水平分別為50.67％、49.89%、43.55%，其隨著年齡增長而降低。
　　4、莆田黑豬相同

6、生長發(fā)育階段不同性別間半甲基化、全甲基化和總甲基化水平無明顯的差異性，相同性別內(nèi)半甲基化水平都要低于全甲基化，不同生長發(fā)育階段公豬的總甲基化水平都略高于母豬。
　　5、通過BSP法分析得出，莆田黑豬、杜洛克豬和杜莆豬心臟、肌肉和耳的H-FABP基因啟動子甲基化在210日齡階段均展現(xiàn)出較低甲基化水平。
　　6、不同豬種中，心臟、肌肉和耳的H-FABP基因啟動子甲基化水平均無顯著差異性，相同組織在不同豬種中 H-FABP基因啟動