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1、中山大學(xué)碩士學(xué)位論文發(fā)展一種新的LAMP技術(shù)快速檢測(cè)石斑魚(yú)虹彩病毒(SGIV)姓名:毛新亮申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):海洋生物學(xué)指導(dǎo)教師:秦啟偉20070606Developmentofanewmethodofloopmediatedisothermalamplification(LAMPlforra【piddetectionofSingaporegrouperiridovirusfSGIV)廁口r;川小心量bl口,,枷AB:b舳st腳ra
2、c朋t加文矽衙,戶勵(lì)fQ;no;we;,均口r;川擁噸量b1芍,,砌略:舳嘲朋加文P衙’尸勵(lì)A(yù)newmethodofloopmediatedisothermilamplification皿AMP)wasdevelopedforrapidandsensitivedetectionofSingaporegrouperiridovlrus(SGIV)Asetofsixspecificprimerscontaining2loopprimersw
3、agdesignedbytargetingtheSGIVgenomeDNA(ORF:014L),arecombinedplasmidpT014LwhichcouldbeuseduspositivecontrolwasconstructedWithBstDNApolymeraselargefragmentwithin20min,thetargetplasmidcanbeamplifiedat65“CTheLAMPproductswerei
4、dentifiedanddigestedwithMst1SGIVwasabletobedetectedin20minsbyusingasetof6primersThedetectiontimewas40rainsusingasetof4primers,Thedetectionlimitswereabout6~600copiesofSGIVgenomicDNAinthreedifferentjudgingmethods:gelelectr
5、ophomsis,SYBRGreenlstainandwhiteprecipitateofmagnesinmpymphosphateComparedtonestedPCRthedetectionlimitofLAMPis1000foldhigherThemwssnoC105Sreactionsin7otherDNAandRNAvirusesindicativeofgoodspecificityoftheLAMETheLAMPmethod
6、wasappliedtodetectSGIVinvimsinfectedGPcellsandgroupertissuesSGIVcouldbedetectedasearlyas45rainininfectedGPcells,TheLAMPdetectionresultsingroupertissuesindicatedthatspleen,liverkidneyandintestineweminfectedbySGW,andspleen
7、andkidneyweremostseriouslyinfectedLAMPwasalsousedt011101“1itorthetranscfiptionandexpressionofORF:014L,Thetestcanbeeasilyusedunderfieldconditionsbecausetheamplificationisabletocarryoutatacertaintemperatureandtheonlyequipm
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