STAT1、STAT5A基因多態(tài)性與中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀的相關(guān)性研究.pdf

1、本試驗以199頭中國荷斯坦奶牛為研究對象，采用PCR-SSCP的方法，系統(tǒng)的研究了STATl(GeneID：510814)基因內(nèi)含子1，4，10，11，18，19，25及3UTR等十個位點與STAT5A(GeneID：AJ237937)基因外顯子7～12，內(nèi)含子14共17個位點的多態(tài)性，并將其與第一至三個胎次的產(chǎn)奶性狀進行了關(guān)聯(lián)分析。目的在于探索STAT1、STAT5A基因?qū)χ袊伤固鼓膛．a(chǎn)奶性狀的影響，為今后良種奶牛的選育提供一定的理

2、論依據(jù)。研究結(jié)果如下： 在STAT1基因中，在內(nèi)含子11 P1，P2及3UTR 3個位點發(fā)現(xiàn)了多態(tài)性，其余位點在所研究的群體中未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性；在STAT5A基因中，只在內(nèi)含子9和內(nèi)含子14兩處發(fā)現(xiàn)多態(tài)，其余位點均沒有多態(tài)性。各多態(tài)位點的突變情況及不同基因型與產(chǎn)奶性狀的相關(guān)性如下所示： 1.STAT1基因內(nèi)含子11 P1基因多態(tài)性及其與產(chǎn)奶性狀的相關(guān)性 以中國荷斯坦奶牛基因組DNA為模板，用自行設(shè)計的引物P1對STA

3、T1基因的內(nèi)含子11進行PCR擴增，產(chǎn)物長度為369bp。經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳后發(fā)現(xiàn)，該位點存在3種基因型，分別命名為AA，AB，BB;基因型頻率分別為0.442，0.462，0.096。經(jīng)測序發(fā)現(xiàn)，突變產(chǎn)生在28739堿基處，為G轉(zhuǎn)換為A。3種基因型與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析表明：BB基因型個體第一、二胎次乳蛋白率均顯著高于AA型和AB型個體(P<0.05)；3種基因型對各胎次產(chǎn)奶量及乳脂率均沒有顯著影響(P>0.05)，但呈現(xiàn)出BB>AB

4、>AA的趨勢。 2.STAT1基因內(nèi)含子11 P2基因多態(tài)性及其與產(chǎn)奶性狀的相關(guān)性 由引物P2擴增出的片段，經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳分型發(fā)現(xiàn)，在該擴增片段存在三種基因型，分別命名為CC，CD，DD，基因型頻率分別為0.331，0.196，0.473。經(jīng)測序發(fā)現(xiàn)，3種基因型由28873堿基處發(fā)生G顛換為C而產(chǎn)生。3種基因型與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析表明：DD型個體的第三胎次的產(chǎn)奶量顯著高于CC型個體(P<0.05)，DD型個體的第二

5、胎次的乳蛋白率顯著高于CC和CD型個體(P<0.05)，3種基因型對各胎次乳脂率均沒有顯著影響(P>0.05)。 3.STAT1基因3UTR基因多態(tài)性及其與產(chǎn)奶性狀的相關(guān)性 本試驗對3UTR不同位置自行設(shè)計了3對引物，結(jié)果僅在引物1的擴增片段中發(fā)現(xiàn)多態(tài)性。該位點存在3種基因型，分別命名為TT，CT，CC，基因型頻率分別為0.437，0.116，0.447。測序結(jié)果表明，突變發(fā)生在141930堿基處，為C轉(zhuǎn)換T。3種基因型

6、與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析表明：基因型CC，CT個體的第一、二胎次產(chǎn)奶量均顯著高于TT型個體(P<0.05)；CC型個體的第一、三胎次乳蛋白率均顯著高于刀型個體(P<0.05)。三種基因型對三個胎次乳脂率的影響差異均不顯著(P>0.05)，但呈現(xiàn)出CC>CT>TT的趨勢。 4.STATSA基因內(nèi)含子9基因多態(tài)性及其與產(chǎn)奶性狀的相關(guān)性 用自行設(shè)計的引物對STAT5A基因外顯子10進行擴增，經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳分型發(fā)現(xiàn)了三種基因型

7、，分別命名為GG，AA，GA，基因型頻率分別為0.112，0.138，0.75。經(jīng)測序后序列比對發(fā)現(xiàn)，突變產(chǎn)生在內(nèi)含子9，為9501堿基處發(fā)生G轉(zhuǎn)換為A的突變。與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析表明：AA型個體的第三胎次產(chǎn)奶量極顯著高于GA和GG型個體(P<0.01)，GG型個體第二、三胎次乳蛋白率顯著高于AA和GA型個體(P<0.05)；GG，GA型個體第一、三胎次乳脂率顯著高于AA型個體(P<0.05)。 綜上所述，STAT1，STAT5