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文檔簡介
1、目的:通過對一年內復發(fā)和三年內未復發(fā)的胃癌患者進行DNA甲基化芯片篩選,初步篩選出與胃癌復發(fā)相關的DNA甲基化差異表達譜,探討 DGKZ(Diacylglycerol kinasezeta)在胃癌復發(fā)中可能的發(fā)生機制,為進一步研究胃癌復發(fā)以及其他腺癌如肝癌的機制奠定基礎,最終發(fā)現(xiàn)胃癌預后判斷的分子標志物。
方法:⑴對術中取得的胃癌組織進行HE染色,光學顯微鏡下進行病理學驗證。⑵提取胃癌組織的總DNA進行質量控制。⑶應用甲基化芯
2、片技術篩選甲基化程度存在明顯差異的基因。⑷選取DGKZ基因,采用實時熒光定量PCR技術檢測其在胃癌細胞系、肝癌細胞系、正常胃粘膜細胞系及正常肝細胞系中的表達。
結果:①HE(hematoxylin-eosin)結果顯示,5例患者均為胃腺癌。②瓊脂糖凝膠電泳顯示,胃癌組織的總DNA均保持較好的完整性,大小均在4kb以上。③甲基化芯片結果發(fā)現(xiàn),一年內復發(fā)與三年內未復發(fā)胃癌患者的胃癌組織相比,高甲基化的基因包括:MDP1、LGALS
3、8、PRAMEF12、SLC8A2,低甲基化的基因包括:CNNM4、DGKZ、B4GALNT2、HS3ST3B1、FGF2、AGXT、PRSS3(︱△β︱>0.4,p≤0.05)。④與正常胃黏膜細胞系GES-1相比,DGKZ在胃癌細胞系BGC-823顯著高表達(p=0.006)。與正常肝細胞系LO2相比,DGKZ在肝癌細胞系Hep G2正常表達(p=0.072)。
結論:篩選出11個與胃癌復發(fā)相關的甲基化明顯差異的基因,為判斷
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