中國(guó)漢族人群大皰性類(lèi)天皰瘡全基因組關(guān)聯(lián)分析研究.pdf

1、研究背景：大皰性類(lèi)天皰瘡(Bullouspemphigoid,BP)是一種慢性自身免疫性表皮下大皰病。好發(fā)于老年人,兒童罕見(jiàn),臨床表現(xiàn)為皮膚皰壁緊張的漿液性水皰或大皰,尼氏征陰性,多散布在四肢的屈側(cè)、下肢以及腰部等處。BP的發(fā)病率低,歐洲人群BP的年發(fā)病率大約為1/10萬(wàn)-7/10萬(wàn)。在中國(guó)人群中,BP病例約占門(mén)診病例的0.02％左右。在年齡大于80歲的老年人群體中,BP的年發(fā)病率明顯增多,大約為150-330/100萬(wàn)。罹患類(lèi)天皰瘡的

2、1年內(nèi)的死亡率大約為20%-40%,但在中國(guó)人群的死亡率(12%)低于歐洲人群。
　　迄今為止,BP的病因和發(fā)病機(jī)制尚不明確,自身免疫反應(yīng)機(jī)制被認(rèn)為是導(dǎo)致疾病發(fā)生的主要原因,其致病過(guò)程包括補(bǔ)體的激活、炎癥細(xì)胞的聚集、釋放蛋白水解酶以及直接干擾自身抗原的粘附功能等步驟。BP發(fā)病過(guò)程中,體液免疫與細(xì)胞免疫介導(dǎo)過(guò)程皆需要B淋巴細(xì)胞與CD4+Th細(xì)胞的共同參與。自身抗原被抗原遞呈細(xì)胞捕獲、處理,同時(shí)結(jié)合到主要組織相容性復(fù)合體II類(lèi)分子而暴

3、露在細(xì)胞的表面。T細(xì)胞通過(guò)受體介導(dǎo)的識(shí)別抗原,激發(fā)各種細(xì)胞因子的釋放,促進(jìn)B細(xì)胞產(chǎn)生抗體。鑒于這種免疫機(jī)制,HLA基因可能是BP發(fā)病機(jī)制中最重要的遺傳易感性因素。
　　通過(guò)候選基因的方法發(fā)現(xiàn)MHC區(qū)域HLA-II類(lèi)基因,以及非MHC基因與BP的相關(guān)性。在不同地域的高加索人群中,均發(fā)現(xiàn)HLA-DQB1*0301與BP具有顯著相關(guān)性。然而,不同種族和地域的遺傳背景差異可能是造成遺傳異質(zhì)性的主要因素。印度人群同樣發(fā)現(xiàn)HLA-DQB1*0

4、301等位基因與BP相關(guān),但在中國(guó)和日本人群中卻截然不同。其次是從BP可能的發(fā)病機(jī)制中,篩選如COL17A1基因、IGHV基因、以及細(xì)胞因子基因,探討與BP的遺傳易感性。BP可能是一種由多個(gè)因素共同作用而導(dǎo)致的復(fù)雜性疾病。當(dāng)前對(duì)復(fù)雜疾病遺傳學(xué)研究的主要策略包括如連鎖分析研究、功能候選基因關(guān)聯(lián)研究等方法都存在一定的局限性。因此,開(kāi)展BP的GWAS研究,對(duì)BP遺傳學(xué)基礎(chǔ)以及發(fā)病機(jī)制的認(rèn)識(shí)具有重要意義。
　　目的：利用全基因組關(guān)聯(lián)分析研

5、究方法在全基因組范圍內(nèi)搜尋與BP關(guān)聯(lián)的遺傳變異,鑒定出中國(guó)漢族人群BP的易感基因/位點(diǎn);構(gòu)建中國(guó)人群BP病例與對(duì)照的全基因組關(guān)聯(lián)分析數(shù)據(jù)庫(kù)。
　　方法：根據(jù)樣本收集的標(biāo)準(zhǔn),從遺傳資源協(xié)作網(wǎng)醫(yī)院收集BP患者和正常對(duì)照樣本,分成2個(gè)各自獨(dú)立中國(guó)南方人群和北方人群樣本。利用HumanOmniZhongHua-8全基因組SNP分型芯片分別對(duì)來(lái)自中國(guó)北方的91例BP患者和575例正常對(duì)照,以及中國(guó)南方138例BP病例和991例對(duì)照進(jìn)行SNP

6、s分型;對(duì)兩組人群的SNP分型數(shù)據(jù),分別經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)控后進(jìn)行聯(lián)合Meta分析以及單倍型分析。
　　結(jié)果：1)經(jīng)過(guò)多種嚴(yán)格的數(shù)據(jù)質(zhì)控后,本課題組構(gòu)建了中國(guó)漢族北方與南方人群,包括229例BP病例和1566例正常對(duì)照801,392個(gè)常染色體SNPs的大皰性類(lèi)天皰瘡GWAS數(shù)據(jù)庫(kù)。
　　2)通過(guò)對(duì)中國(guó)漢族北方人群和南方人群GWAS數(shù)據(jù)Meta分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)1個(gè)新的易感位點(diǎn)1q43(rs72766895,P=6.38×10-9,OR=

7、3.14)與BP顯著相關(guān);該區(qū)域內(nèi)的PLD5基因在功能學(xué)可能與BP發(fā)病過(guò)程中的發(fā)病機(jī)制相關(guān),提示PLD5基因?yàn)锽P的易感基因。
　　3)發(fā)現(xiàn)2個(gè)與BP相關(guān)聯(lián)的提示易感位點(diǎn),分別位于18q21.31(SNPrs117788424,P=1.38×10-7,OR=2.51)和2p25.3區(qū)域內(nèi)(SNPrs12988270,P=1.96×10-7,OR=2.52),該LD區(qū)域內(nèi)相關(guān)基因的功能學(xué)證據(jù)提示18q21.31和2p25.3為BP的

8、遺傳易感區(qū)域。
　　4)對(duì)既往報(bào)道的HLA基因與BP的相關(guān)性進(jìn)行驗(yàn)證,進(jìn)一步證實(shí)HLA與BP的相關(guān)性,同時(shí)發(fā)現(xiàn)位于HLA-II基因區(qū)域存在風(fēng)險(xiǎn)性的單倍型(P=3.29×10-8,OR=1.92)。
　　結(jié)論：本課題在中國(guó)漢族人群中開(kāi)展BP的GWAS研究,首次在非MHC區(qū)域發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的與疾病相關(guān)易感位點(diǎn),兩個(gè)提示易感位點(diǎn);通過(guò)單倍型分析發(fā)現(xiàn)與BP相關(guān)的HLA-II基因區(qū)域風(fēng)險(xiǎn)性單倍型,并進(jìn)一步證實(shí)HLA與BP的相關(guān)性;首次構(gòu)建