中國漢族人群冠心病和高血壓的全基因組關(guān)聯(lián)分析研究.pdf

1、冠心病（CAD）在全世界內(nèi)十大高致死率復(fù)雜性疾病中占15.3％，排名第二，我國是全世界因冠心病死亡人數(shù)最多的國家之一。2009年中國城市居民冠心病死亡率高于農(nóng)村，男性死亡率高于女性。冠心病是一種復(fù)雜的由環(huán)境因素和遺傳因素共同作用而導(dǎo)致的遺傳病。高血壓是與冠心病腦卒中等心腦血管疾病緊密相關(guān)的危險因素之一，其并發(fā)癥心肌梗死、心力衰竭及慢性腎臟病等，致死率高，給家庭和國家的生命財產(chǎn)安全造成嚴(yán)重威脅和負(fù)擔(dān)。近年來，隨著冠心病和高血壓全基因組關(guān)聯(lián)

2、分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）的大量開展，發(fā)現(xiàn)了一大批與冠心病及高血壓發(fā)生風(fēng)險相關(guān)的區(qū)域，基因和SNP位點(diǎn)，這些工作在很大程度上有助于我們理解冠心病和高血壓分子遺傳機(jī)制。然而目前絕大多數(shù)的冠心病和高血壓，血壓相關(guān)的全基因組關(guān)聯(lián)分析研究是在歐洲人群體中展開的，人種的差異造成研究結(jié)果不能全部在中國人群中得到復(fù)制，因此發(fā)現(xiàn)與中國人群冠心病和高血壓特異性相關(guān)的區(qū)域，基因和位點(diǎn)，便成為我們對冠心病和高

3、血壓疾病分子的遺傳學(xué)研究重點(diǎn)之一。本研究分別通過冠心病全基因組關(guān)聯(lián)分析研究和高血壓全基因關(guān)聯(lián)分析研究，來尋找與中國漢族人群冠心病和高血壓相關(guān)聯(lián)的遺傳位點(diǎn)和區(qū)域，從而更好的了解心腦血管疾病的致病基因，發(fā)病機(jī)理。
　　中國漢族群體冠心病的全基因關(guān)聯(lián)分析研究
　　中國漢族冠心病的 GWAS研究中使用的樣本來本中心建立的GeneID樣本庫，實(shí)驗(yàn)設(shè)計包括了診斷為冠心病的病人共6,572例以及非冠心病個體5,115例，一個由三階段五個獨(dú)

4、立樣本群體的GWAS組成了本課題。第一階段包含兩個發(fā)現(xiàn)群體（來自北京的Dis-Beijing,130cases vs130controls和來自湖北的Dis-Hubei,100cases vs100controls），采用Affymetrix公司生產(chǎn)的SNP5.0 Array基因芯片對全基因組上的447,094個SNPs進(jìn)行分析。第二階段采用Taqman基因分型技術(shù)對兩個群體中風(fēng)險等位基因一致并且P值均小于0.05且的5單核苷酸多態(tài)性S

5、NPs位點(diǎn)進(jìn)行分析，這個階段驗(yàn)證群體包含了479例冠心病病人以及480例非冠心病患者。第二階段驗(yàn)證后仍然顯著的位點(diǎn)進(jìn)入第三階段（Rep-Hubei,3,004cases vs2,100controls；Rep-Shandong，2,859冠心病患者以及2,305例正常對照;），通過第三階段多個群體的基因分型，找到了與冠心病發(fā)病相關(guān)的兩個區(qū)域6p21.32（rs6936204）和15q15.1（rs2925337）。合并三個階段的五個獨(dú)立

6、群體并校正其它危險因素進(jìn)行后，發(fā)現(xiàn)了兩個分別位于6p21.32和15q15.1區(qū)域的 SNP rs6936204（Padj=5.74×10-10，Odds Ratio=1.26）和rs2925337（Padj=8.71×10-9，Odds Ratio=0.80），中國漢族群體的冠心病GWAS研究結(jié)果提示，冠心病發(fā)病與這兩個SNPs是有顯著相關(guān)性的。
　　中國漢族群體高血壓的全基因關(guān)聯(lián)分析研究
　　本研究從GeneID中國漢族

7、人群心血管遺傳資源庫中，選取了4,680例高血壓患者（cases）和4,296例正常對照（controls），這部分實(shí)驗(yàn)也設(shè)計了多階段的包含有六個獨(dú)立群體的研究方法。在初始研究階段包含了兩個來自不同地區(qū)的發(fā)現(xiàn)群體（Dis-1,266cases vs190controls; Dis-2,87cases vs143controls），分別采用Affymetrix Genome-Wide SNP5.0 Array(351,344 SNPs)和

8、Affymetrix Genome-Wide SNP6.0 Array（686,505 SNPs）進(jìn)行掃描。第二階段應(yīng)用Taqman SNP分型技術(shù)對第二階段驗(yàn)證群體中進(jìn)行分析，篩查那些風(fēng)險等位基因一致并且P值均小于0.02的單核苷酸多態(tài)性性SNPs位點(diǎn)，這個階段的樣本有高血壓患者961例以及非高血壓的正常對照956例進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究。第二階段驗(yàn)證后仍然顯著的位點(diǎn)進(jìn)入第三階段（Rep-Wuhan2,320cases vs1,700contr

9、ols；Rep-Dalian，1,046cases vs1,307contorl;Rep-USA,598cases vs1,192contorl）進(jìn)行驗(yàn)證分析，最終發(fā)現(xiàn)一個SNP與高血壓顯著相關(guān)。合并三個階段中五個來源于中國漢族的獨(dú)立樣本群體并校正其它危險因素進(jìn)行后，發(fā)現(xiàn)了一個SNP-1（Padj=8.47×10-9，Odds Ratio=0.60），與中國漢族群體的高血壓發(fā)病顯著相關(guān)。
　　綜合以上分析，我們在中國漢族人群冠心病

10、的GWAS研究中發(fā)現(xiàn)了兩個與冠心病顯著相關(guān)的位點(diǎn)，其中SNP rs6936204位于一個之前GWAS已經(jīng)報道過與冠心病相關(guān)的基因c6orf10內(nèi)部，而SNP rs2925337位于一個未曾報道過的基因MAPKBP1基因內(nèi)部。MAPKBP1是JNK信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中JNK蛋白激酶的底物結(jié)合蛋白。其究竟以何種方式和途徑參與到冠心病發(fā)病的分子機(jī)制中，這些推測都需要有進(jìn)一步的功能研究去證實(shí)。同樣的，我們也在中國漢族人群高血壓的GWAS研究中發(fā)現(xiàn)了與