鵝等級前卵泡發(fā)育中的基因表達(dá)差異富集AKR1D1基因功能初探.pdf

1、鵝等級前卵泡的生長和發(fā)育直接影響鵝的產(chǎn)蛋性能，鵝在等級前卵泡中有兩個特殊的階段:卵泡的募集階段(small white follicles，SWF，2-4mm)和優(yōu)勢卵泡的篩選階段(smallyellow follicles，SYF，8-10mm)。這兩個選擇過程出現(xiàn)在不同的卵泡發(fā)育階段，結(jié)果也大不相同，卵泡的募集可以選出大量的小卵泡一起進(jìn)入下一階段發(fā)育，而優(yōu)勢卵泡的篩選只能選出唯一一個卵泡。為了探究這兩個階段卵泡在鵝產(chǎn)蛋過程中基因差異

2、性表達(dá)的分子網(wǎng)絡(luò)機制，本實驗分別以SWF和SYF兩個階段的鵝等級前卵泡為實驗材料，進(jìn)行Illumina/Solexa測序及數(shù)字基因表達(dá)譜(DGE)分析，以期對這兩個階段卵泡呈現(xiàn)差異性表達(dá)的基因進(jìn)行鑒別及篩選，并對其進(jìn)行GO分析和KEGGpathway分析;DGE測序結(jié)果表明，AKR1D1在小白卵泡和大黃卵泡中均有表達(dá)，且其表達(dá)存在顯著差異，AKR1D1主要的生物功能是膽汁酸的合成和類固醇激素的清除，而類固醇激素的動態(tài)平衡是影響卵泡正常發(fā)

3、育的關(guān)鍵，因此對AKR1D1基因在卵泡發(fā)育過程中的功能進(jìn)行初步探索，主要研究結(jié)果如下:
　　1.在構(gòu)建的SWF和SYF文庫中分別檢測到了1.59G和1.71G的數(shù)據(jù)，經(jīng)過一些列質(zhì)量控制過濾之后，得到了可信度較高的1.56G和1.68G的Clean序列。
　　2.利用RSEM軟件，將SWF和SYF過濾后的測序序列分別進(jìn)行基因組定位分析，兩組所得定位百分比分別為88.80％和89.21％，均高于70％，表明結(jié)果較為理想。

4、　　3.通過DGE技術(shù)，本次在SWF和SYF兩個階段的卵泡組織中共檢測到160個差異表達(dá)基因，其中有114個基因表達(dá)上調(diào)，46個基因表達(dá)下調(diào)。
　　4.通過對差異基因進(jìn)行GO和KEGG Pathway富集，富集到了很多可以詮釋SWF和SYF兩個階段卵泡發(fā)育差異的通路，比如細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化、營養(yǎng)的傳輸、能量的供給、氨基酸代謝和脂質(zhì)代謝等通路，而可以推斷出其中的類固醇合成、細(xì)胞增殖和細(xì)胞分化過程在SWF卵泡發(fā)育階段扮演著重要的角色。