AVM和IVM與GABA受體分子對接研究.pdf

1、阿維菌素(avermectin，AVM)由于其具有高效、低毒和無殘留等特點(diǎn)，順應(yīng)了低碳生活，綠色化學(xué)的潮流而迅速被人們認(rèn)可，從而得到大面積的推廣?？墒请S著阿維菌素應(yīng)用時間延長，昆蟲對AVM產(chǎn)生了抗性，導(dǎo)致藥效越來越差。這就給科學(xué)家提出了要不斷對該產(chǎn)品推陳出新的要求，但是目前在分子水平研究阿維菌素的殺蟲機(jī)理的研究較少?；诖?，本課題組首先選擇乙酰膽堿受體(1OED)模型作為模板使用ORCHESTRAR軟件根據(jù)同源模擬的方法構(gòu)建家蠅GABA

2、受體，果蠅RDL受體及果蠅復(fù)合蛋白受體三種蛋白及其突變受體。使用多種蛋白評價手段檢測得出構(gòu)建的結(jié)構(gòu)的合理性，拉氏圖檢測結(jié)果顯示所得模型中處于合理區(qū)域和可以接受的合理區(qū)域的氨基酸殘基的比例遠(yuǎn)高于90％的標(biāo)準(zhǔn)，這說明本次同源模擬得到的蛋白結(jié)構(gòu)模型是合理的。
　　根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)確定AVM在家蠅及果蠅GABA受體蛋白的結(jié)合位點(diǎn)，即位于穿膜區(qū)域兩個亞組之間的位置并與胞外區(qū)域靠近。最后使用Surflex-Dock軟件將AVM/IVM分子分別對接

3、到突變前后的GABA受體蛋白。結(jié)果顯示AVM/IVM分子與昆蟲GABA受體(家蠅GABA受體、果蠅RDL受體和果蠅復(fù)合受體)的結(jié)合自由能分別為-7.84 Kcal/moL和-4.75 Kcal/moL表明昆蟲GABA受體與AVM與的結(jié)合強(qiáng)度明顯高于IVM，這一結(jié)果與AVM毒性高于IVM相吻合。突變以后昆蟲GABA受體與AVM/IVM的結(jié)合自由能升高了0.31～3.59 Kcal/moL，這與昆蟲基因突變導(dǎo)致其對AVM藥物產(chǎn)生抗性相吻合。