腺苷受體拮抗劑藥效團模建和分子對接研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、腺苷受體屬于G蛋白偶聯(lián)受體家族,它參與調(diào)節(jié)細(xì)胞間傳導(dǎo)介質(zhì)以及作為自體活性物質(zhì)的功能已得到了廣泛證實。腺苷受體作為潛在的藥物靶點正逐漸成為一個充滿希望的研究目標(biāo)。本研究以四種亞型腺苷受體為靶標(biāo),采用計算機輔助藥物設(shè)計方法構(gòu)建拮抗劑的藥效團模型,模建靶標(biāo)的三維結(jié)構(gòu),探討拮抗劑和靶標(biāo)的相互作用模式,分析和識別靶標(biāo)中存在的重要活性結(jié)合位點。 本文構(gòu)建四種亞型腺苷受體拮抗劑的藥效團模型。這些模型不僅能很好地描述拮抗劑的重要共同特征,而且可

2、以區(qū)分不同亞型受體的拮抗劑,具有良好的選擇性。A1藥效團模型由一個氫鍵受體、兩個疏水基團組成,在疏水基團周圍都有空間位阻。黃嘌呤A2A藥效團模型含有2個氫鍵受體、2個疏水基團和2個芳香環(huán);非黃嘌呤A2A藥效團模型含有一個疏水基團、一個正離子中心和兩個氫鍵受體,正離子中心是區(qū)分A2B拮抗劑的特異性藥效團。A2B藥效團模型由一個疏水基團、一個芳香環(huán)和兩個氫鍵受體組成,兩個氫鍵受體對其選擇性和活性具有很大影響。A3藥效團模型由一個疏水基團、一

3、個芳香環(huán)、三個氫鍵受體組成,芳香環(huán)周圍有潛在空間位阻。 為了進一步闡明拮抗劑與受體間的相互作用模式,本研究采用柔性對接方法系統(tǒng)地研究了配體與受體活性位點的相互作用,并對腺苷受體活性位點的重要功能區(qū)域分布進行了準(zhǔn)確的定位。A1受體結(jié)合位點含有三個疏水環(huán)境a)Val181,Phe185,Phe186;b)Val87,Leu88,Tyr271,Ile274;c)Ile95,Val 189,Ile274,Thr277。A2A受體的Ile

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