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文檔簡介
1、第一部分
應用生物信息學預測GR mRNA是mmu-miR-30a的可能靶基因
目的:預測miRNA靶基因是否為糖皮質激素受體(Glucocorticoid Receptor,GR) mRNA。
方法:使用miRBase(http://www.mirbase.org)獲得miR-30a基因序列;使用Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)獲得基因NR3C1序列;分別
2、使用miRanda、TargetScan、PicTar生物信息學軟件對mmu-miR-30a的靶基因進行尋找與預測。
結果:miRanda、TargetScan和PicTar均預測到mmu-mir-30a的靶基因為糖皮質激素受體(Glucocorticoid Receptor,GR)mRNA。
結論:GR mRNA是mmu-miR-30a的可能靶基因
第二部分
小鼠
3、足細胞中GRα及mmu-miR-30a的表達變化
目的:探討GRα與mmu-miR-30a在小鼠足細胞系MPC5(mouse podocyte clone5,MPC5)中的表達變化。
方法:
條件永生型小鼠足細胞系MPC5培養(yǎng):將復蘇MPC5細胞于33℃中增殖培養(yǎng),平均3~4天達90%以上融合傳代。換于37℃中培養(yǎng),10~14天分化為成熟,此時為分化態(tài)MPC5;將以上兩種細胞分為兩組,通過反轉錄
4、酶-聚合酶鏈反應(RT-PCR)、免疫蛋白印跡(Western-blot)、免疫熒光顯微鏡檢測Nephrin、Synaptopodin、GRα在未分化態(tài)與分化態(tài)MPC5中的表達,觀察變化:通過實時熒光定量PCR反應(qRT-PCR)檢測mmu-miR-30a在未分化態(tài)與分化態(tài)MPC5中的表達,觀察變化;
結果:
MPC5細胞在33℃有γ-INF的1640培養(yǎng)液中生長,細胞體小而突起,細胞間排列緊密,呈鵝卵石樣
5、,部分區(qū)域有管腔樣結構,足突樣結構少見,平均3~4天即達到90%融合,在37℃無γ-INF條件培養(yǎng)下的足細胞較33℃的胞體透明,呈多角形,細胞間相對疏松,管腔樣結構增多,生長速度明顯減緩,3~4天后細胞即停止增殖,1周后星型細胞樣細胞形成,樹枝狀的足突結構明顯,可見細胞間足突互相接觸,10~14天分化成熟。RT-PCR、Western-blot、免疫熒光顯微鏡顯示,nephrin在33℃未分化足細胞和37℃分化足細胞中均有表達,37℃分
6、化足細胞中表達顯著增加(P<0.01);Synaptopodin在33℃未分化足細胞中幾乎未見表達;而在37℃分化足細胞中表達明顯(P<0.01)。GRα在33℃未分化足細胞和37℃分化足細胞中均有表達,37℃分化足細胞中表達顯著增加(P<0.01);qRT-PCR檢測顯示,mmu-miR-30a在33℃未分化足細胞和37℃分化足細胞中均有表達,37℃分化足細胞中表達顯著增加(P<0.01)。
結論:
GRα
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