成都社區(qū)漢族人群血脂候選基因多態(tài)性研究.pdf

1、目的：迄今為止，全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS）鑒定了一大簇與脂代謝相關(guān)的遺傳易感區(qū)域，其中部分候選基因位點(diǎn)被不同種族驗(yàn)證。鈣粘蛋白 EGF-LAG七通型受體2基因(cadherin EGF-LAG seven-pass G-type receptor2，CELSR2），sortilin1基因（SORT1），富含脯氨酸/絲氨酸卷曲螺旋1基因（proline and serine rich coiled-coil1， PSRC1），3-羥基-

2、3-甲基戊二酸單酰輔酶 A還原酶基因（3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme-A reductase，HMGCR），脂蛋白脂肪酶基因（Lipoprteinlipase，LPL），肝脂肪酶基因（hepatic lipase，LIPC）在大規(guī)模群體研究中發(fā)現(xiàn)它們不僅參與調(diào)節(jié)脂代謝譜變化，還可能與心血管疾病易患風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。本研究以單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism，S N

3、 P）作為遺傳標(biāo)記，采用單個(gè)堿基延伸測(cè)序法（Signal Base Extention，SBE）作為SNPs基因分型方法，運(yùn)用連續(xù)變量(continuous variable）和病例-對(duì)照研究(case-control study）模式，針對(duì)成都社區(qū)漢族人群與易感候選基因的8個(gè)SNPs位點(diǎn)（CELSR2基因：rs599839；SORT1基因：rs4970834；PSRC1基因：rs646776；HMGCR基因：rs12654264，rs

4、3846662；LPL基因：rs327，rs331；LIPC基因：rs1077834）進(jìn)行血脂的關(guān)聯(lián)分析和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。
　　方法：所有統(tǒng)計(jì)結(jié)果p值均經(jīng)Bonferroni校正。
　　第一部分.分析納入的1900例成都社區(qū)漢族人群流行病學(xué)指標(biāo)，包括身體質(zhì)量指數(shù)（BMI）、血糖（GLU）、收縮壓（SBP）、舒張壓（DBP）、總膽固醇（TC）、甘油三酯（TG）、低密度脂蛋白膽固醇（LDL-C）和高密度脂蛋白膽固醇（HDL-C）。1、

5、年齡分析：將1900例納入人群根據(jù)年齡分為大于等于60歲（≥60歲）和小于60歲（＜60歲）兩個(gè)不同年齡組，采用t檢驗(yàn)比較兩組間BMI、血GLU、SBP、DBP和血脂亞組分（TC、TG、LDL-C、HDL-C）水平的差異；再將各血脂亞組分分別按血脂紊亂臨界值分為正常組和異常組，采用卡方檢驗(yàn)分別比較兩組間血脂亞組分差異。2、性別分析：將1900例納入人群分為男性組和女性組，采用t檢驗(yàn)比較兩組間血GLU、BMI、SBP、DBP和血脂亞組分水

6、平（TC、TG、LDL-C、HDL-C）的差異；再分別將各血脂亞組分分為正常組和異常組，采用卡方檢驗(yàn)分別比較兩組間血脂亞組分差異。
　　第二部分.候選基因SNPs分型與血脂各組分關(guān)聯(lián)分析。1、總研究人群各血脂亞組分水平與候選SNPs等位基因位點(diǎn)的連續(xù)變量關(guān)聯(lián)分析；2、對(duì)總研究人群中篩選出與血脂亞組分水平有關(guān)聯(lián)的SNPs位點(diǎn)年齡分層（大于和等于60歲和小于60歲兩個(gè)年齡組）后與血脂亞組分水平進(jìn)行病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析；3、對(duì)總研究人群中

7、篩選出與血脂亞組分水平有關(guān)聯(lián)的 SNPs位點(diǎn)性別分層（男性組和女性組）后與血脂亞組分水平進(jìn)行病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析。
　　第三部分.采用Logistic回歸分析血脂亞組分與候選基因SNPs位點(diǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。1、先采用單因素Logistic回歸進(jìn)行血脂亞組分與候選基因 SNPs位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析，對(duì)有顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)分別以年齡，BMI，GLU，SBP和DBP血壓為協(xié)變量，采用多因素Logistic回歸進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估分析；2、進(jìn)一步性別分層，分析性別間

8、血脂亞組分與有顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。結(jié)果：第一部分.本研究共納入1900例研究對(duì)象，其中男性746例，年齡60.06±13.21歲，女性1154例，年齡59.61±10.85歲；BMI23.98±3.16 kg/m2，血GLU5.25±1.51 mmol/L，SBP129±19.7 mmHg，DBP78±10.9 mmHg， TC5.22±0.93 mmol/L，TG1.59±1.38， LDL-C3.14±0.86，HDL-C1.3

9、5±0.31；TC分組：正常978例（61％），異常625例（39%）；TG分組：正常1361例（71.6%），異常539例（28.4%）；LDL-C分組：正常1242例（65.4%），異常658例（34.6%）；HDL-C分組：正常1622例（85.4%），異常278例（14.6%）。1、采用t檢驗(yàn)方法統(tǒng)計(jì)分析顯示：年齡分組間 BMI、血 GLU、SBP、DBP、TC、LDL-C和HDL-C有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＜0.05），低年齡組（

10、＜60歲）血 GLU、SBP、DBP、TC和LDL-C均值低于高年齡組（≥60歲），高年齡組（≥60歲）HDL-C均值低于低年齡組（＜60歲）（p≤0.05），而BMI和TG水平在兩組間沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。經(jīng)卡方檢驗(yàn)顯示：年齡組間血脂亞組分（TC、TG、LDL-C和HDL-C）正常和異常組均有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p≤0.05）。2、采用t檢驗(yàn)方法統(tǒng)計(jì)分析顯示：男性組和女性組的BMI、血GLU、SBP、DBP、TC、LDL-C和H

11、DL-C有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p≤0.05），其中女性組BMI、血GLU、SBP、DBP和TG均值低于男性，而男性組TC和HDL-C均值低于女性，不同性別間LDL-C水平?jīng)]有差異（p＞0.05）。經(jīng)卡方檢驗(yàn)顯示，性別組間血脂亞組分（TC、TG、LDL-C和HDL-C）正常和異常組有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p≤0.05）。第二部分.候選基因SNP分型與血脂各組分關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果顯示：1、總納入人群：血清 TC水平與rs599839（p=3.7×10-4

12、），rs646776（p=0.001），rs12654264（p=1.4×10-5）和 rs3846662（p=9.9×10-5）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；血清 LDL-C水平與rs4970834（p=4.49×10-4），rs599839（p=1.5×10-5），rs646776（p=3.5×10-5），rs12654264（p=0.001），rs3846662（p=0.001）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；血清HDL-C水平與rs327（p=0

13、.001），rs331（p=1.19×10-4），rs1077834（p=0.004）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；血清TG水平與所有候選SNPs位點(diǎn)無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。2、低年齡組（＜60歲）：血清TC水平與rs12654264（p=2.9×10-5）和 rs3846662（p=1.7×10-5）等位基因有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，而與rs646776和rs599839等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）；血清LDL-C水平與rs599839（p=3.5×1

14、0-4）、rs646774（p=0.001）、rs12654264（p=3.6×10-4）和 rs3846662（p=5.3×10-5）等位基因有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，而與rs4970834等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）；血清HDL-C水平與rs331（p=1.7×10-5）等位基因有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，而與rs327和 rs1077834等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。高年齡組（≥60歲）：血清TC水平與rs599839（p=0.0

15、03）和rs646774（p=0.004）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，而與rs12654264和 rs3846662等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）；血清 LDL-C水平與rs4970834（p=0.003）、rs599839（p=0.004）和 rs646774（p=0.005）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，而與rs12654264和rs3846662等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）；血清HDL-C水平與rs327、rs331和rs1077

16、834等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。3、男性組：血清HDL-C水平與rs327（p=0.003）和rs331（p=0.002）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,與rs1077834等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）；血清TC水平與rs599839、rs646776、rs12654264和rs3846662等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p＞0.05）；血清 LDL-C水平與rs4970834、rs599839、rs646776、rs12654264

17、和rs3846662等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。女性組：血清TC水平與rs599839（p=0.001），rs646776（p=0.001），rs12654264（p=8.6×10-5），rs3846662（p=0.002）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；血清LDL-C水平與rs4970834（p=0.006），rs599839（p=1.83×10-4），rs646776（p=3.34×10-4），rs12654264（p=0.002）

18、，rs3846662（p=0.003）等位基因有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；血清HDL-C水平與rs327、rs331和rs1077834等位基因無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。第三部分.多因素Logistic回歸風(fēng)險(xiǎn)分析顯示：1、總納入人群：G等位基因（rs599839：p=3.2×10-4， OR=0.532，95%CI：0.378-0.750）、A等位基因（rs12654264：p=0.001， OR=0.753，95%CI：0.642-0.884

19、）和 T等位基因（rs3846662：p=0.001， OR=0.755，95%CI：0.640-0.892）能降低攜帶者血清LDL-C增高的風(fēng)險(xiǎn)；rs4970834、rs646776、rs327、rs331和rs1077834等位基因與血脂異常沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）；?男性組：T等位基因（rs3846662：p=0.014， OR=0.709，95%CI：0.538-0.933）能降低血清LDL-C增高的風(fēng)險(xiǎn)，rs599839

20、和rs12654264等位基因與男性受試者血脂亞組分異常沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。女性組：rs12654264 A等位基因（p=0.005，OR=0.751，95%CI：0.616-0.917）能降低血清LDL-C增高的風(fēng)險(xiǎn)；rs599839和rs3846662等位基因與女性受試者血脂亞組分異常沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p＞0.05）。
　　結(jié)論：本研究結(jié)果提示1：候選基因CELSR2（rs4970834）、SORT1（rs64677

21、6）、PSRC1（rs599839）、HMGCR（rs12654264，rs3846662）、LPL（rs327， rs331）和 LIPC（rs1077834）分別與調(diào)查的成都社區(qū)漢族人群血脂水平變化有關(guān)。其中rs4970834等位基因分別與高年齡組（≥60歲）和女性組血清LDL-C水平）有顯著差異（p=0.003和 p=0.006）；rs599839和rs646774等位基因分別與低年齡組（＜60歲）、高年齡組（≥60歲）和女性組血

22、清LDL-C水平有顯著差異（分別為p=3.5×10-4、p=0.004、p=1.83×10-4，和p=0.001、p=0.005、p=0.001），且與高年齡組（≥60歲）和女性組血清TC水平也有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（分別為p=0.003、p=0.004和p=0.001、p=0.001）；rs12654264和rs3846662等位基因與低齡組（＜60歲）和女性組血清LDL-C和TC水平有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（分別為低齡組LDL-C：p=3.6×10-

23、4、p=5.3×10-5，低齡組TC：p=2.9×10-5、p=1.7×10-5，女性組LDL-C：p=0.002、p=0.003，女性組TC：p=8.6×10-5、p=0.002）；rs327等位基因與男性組血清HDL-C水平有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p=0.001）；rs331等位基因與低齡組（＜60歲）和男性組血清HDL-C水平有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（p=0.006、p=0.001）。研究結(jié)果提示2：PSRC1（rs599839）和HMGCR（rs