河南省嚙齒類動物流行性出血熱病毒的分子流行病學研究.pdf

1、目的：采用分子流行病學的方法，通過漢坦病毒核酸RT-PCR分型及部分擴增片段的序列分析，研究河南省不同地區(qū)嚙齒類動物攜帶腎綜合征出血熱病毒狀況和病毒型別，了解其基因型的分布、變異、新型別存在與否，并對其系統(tǒng)發(fā)生及進化關系加以分系，為腎綜合征出血熱防治研究提供科學依據。 方法：籠捕法捕鼠，計算鼠密度，確定鼠種構成。用直接免疫熒光法檢測動物肺組織切片，應用漢坦病毒型特異性引物以RT-PCR方法對抗原檢測陽性的鼠肺標本擴增M和S基因片

2、段上的特異核苷酸序列并測序，將擴增片段的核苷酸序列與已知病毒序列進行比較，用PHYLIP軟件對得到的序列繪制系統(tǒng)發(fā)生樹，了解其進化關系，以明確基因亞型及其地理分布情況。 結果：在河南省不同生境的7個縣市區(qū)中共布鼠籠4720個，捕獲嚙齒類動物695只，褐家鼠為優(yōu)勢鼠種，占33.53％。其次為黃胸鼠，占18.41％。應用直接免疫熒光法檢測全部鼠肺，其中陽性肺組織切片95份，陽性率為13.67％。陽性切片中，褐家鼠和倉鼠分別占47.0

3、％和26.32％。陽性標本并用RT-PCR反應擴增并電泳檢測。對3份M片段、S片段均擴增陽性標本進行序列測定，并對其核苷酸序列進行分析顯示，均為漢城型(SEO)漢坦病毒，與漢坦病毒R22株、L99株、HB55株、Hb86株、SR11株分別屬相同亞型。同一地區(qū)的漢坦病毒其核苷酸序列同源性較為接近，表明不同亞型間有著明顯的地理聚集現(xiàn)象。在研究中無新的型別出現(xiàn)。 結論：河南省不同地區(qū)出血熱病毒的主要宿主動物是褐家鼠，不同宿主動物攜帶的