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簡介:WHO公布2003年席卷全球的SARS爆發(fā)流行,涉及32個國家和地區(qū),全球累計病例8422例,死亡人數(shù)919人,病死率約11%。2004年禽流感病毒甲型H5N1在南亞和東南亞爆發(fā)流行,致使超過1億只家禽被捕殺,并傳播人類導(dǎo)致感染患者的死亡。2009年4月自墨西哥出現(xiàn)的第一例甲型H1N1流感病毒感染患者至2010年3月,該病毒的大流行已蔓延全球213個國家和地區(qū)。2010年4月,WHO公布迄今為止甲型H1N1病毒大流行已造成17000余人死亡。截至2010年3月31日,中國31個省累計報告甲型H1N1流感確診病例120000例,死亡病例超過800例。近7年新發(fā)感染性疾病(EMERGINGINFECTIOUSDISEASE,EID)事件觸目驚心,對人類健康、經(jīng)濟(jì)發(fā)展和社會穩(wěn)定產(chǎn)生了巨大的影響,使人們對EID積極防控和健全相關(guān)公共衛(wèi)生安全體系產(chǎn)生了許多新的認(rèn)識,并對EID病原體給予了高度關(guān)注。目的本研究通過BDV分子流行病學(xué)調(diào)查和研究,建立中國西北伊犁地區(qū)新發(fā)病毒BDV感染動物樣本庫,獲得BDV流行病學(xué)資料,了解不同種屬動物BDV流行現(xiàn)狀,分析BDV可能的種系來源,為制定預(yù)防和控制BDV爆發(fā)流行預(yù)案提供可靠依據(jù),為健全公共衛(wèi)生安全體系奠定堅實的基礎(chǔ)。同時,建立BDVP40OL細(xì)胞模型,為BDV發(fā)病機制的蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供平臺;進(jìn)一步評價BDV熒光定量PCR診斷試劑盒,為BDV流行病學(xué)調(diào)查和臨床研究提供可靠的檢測手段。方法1根據(jù)BDV感染宿主地源特殊性和種屬多樣性,選擇中國西北新疆伊犁地區(qū)作為樣本采集地點;伊犁馬、新疆驢、新疆雙峰駝、天山馬鹿和不同品種犬作為樣本采集動物;外周血和腦組織作為樣本采集對象。2采用FQNRTPCR方法,檢測8個品種150例犬PBMCSBDVP24RNA基因片段。用檢測BDVP40RNA片段和質(zhì)粒PMD19BDVH1766P24標(biāo)準(zhǔn)品驗證樣本BDVP24陽性產(chǎn)物,排除可能出現(xiàn)的假陽性。驗證后的陽性產(chǎn)物進(jìn)行基因測序、核苷酸和氨基酸序列同源比對以及系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析。3在5個種屬8個品種873例動物PBMCS中,對伊犁馬、新疆驢和哈薩克牧羊犬共檢出的19例BDVP24RNA陽性片段,進(jìn)行BDV標(biāo)準(zhǔn)株HE80、STRAINV和H1766比對,分析核苷酸和氨基酸同源相似度,重構(gòu)基因系統(tǒng)發(fā)生樹,分析BDV可能的種系來源。4培養(yǎng)人OL細(xì)胞株細(xì)胞,用含有BDVP40基因的質(zhì)粒PEGFPN1BDVP40,經(jīng)脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染OL細(xì)胞。通過G418篩選已轉(zhuǎn)染的0L細(xì)胞,獲得BDVP40蛋白穩(wěn)定表達(dá)的轉(zhuǎn)染態(tài)OL細(xì)胞。RTPCR擴(kuò)增,瓊脂糖凝膠電泳鑒定質(zhì)粒BDVP40基因表達(dá);觀察GFP表達(dá)、測定IHC和ELISA,鑒定BDVP40蛋白表達(dá)。最后,建立穩(wěn)定表達(dá)BDVP40的轉(zhuǎn)染態(tài)OL細(xì)胞模型。5試劑盒評價在熱穩(wěn)定性評價方面,將BDVP24熒光定量PCR診斷試劑盒中試劑分裝多份一次PCR擴(kuò)增反應(yīng)量。隨機取出其中2份分別置于25℃和37℃兩種溫度的恒溫水浴箱內(nèi)進(jìn)行熱處理。處理時間分別選擇3H、6H、9H、12H、24H、48H和96H共7個時間段。在相應(yīng)溫度和熱處理時間完成后,對6個濃度梯度的質(zhì)粒PMD19BDVH1766P24標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物用瓊脂糖凝膠電泳鑒定。通過對PCR反應(yīng)的CT值和R2值比較,評價試劑盒的熱穩(wěn)定性。在BDV檢測信度評價方面,選擇定量BDV()OL細(xì)胞和質(zhì)粒PMD19BDVH1766P24標(biāo)準(zhǔn)品,進(jìn)行BDVP24基因片段PCR擴(kuò)增。通過比較兩種檢測對象檢出BDVP24濃度梯度的一致性,評價試劑盒病毒檢測結(jié)果信度。結(jié)果1在樣本采集方面,伊犁地區(qū)樣本采集動物歸屬于5個種屬8個品種。種屬包括伊犁馬、新疆驢、新疆雙峰駝、天山馬鹿和犬;品種有哈薩克牧羊犬、德國牧羊犬、卡羅來納犬、西伯利亞雪橇犬、波音達(dá)獵犬、比格獵犬、德國杜賓犬和斗牛梗犬。樣本采集動物數(shù)量合計897例,其中伊犁馬582例,新疆驢204例,新疆雙峰駝4例,天山馬鹿1例,哈薩克牧羊犬95例,德國牧羊犬28例,卡羅來納犬14例,西伯利亞雪橇犬8例,波音達(dá)獵犬6例,比格獵犬4例,德國杜賓犬3例,斗牛梗犬2例。樣本采集對象為外周血、腦組織和全腦。采集樣本的數(shù)量為外周血樣本897份、腦組織樣本1573份和全腦樣本43份。2在病毒檢測方面,在8個品種150例犬中,僅哈薩克牧羊犬檢出BDVP24片段,陽性率為110%(1091)?;蛐蛄信c德國馬BDVHE80和德國綿羊BDVS6病毒株同源相似度分別為992%和957%,氨基酸相似度為100%和893%。親緣關(guān)系與HE80最近,其次為S6。3在種系發(fā)生學(xué)方面,19例BDVP24核苷酸序列一部分形成伊犁獨立支系,其余部分匯聚至伊犁德國瑞士混合支系。獨立支系與標(biāo)準(zhǔn)病毒株無聚合,核苷酸序列同源相似度為98%,氨基酸序列為100%;德國馬HE80匯聚混合支系,核苷酸與氨基酸序列與HE80同源相似度均為100%。4在細(xì)胞模型建立方面,用RTPCR擴(kuò)增經(jīng)PEGFPN1BDVP40轉(zhuǎn)染的OL細(xì)胞中BDVP40基因核苷酸序列片段,擴(kuò)增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠電泳154BP處出現(xiàn)一條清晰的條帶,其大小與目的片段一致。倒置熒光顯微鏡觀察,OL細(xì)胞核GFP表達(dá)量明顯大于細(xì)胞質(zhì)(細(xì)胞核細(xì)胞質(zhì)243),證明了BDVP40蛋白核定位的生物學(xué)特點。用BDV多克隆抗體和CIC單克隆抗體檢測PEGFPN1BDVP40、PEGFPN1和正常OL細(xì)胞中BDVP40蛋白表達(dá),結(jié)果顯示,前者均為陰性,后者均為弱陽性,三者之間無差異。5在試劑盒評價方面,試劑盒熱穩(wěn)定評價顯示,經(jīng)25℃和37℃熱處理后,各溫度7個不同時間段BDVP24PCR反應(yīng)CT值之間無差異,保持正常PCR擴(kuò)增效率的熱處理持續(xù)時間范圍為3H~96H;25℃和37℃兩種溫度條件下不同時間段平均尺2值之間亦無差異。BDV檢測信度評價方面顯示,在定量BDV()OL細(xì)胞(12個濃度梯度即100~1011)和質(zhì)粒PMD19BDVH1766P24標(biāo)準(zhǔn)品(6個濃度梯度即100~105)中,均可檢測4個濃度梯度即100、101、102和103,最低檢測濃度為103。結(jié)論1伊犁地區(qū)所采集不同種屬和品種的動物血液和腦組織樣本量,可基本反映該地區(qū)BDV自然感染現(xiàn)狀,納入動物性別和年齡的同質(zhì)性進(jìn)一步提高了調(diào)查結(jié)果的可靠性。在國內(nèi)外首次建立了馬科動物快速開顱全腦采集的新方法。2伊犁地區(qū)可能存在BDV自然感染,哈薩克牧羊犬為BDV貯存宿主,其自然感染陽性率為110%;該地區(qū)BDV流行病毒株可能與伊犁馬BDVHE80的交叉感染和引進(jìn)德國SAXONY美利奴綿羊BDVS6病毒株的輸入感染有關(guān)。3首次提出了新疆伊犁河谷動物宿主中可能存在地源性BDV獨立種系,形成哈薩克牧羊犬BDVKT078和KT079病毒株;同一種系BDV株在伊犁河谷不同種屬動物間的感染,可能源于外來疫病病原體經(jīng)草原絲綢之路的傳播。4質(zhì)粒PEGFPN1BDVP40轉(zhuǎn)染人OL細(xì)胞后BDVP40基因和蛋白在細(xì)胞內(nèi)的穩(wěn)定表達(dá),建立了轉(zhuǎn)染態(tài)BDVP40OL細(xì)胞模型,為探索BDVP40單一病毒蛋白在宿主中的作用和BDV致抑郁癥發(fā)病機制的蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供了有效的手段。5熒光定量BDVP24診斷試劑盒在一定范圍內(nèi)不受溫度(25℃37℃)和在該溫度下持續(xù)使用時間(3H~96H)的限制,具有較好的熱穩(wěn)定性;該試劑盒具有極高的BDV檢測信度,可檢測宿主細(xì)胞中103BDV濃度。
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簡介:目的探討肝炎病毒血清學(xué)標(biāo)志陰性肝病患者流行病學(xué)和臨床特點,指導(dǎo)臨床診斷和治療。方法采用臨床流行病學(xué)調(diào)查方法,回顧性分析2006年1月至2008年12月肝炎病毒血清學(xué)標(biāo)志陰性住院的肝病患者210例臨床資料。結(jié)果1、210例肝病患者中,藥物性肝炎41例195%、不明原因性肝病38例181%、酒精性肝病30例143%、自身免疫性肝病23例110%、肝膽外科疾病23例110%、惡性腫瘤14例67%、非酒精性脂肪肝11例52%、遺傳代謝性肝病7例33%、妊娠急性脂肪肝3例14%、其他疾病20例95%;2、自身免疫性肝病包括PBC、AIH、PSC等男女比例為0351,酒精性肝病男女比例為291,肝膽外科疾病男女比例為2291;3、自身免疫性肝病患者在46~55年齡段發(fā)病率最高391%,酒精性肝病患者在36~45歲發(fā)病率最高367%,肝膽外科疾病及腫瘤疾患發(fā)病年齡以66歲以上的老年人多見分別為304%、357%;4、自身免疫性肝病和肝膽外科疾病的臨床表現(xiàn)以黃疸如鞏膜黃染、尿色深為著;自身免疫性肝病瘙癢及酒精性肝病的肝掌陽性率最高;藥物性肝病ALT、AST升高、自身免疫性肝病TBIL升高及自身免疫性肝病和肝膽外科疾病ALP、ΓGT升高的水平最為顯著。結(jié)論1、藥物性肝病發(fā)病率居本組患者之首,其次為不明原因性肝病、酒精性肝病、自身免疫性肝病及肝膽外科疾病等;2、自身免疫性肝病以中年女性發(fā)病率最高,酒精性肝病患者集中在36~45歲的中年男性,肝膽外科及腫瘤疾患發(fā)病年齡以66歲以上的老年人多見;3、自身免疫性肝病患者常有明顯的黃疸、皮膚瘙癢等癥狀;酒精性肝病患者肝掌陽性率較高;4、藥物性肝病轉(zhuǎn)氨酶升高較為顯著;5、自身免疫性肝病、惡性腫瘤、肝膽外科疾病患者膽紅素、ALP、ΓGT較其他病種明顯升高。
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簡介:Y761881中圓于島和嚼科大學(xué)中國箭學(xué)甜辱豫博士研究生學(xué)位論文中國協(xié)和醫(yī)科人學(xué)幻F究生院薈■穆碼,肆疆采中周協(xié)和醫(yī)科人學(xué)中周醫(yī)學(xué)科學(xué)腕腫瘤醫(yī)院博士學(xué)位論史5/32,ODDSRATIOOR612,PO01。HBVCCCDNA,作為反映病毒活躍增殖的標(biāo)志,在肝癌組和對照組的陽性率分別是625%21/32和218%8/32,OR573,PO01。最近備受重視的HBV的風(fēng)險指標(biāo),核苷酸1762/1764錯義突變,進(jìn)行分析,肝癌組與對照組的突變率并無顯著性差異,OR1。54,P0。4248。結(jié)論1隨訪啟東377例慢性HBV感染的中年男性隊列1325年,觀察到90例發(fā)生了肝細(xì)胞癌和終末期肝硬化,占這人群的239%90/377。其中,72例為肝癌,18例為肝硬化。其發(fā)病率分別約為L703/105/年及426/105/年。2巢式病例對照研究發(fā)現(xiàn)慢性HBV感染的中年男性,HBEAG和/IBVCCCDNA所反映的HBV滴度和活躍復(fù)制狀態(tài)與肝癌的發(fā)生密切關(guān)聯(lián)OR分別為612及573P001,可作為肝癌發(fā)生的風(fēng)險指標(biāo)。3本病例對照研究未發(fā)現(xiàn)HBV核苷酸1762和/或1764熱點突變與肝癌發(fā)生存在密切關(guān)聯(lián)。有待進(jìn)一步的研究。
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簡介:戊型肝炎病毒HEV是戊型肝炎戊肝的病原體,隨著戊型肝炎研究的深入及診斷試劑的發(fā)展,人們對戊肝的傳統(tǒng)認(rèn)識不斷被突破。戊肝作為一種人畜共患病已為人們所公認(rèn),HEV輸血傳播已得到了證實。依托更可靠的檢測技術(shù),對我國戊肝流行情況的全面重新了解十分必要。已報道的HEV核酸檢測PCR引物的靈敏度存在一定缺陷,為此,我們首先根據(jù)我國流行的HEV序列特征重新設(shè)計了一套引物。檢測結(jié)果證明,該套引物具有較好的檢出率和分析靈敏度。對多個地區(qū)HEV的分子流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),豬源HEV均為基因4型,而健康人群中檢出的HEV基因1、4型比例大致相當(dāng),但臨床散發(fā)性戊肝患者絕大部分為基因4型HEV感染。分離于人和豬的基因4型HEV高度同源,表明人、豬基因4型HEV在自然界中可自由傳播而不受種屬限制。基因4型HEV的變異程度明顯大于基因1型,并表現(xiàn)出一定的地域集中特點。利用新一代HEV診斷試劑在3省12個縣市的血清流行病學(xué)研究表明,HEV在中國已流行了相當(dāng)長的時間。各地區(qū)HEV抗體陽性率感染率從212%621%不等,相鄰地區(qū)可以有較大差異。在某一地區(qū)低烈度的靜默流行不會波及到鄰近地區(qū)。在多數(shù)地區(qū),30歲前男、女感染率沒有明顯差別,30歲后男性明顯高于女性。HEV的感染率具有明顯的年齡積累現(xiàn)象,但不同地區(qū)的增長速度不同,流行程度越高的地區(qū)隨年齡增長速度越快。9縣市自然人群一年隨訪結(jié)果表明一年內(nèi)人群感染率均有所上升,不同地區(qū)HEV的年新感染率不同,從10%到151%不等。新感染率20歲前要低于20歲后,抗體陰轉(zhuǎn)率10歲前要高于10歲后。臨床急性戊型肝炎患者、亞臨床感染者和HEV既往感染者戊肝IGG抗體水平分別為379UML、133UML和056UML。人群戊肝IGG抗體總體水平一年間沒有明顯變化。人群中抗體反彈的個體在反彈前抗體水平最高為16UML,推測人群中保護(hù)HEV感染的抗體水平大致為16UML。在江蘇東臺、海安、張家港3地的一年臨床急性肝炎病例觀察表明,戊肝四季均有發(fā)生,冬春季為發(fā)病高峰。戊肝患者平均年齡較其他肝炎患者高,50歲以上的急性肝炎患者戊肝占50%以上。男性戊肝患者明顯多于女性,男女比例大致為51,而東臺則高達(dá)101。40歲以上人群中戊肝報告發(fā)病率為每年萬分之一,40歲男性易感人群中戊肝報告發(fā)病率約為每年千分之一,個別地區(qū)在60歲以上時男性易感人群報告發(fā)病率高達(dá)每年千分之六,提示在高致病風(fēng)險人群中使用戊肝疫苗進(jìn)行免疫保護(hù)的重要性。豬的HEV感染在我國非常普遍,平均抗體陽性率達(dá)834%,不同地區(qū)間沒有明顯差異。血清流行病學(xué)調(diào)查表明從事豬相關(guān)職業(yè)導(dǎo)致HEV感染風(fēng)險升高174,而且從事時間越長,風(fēng)險越高。豬場下游人群與上游相比也有較高的感染風(fēng)險。提示HEV可以通過豬密切接觸傳播到從業(yè)者,并且豬場廢水中的戊肝病毒可以通過水流傳播。結(jié)合豬群比人群高得多的HEV帶毒率、人源和豬源基因4型HEV的高度相似及臨床戊肝患者主要為基因4型感染,推測豬已經(jīng)成為中國戊肝的重要傳染源。獻(xiàn)血員中HEV病毒血癥者比例大約為01%02%,在某些地區(qū)能達(dá)16%。這些HEV病毒血癥者按現(xiàn)有的獻(xiàn)血員篩查策略難以排除,因此HEV可能是輸血后肝炎的潛在原因之一。于北京血站篩查到的一份基因4型HEV亞臨床感染的獻(xiàn)血員血漿,經(jīng)靜脈輸入恒河猴后,該恒河猴出現(xiàn)糞便排毒和病毒血癥,各血清學(xué)指標(biāo)陽轉(zhuǎn),并出現(xiàn)典型急性肝炎癥狀,轉(zhuǎn)氨酶升高,肝穿出現(xiàn)典型的肝病變,包括非特異的炎癥改變和明顯的膽汁郁積。HEV的四個基因型根據(jù)流行病學(xué)和易感宿主的差異可以分為兩個大類,一類為只感染人的H類HUMAN,包括基因1型和2型;一類為人畜共患的Z類ZOONOSIS,包括基因3型和4型。本研究通過比較這兩類HEV的F2AA368AA606區(qū)段,發(fā)現(xiàn)在HEV的主要免疫優(yōu)勢表位、中和位點以及受體結(jié)合部位AA459AA606肽段存在4個類保守的差異位點,分別為SER483THR、VAL492MET、SER497THR和ALA599GLY。通過定點突變的重組蛋白研究表明497位氨基酸的差異導(dǎo)致了這兩類HEV的免疫優(yōu)勢表位構(gòu)象的部分改變,而其余三個位點的差異對HEV表面結(jié)構(gòu)影響不大。497位氨基酸的這種差異可能構(gòu)成了H類和Z類HEV在流行病學(xué)上諸多差異的分子機制。
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簡介:目的探討慢病毒載體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化生長因子Β3(TGFΒ3)、基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑1(TIMP1)聯(lián)合感染對體外培養(yǎng)人退變椎間盤髓核細(xì)胞的影響,從而最終實現(xiàn)延緩甚至逆轉(zhuǎn)椎間盤退變的目的。方法單層培養(yǎng)人退變椎間盤髓核細(xì)胞,采用綠色熒光蛋白標(biāo)記慢病毒(GV287EGFP)評價其對髓核細(xì)胞的感染效率。應(yīng)用構(gòu)建的TGFΒ3P2ATIMP1慢病毒載體感染髓核細(xì)胞,在倒置纖維鏡下觀察細(xì)胞形態(tài)學(xué)變化,通過REALTIMEQPCR技術(shù)檢測感染后TGFΒ3、TIMP1、Ⅱ型膠原和蛋白多糖的MRNA表達(dá)量,通過WESTERNBLOT技術(shù)檢測感染后Ⅱ型膠原和蛋白多糖含量,最終評價應(yīng)用攜帶TGFΒ3P2ATIMP1的慢病毒載體體外感染人退變椎間盤髓核細(xì)胞后對其細(xì)胞外基質(zhì)代謝的影響。結(jié)果感染復(fù)數(shù)(MOI)為60時可獲較滿意感染效率。REALTIMEQPCR示目的基因感染組的TGFΒ3、TIMP1、Ⅱ型膠原、蛋白多糖MRNA表達(dá)量均明顯高于空病毒感染組及空白對照組(F=16350~74378,Q2010~10620,P結(jié)論慢病毒載體介導(dǎo)的TGFΒ3和TIMP1雙基因聯(lián)合感染人椎間盤髓核細(xì)胞可長時間穩(wěn)定表達(dá),發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng),促進(jìn)蛋白多糖和Ⅱ型膠原的合成,并最終改善髓核細(xì)胞外基質(zhì)的代謝。
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簡介:目的手足口病是一種流行性傳染病,多由腸道病毒引起,癥狀主要表現(xiàn)為手、足和口腔粘膜的皰疹,多數(shù)是良性、自限性疾病,也可出現(xiàn)心、肺和神經(jīng)系統(tǒng)等嚴(yán)重并發(fā)癥。我們利用對腸道病毒具有較高特異性的兼并引物和自行設(shè)計的分型引物,檢測手足口病患兒咽拭子標(biāo)本,同時,通過腸道病毒基因組VP1編碼區(qū)序列的測定和分析,研究手足口病病原體檢測和分型方法,掌握其遺傳進(jìn)化特征。人類腸道病毒屬于小RNA病毒科腸道病毒屬,該屬包括脊髓灰質(zhì)炎病毒、柯薩奇病毒、??刹《竞湍c道病毒,其中腸道病毒71型是引起手足口病最重要的病原體,由其引起的手足口病癥狀較重,常伴有無菌性腦膜炎、腦干腦炎、脊髓灰質(zhì)炎樣麻痹等并發(fā)癥,嚴(yán)重者甚至?xí)?dǎo)致死亡。該病毒存在較明顯的變異和重組現(xiàn)象,因此到目前為止仍沒有很好的預(yù)防和治療方法。本課題通過對腸道病毒71型VP1區(qū)序列及全基因組序列的分析,研究腸道病毒71型的變異、重組規(guī)律,為疫苗的研發(fā)、藥物靶位的篩選及防控策略的完善等提供理論基礎(chǔ)。除柯薩奇病毒A16CVA16和腸道病毒71型EV71以外,柯薩奇病毒A10CVA10、柯薩奇病毒A6CVA6也是手足口病比較常見的病原體。本課題通過對手足口病CVA10VP1蛋白的生物信息學(xué)研究,分析和預(yù)測該病毒VP1蛋白的理化特性、空間結(jié)構(gòu)以及該蛋白的B細(xì)胞抗原表位。方法⑴標(biāo)本采集自山東大學(xué)齊魯兒童醫(yī)院住院手足口病患兒的咽拭子標(biāo)本。標(biāo)本加入適當(dāng)生理鹽水,劇烈振蕩洗下咽拭子上粘附的病毒及含有病毒的細(xì)胞等,自然沉淀后吸取上清液,加入適量抗生素,置4℃條件下,備用。⑵采用北京天根公司病毒RNA提取試劑盒,按說明書進(jìn)行。提取的RNA溶于60ULRNASEFREEDDH2O中,直接用于RTPCR或置20℃以下低溫保存。⑶用腸道病毒通用實時熒光RTPCR核酸檢測試劑盒同時分別進(jìn)行腸道病毒屬、EV71和CVA16型進(jìn)行分子鑒定。⑷合成對腸道病毒VP1區(qū)3’端序列具有較高特異性的兼并引物040011,同時通過檢索GENBANK中EV71和CVA10病毒基因型VP1序列,分別設(shè)計分型引物。⑸通過RTPCR方法擴(kuò)增EV71、CVA16、CVA6和CVA10病毒基因型VP1區(qū)核苷酸序列。⑹瓊脂糖凝膠電泳對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行分離,利用北京天根公司瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒對DNA進(jìn)行回收、純化。⑺回收后的DNA進(jìn)行序列測定。采用生物信息學(xué)軟件DNAMAN522和BIOEDIT7090進(jìn)行序列比對并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。⑻使用基因重組分析軟件RDP和SIMPLOT_V351,對EV71基因組進(jìn)行重組分析。⑼利用R4GAMIEROSGUTHPEROBSON方法、HNNHIERARCHICAL人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測法、PHD多重比對人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)比對預(yù)測結(jié)構(gòu)法、PREDAT單序列分析人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測結(jié)構(gòu)法、SOPMA改進(jìn)型自我優(yōu)化預(yù)測結(jié)構(gòu)法等方法預(yù)測VP1蛋白的二級結(jié)構(gòu)無規(guī)卷曲、Β片層、Β螺旋和Β轉(zhuǎn)角。⑽利用EXPASYAUEXPASYGTOOLS中的SWISSMODEL三級結(jié)構(gòu)同源建模,預(yù)測VP1蛋白的空間構(gòu)象并建模。⑾應(yīng)用DNASTAR軟件的PROTEAN,采用KYTEDOOLITTLE、KARPLUSSCHULTZ、EMINI和JAMESONWOLF對氨基酸的親水性、柔韌性、表面可能性及抗原指數(shù)進(jìn)行單參數(shù)分析。⑿用ABCPRED和DISCOTOPE服務(wù)器預(yù)測B細(xì)胞表位。將單參數(shù)預(yù)測結(jié)果匯總,結(jié)合二級結(jié)構(gòu)中無規(guī)卷曲區(qū)域確定為B細(xì)胞優(yōu)勢表位。最后采用ABCPRED和DISCOTOPE驗證表位預(yù)測結(jié)果。結(jié)果①5個EV71濟(jì)南分離株核苷酸同源性為957%991%,氨基酸同源性為987%100%。在進(jìn)化關(guān)系上,它們與EV71C4A亞型的同源性較高,核苷酸同源性為908%988%,故而屬于C4A亞型。②2個CVA16濟(jì)南分離株核苷酸和氨基酸同源性較高,分別為977%和968%。它們與CVA16B1B亞型的同源性較高,核苷酸和氨基酸的同源性分別為905%955%和968%100%。JNC07和JNB11與大部分毒株相比,無氨基酸變異位點出現(xiàn)。③39份腸道病毒通用型陽性非EV71、非CVA16標(biāo)本,用040011引物擴(kuò)增后,有5例為CVA10,1例為CVA6。其余33份樣本的腸道病毒血清型待定。④利用自行設(shè)計的CVA10分型引物P16、P112擴(kuò)增上述33份血清型待定的標(biāo)本,其中4份標(biāo)本確定CVA10,核苷酸同源性為945%990%,氨基酸同源性為972%995%。⑤在線BLAST程序比對,JND04屬于CVA6型,與2003年,2009年報告的12個CVA6毒株核苷酸同源性為751%923%,同源性最高的是臺灣2008年的EU908152,氨基酸同源性為820%890%;氨基酸在767、773、776、777、792、806、812、824、827、841、843和845位發(fā)生變異。⑥2010年濟(jì)南市2個病毒株在P1區(qū)與EV71C型具有較高相似度SIMPLOT圖中顯示相似度80%,在2B3B區(qū)之間與B基因型相似度較高75%。3’末端這兩個病毒株與EV71各基因型代表株的相似度均不高75%。⑦JNC10與CVA10D型基因組同源性最高,核苷酸和氨基酸的同源性分別為915%976%和904%986%。測序所得VP1基因長為732個核苷酸,其相對分子質(zhì)量為60580,理論等電點為510。VP1蛋白二級結(jié)構(gòu)中以無規(guī)卷曲為主,無跨膜區(qū)域,屬于胞外蛋白。發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫PDB一個已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)編號為3VBHA與VP1具有65%的序列一致性,并以此為模板,得到VP1蛋白三級結(jié)構(gòu)模型。最后,綜合多種抗原表位分析方法得出,JNC10VP1蛋白的B細(xì)胞抗原表位可能是1223、100110、115125、169180、195215及2202385個區(qū)段。結(jié)論⑴兼并引物040011對HEVA類腸道病毒VP1區(qū)3’端具有較高的特異性。⑵引起手足口病的腸道病毒,除EV71和CVA16外,CVA10和CVA6也是其常見病原體。⑶CVA10能引起重癥手足口病和病毒性腦炎、癲癇等嚴(yán)重的臨床表現(xiàn)。⑷2010年2011年濟(jì)南EV71分離株為C4A亞型,CVA16分離株為B1B亞型,CVA10分離株為D基因型,與近幾年中國大陸各基因型優(yōu)勢株流行趨勢基本一致。⑸2010年EV71濟(jì)南分離株存在基因型內(nèi)和型間雙重組現(xiàn)象。⑹CVA10VP1基因編碼蛋白存在多個抗原表位區(qū)域,可能是免疫診斷、藥物作用和疫苗研制的靶位,將為CVA10診斷、治療和預(yù)防提供參考依據(jù)。
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簡介:汕頭大學(xué)汕頭大學(xué)碩士學(xué)位論文粵東地區(qū)喘息性疾病患兒中人博卡病毒的檢出粵東地區(qū)喘息性疾病患兒中人博卡病毒的檢出與病原學(xué)研究與病原學(xué)研究IDENTIFIEDANDPATHOGENICSTUDYONHUMANBOCAVIRUSINCHILDRENWITHWHEEZINGINEASTGUANGDONGIDENTIFIEDANDPATHOGENICSTUDYONHUMANBOCAVIRUSINCHILDRENWITHWHEEZINGINEASTGUANGDONG專業(yè)專業(yè)名稱兒科學(xué)名稱兒科學(xué)學(xué)位申請人周仁彬?qū)W位申請人周仁彬?qū)熈謴V裕師林廣裕主任主任汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院2008年5月中國汕頭目錄中文摘要中文摘要Ⅰ英文摘要英文摘要Ⅲ縮略語縮略語Ⅴ第1章前言第1章前言1第2章粵東地區(qū)喘息性疾病患兒中人博卡病毒的檢出與病原學(xué)初步研究第2章粵東地區(qū)喘息性疾病患兒中人博卡病毒的檢出與病原學(xué)初步研究321材料21材料322方法22方法523結(jié)果23結(jié)果924討論24討論2325小結(jié)25小結(jié)28第3章參考文獻(xiàn)第3章參考文獻(xiàn)29第4章綜述第4章綜述32附錄附錄38致謝致謝45發(fā)表論文情況發(fā)表論文情況46個人簡介個人簡介47
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簡介:目的了解我國健康獻(xiàn)血員隱匿性乙肝病毒感染者的流行率。探討國內(nèi)血站對獻(xiàn)血員乙型肝炎病毒表面抗原HBSAG篩查的安全性和可靠性。進(jìn)一步改進(jìn)獻(xiàn)血員HBV篩查方法,減少HBV的漏檢率;分析隱匿性乙肝感染者病毒S區(qū),探討引起隱匿性感染的原因。方法1收集經(jīng)中心血站依據(jù)國家衛(wèi)生部制定的血庫安全的要求雙篩HBSAG陰性、抗HCV陰性、抗HIV陰性、梅毒螺旋體抗體陰性、谷丙轉(zhuǎn)氨酶ALT<40IUML陰性的合格獻(xiàn)血員血漿2~3ML。20℃保存;2雅培ARCHITECTI2000電化學(xué)發(fā)光儀檢測HBSAG定量;NESTPCR擴(kuò)增乙肝病毒S區(qū)、C區(qū)、X區(qū);3NESTPCR擴(kuò)增隱匿性乙肝病毒感染者病毒PRESS區(qū),PCR產(chǎn)物直接測序并與標(biāo)準(zhǔn)病毒序列對比分析病毒株變異。結(jié)果1經(jīng)雅培ARCHITECTI2000復(fù)檢健康獻(xiàn)血員中HBSAG陽性率為65%64983;擴(kuò)增病毒S、C、X區(qū),609%3964至少兩個區(qū)擴(kuò)增陽性;健康獻(xiàn)血員隱匿性HBV感染率為40%39983。2漏檢的樣本HBSAG滴度定量,中位數(shù)為017IUML005114IUML;HBSAG陽性的標(biāo)本609%3964病毒擴(kuò)增陽性,91%2564病毒擴(kuò)增陰性;HBSAG定量陽性組中位數(shù)為015IUML005096IUML,陰性組中位數(shù)為018IUML005114IUML,病毒擴(kuò)增陽性組與陰性組之間HBSAG定量、性別比例和轉(zhuǎn)氨酶水平均無統(tǒng)計學(xué)意義。3隱匿性感染者病毒載量均很低,約50~1000拷貝ML;病毒PRESS區(qū)段擴(kuò)增陽性率359%1439;其中609%3964至少兩個區(qū)擴(kuò)增陽性,296%1964S區(qū)擴(kuò)增陽性,641%4164C區(qū)擴(kuò)增陽性,656%4264X區(qū)擴(kuò)增陽性。359%1439擴(kuò)增出病毒PRESS區(qū)段;4測序結(jié)果峰圖均一,未見混合感染。將S基因翻譯成氨基酸后,與GENBANK中各種基因型標(biāo)準(zhǔn)株的S區(qū)蛋白對比,并沒有發(fā)現(xiàn)常見的已有文獻(xiàn)證實可導(dǎo)致HBSAG陰性或分泌量降低的“A”決定簇變異??梢娚贁?shù)可能與HBSAG陰性相關(guān)的S區(qū)氨基酸位點突變S45D,N68D,Q129R,F(xiàn)134N,V180S,V190I。結(jié)論目前經(jīng)血站常規(guī)檢測HBSAG為陰性的合格血液,用敏感性更高的試劑仍能檢測出HBSAG及HBVDNA。臨床用血存在導(dǎo)致乙肝感染的風(fēng)險。HBSAG分泌量處于判斷界限附近時,即使是較為精確的電化學(xué)發(fā)光法檢測技術(shù),對于樣本病毒陽性和陰性也難于作出判定。造成OBI的主要原因可能由于HBV低水平復(fù)制,檢測試劑的靈敏度不夠;病毒變異導(dǎo)致HBSAG的檢測失敗。
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簡介:研究背景慢性丙型肝炎是嚴(yán)重危害人類健康的疾病之一。盡管目前世界范圍內(nèi)對于慢性丙肝防治理論與方法上取得了長足進(jìn)展,但HCV感染慢性化的免疫學(xué)機制研究的不是十分透徹,持續(xù)的病毒血癥導(dǎo)致感染后丙型肝炎肝硬化、丙型肝炎肝癌的發(fā)生。免疫應(yīng)答在丙型肝炎的發(fā)病機制中起重要作用。細(xì)胞免疫功能異常可能是造成病毒持續(xù)感染的主要原因之一,尤其是淋巴細(xì)胞數(shù)量和功能的異常是HCV感染慢性化的重要原因。目的研究慢性丙型肝炎患者外周血T淋巴細(xì)胞上抑制性受體PD1表達(dá)情況與健康人群的差異,及在中心記憶細(xì)胞、效應(yīng)記憶性細(xì)胞、效應(yīng)細(xì)胞表面的表達(dá)情況,同時檢測抗病毒治療后12周、48周PD1在CD4、CD8的T淋巴細(xì)胞表面及記憶性細(xì)胞、效應(yīng)細(xì)胞表達(dá)情況與抗病毒治療前的差異研究CD4CD25FOXP3TREG細(xì)胞在慢性丙型肝炎患者外周血分布頻率與健康人群的差異,及抗病毒治療后12周、48周其分布頻率的變化研究HLAA2抗原在慢性丙型肝炎患者率的高低,為進(jìn)一步進(jìn)行HCV特異性肽段刺激做準(zhǔn)備研究基因1B型的HCVNS314061415及HCVNS310731081兩條肽段刺激慢性丙型肝炎患者外周血T淋巴細(xì)胞后,CD4、CD8的T淋巴細(xì)胞分泌穿孔素、顆粒酶、干擾素Γ的殺傷能力。材料和方法11選擇慢性丙型肝炎患者34例為研究對象,用肝素鈉試管收集抗病毒治療基線、抗病毒治療12周、48周時外周血標(biāo)本,應(yīng)用密度梯段離心法提取單個核細(xì)胞,依照CD45RA及CD27分子在CD4及CD8的T淋巴細(xì)胞表面的表達(dá)情況將細(xì)胞分為4群,分別是原始細(xì)胞CD4CD27CD45RA、中心記憶細(xì)胞(CD4CD27CD45RA)、效應(yīng)記憶性細(xì)胞(CD4CD27CD45RA)、效應(yīng)性細(xì)胞CD4CD27CD45RA原始細(xì)胞CD8CD27CD45RA、中心記憶細(xì)胞(CD8CD27CD45RA)、效應(yīng)記憶性細(xì)胞(CD8CD27CD45RA)、效應(yīng)性細(xì)胞(CD8CD27CD45RA)。將PECY7標(biāo)記的CD3、APCCY7標(biāo)記的CD4、PERCP標(biāo)記的CD8、APC標(biāo)記的CD45RA、FITC標(biāo)記的CD27、PE標(biāo)記的PD1抗體加入提取出的細(xì)胞內(nèi),振蕩均勻,室溫,避光,孵育20MIN。12轉(zhuǎn)移細(xì)胞至上樣管內(nèi),在流式細(xì)胞儀檢測PD1在各群細(xì)胞的表達(dá)情況。13復(fù)蘇慢性丙型肝炎患者及健康對照外周血單個核細(xì)胞,將FITC標(biāo)記的CD4及PE標(biāo)記的CD25抗體各15ΜL,先后加入準(zhǔn)備好的含有細(xì)胞的EP管內(nèi),同時設(shè)立同型對照。14經(jīng)過固定、破膜處理后加入胞內(nèi)染色劑APCFOXP3抗體15ΜL,室溫孵育20MIN。15轉(zhuǎn)移細(xì)胞至上樣管內(nèi),流式細(xì)胞儀檢測CD4CD25FOXP3TREG細(xì)胞在慢性丙型肝炎患者及健康對照人群分布頻率。21同樣應(yīng)用密度梯度離心法,選取110例CHC患者外周血標(biāo)本提取單個核細(xì)胞,取FITC標(biāo)記的CD3及PE標(biāo)記的HLAA2抗體各15ΜL加入細(xì)胞,室溫、避光孵育20MIN。22將孵育好的細(xì)胞轉(zhuǎn)移至上樣管,流式細(xì)胞儀進(jìn)行HLAA2分型檢測。31將1105ML的細(xì)胞鋪在24孔板中,分別加入基因1B型NS314061415及NS310731081肽段和細(xì)胞共孵育24H。32將孔板中一組孔內(nèi)加入阻斷劑,另一組孔不加阻斷劑,孵育45個H后收獲細(xì)胞于15ML的EP管中,加入PECY7標(biāo)記的CD3、APCCY7標(biāo)記的CD4、PERCP標(biāo)記的CD8抗體各15ΜL加入EP管內(nèi),振蕩均勻,室溫,避光,孵育20MIN。33將細(xì)胞經(jīng)過固定、破膜處理后,將未加阻斷劑的細(xì)胞加入FITC標(biāo)記的PERFIN(穿孔素)、將加入阻斷劑的細(xì)胞內(nèi)加入PE標(biāo)記的GRAZYME(顆粒酶)B、APC標(biāo)記的INTERFERONΓ抗體,室溫、避光孵育30MIN。34將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至上樣管內(nèi),流式細(xì)胞儀檢測CD4及CD8的細(xì)胞分泌穿孔素、顆粒酶及干擾素Γ的水平結(jié)果1PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD4T淋巴細(xì)胞表面的表達(dá)水平高于健康對照組T3837,P00007,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD8T淋巴細(xì)胞表面的表達(dá)水平高于健康對照組T2142,P0043PD1在CD4T淋巴的中心記憶性細(xì)胞T2498,P00213、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T5239,P00001、效應(yīng)細(xì)胞T3634,P00014表面表達(dá)均高于健康對照組PD1在CD8T淋巴的中心記憶性細(xì)胞T3688,P00015、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T3088,P00058、效應(yīng)細(xì)胞T4455,P00002表面表達(dá)均高于健康對照組。2慢性丙型肝炎患者治療至12周時,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD4T淋巴細(xì)胞T4108,P00002表面表達(dá)高于健康對照組,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD8T淋巴細(xì)胞T2071,P00458表面表達(dá)高于健康對照組在CD4中心記憶性細(xì)胞T2761,P00129、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T2618,P00174、效應(yīng)細(xì)胞T2601,P00174表面表達(dá)均高于健康對照組PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD8T淋巴細(xì)胞的中心記憶性細(xì)胞T2260,P00364、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T4331,P00004、效應(yīng)細(xì)胞T4346,P00003表面表達(dá)均高于健康對照組。3慢性丙型肝炎患者治療至48周時,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD4T淋巴細(xì)胞T000302,P09702,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD8T淋巴細(xì)胞T0098,P09231表面表達(dá)與健康對照組無明顯差異PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD4的中心記憶性細(xì)胞T1239,P02312、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T08306,P04155、效應(yīng)細(xì)胞T05457,P05920表面表達(dá)均與健康對照無明顯差異,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD8中心記憶性細(xì)胞T09505,P03544、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T03535,P07278、效應(yīng)細(xì)胞T02533,P08029表面表達(dá)均與健康對照無明顯差異與慢性丙型肝炎患者治療至12周時比較,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD4中心記憶性細(xì)胞T2441,P00252、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T2852,P00095、效應(yīng)細(xì)胞T3079,P00065表面表達(dá)明顯降低與慢性丙型肝炎患者治療至12周時比較,PD1在慢性丙型肝炎患者外周血CD8中心記憶性細(xì)胞T4849,P00001、效應(yīng)記憶性T細(xì)胞T6723,P00001、效應(yīng)細(xì)胞T7569,P00001表面表達(dá)明顯降低。4CD4CD25FOXP3TREG在慢性丙型肝炎患者外周血分布頻率高于健康對照組T3569P0002。5慢性丙型肝炎患者抗病毒治療至12周時CD4CD25FOXP3TREG外周血分布頻率仍高于健康對照組T2696,P00132。6慢性丙型肝炎患者抗病毒治療至48周時CD4CD25FOXP3TREG外周血分布頻率與抗病毒治療前基線T3407,P00028、治療至12周時T2565,P00152比較明顯降低。7慢性丙型肝炎患者抗病毒治療基線外周血CD4CD25FOXP3TREG分布頻率與HCVRNA載量呈正相關(guān)R0698,P00016。8HLAA2抗原陽性率在慢性丙型肝炎患者中分布率與健康對照組無明顯差異,陽性率為3909%。9慢性丙型肝炎患者外周血CD4T細(xì)胞經(jīng)NS314061415肽段刺激后分泌顆粒酶BT20807,P00229干擾素ΓT2561,P00307及穿孔素T4767,P0001的水平較健康對照人群明顯降低慢性丙型肝炎患者外周血CD8T細(xì)胞經(jīng)NS314061415肽段刺激后分泌顆粒酶BT2229,P00499干擾素ΓT4598,P00018及穿孔素T2387,P00408的水平較健康對照人群明顯降低慢性丙型肝炎患者外周血CD4T細(xì)胞經(jīng)NS310731081肽段刺激后分泌顆粒酶BT2564,P00334、干擾素ΓT2633,P0003及穿孔素T2564,P00334的水平較健康對照人群明顯降低慢性丙型肝炎患者外周血CD8T細(xì)胞經(jīng)NS310731081肽段刺激后分泌顆粒酶BT3008,P00148、干擾素ΓT2922,P00192及穿孔素T2818,P00201的水平較健康對照人群明顯降低。10與健康對照組相比較,慢性丙型肝炎患者外周血CD4T淋巴細(xì)胞增殖能力低下,二者差異有統(tǒng)計學(xué)意義與健康對照組相比較,慢性丙型肝炎患者外周血CD8T淋巴細(xì)胞增殖能力低下,二者差異有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)論1PD1在慢性丙型肝炎患者治療前基線表達(dá)于外周血CD4T淋巴細(xì)胞、CD8T淋巴細(xì)胞表面及CD4T淋巴細(xì)胞、CD8T淋巴細(xì)胞中心記憶細(xì)胞、效應(yīng)記憶細(xì)胞、效應(yīng)細(xì)胞水平明顯高于健康對照組,經(jīng)抗病毒治療后連續(xù)觀察抗病毒治療至12周、48周PD1在上述各群細(xì)胞表達(dá)明顯降低,抑制性分子的表達(dá)上調(diào)反應(yīng)了慢性丙型肝炎患者體內(nèi)T細(xì)胞功能的缺陷。2外周血CD4CD25FOXP3TREG分布頻率經(jīng)抗病毒治療后亦呈現(xiàn)進(jìn)行性減少趨勢,CD4CD25FOXP3TREG可能參與了HCV感染慢性化的發(fā)病過程。3經(jīng)HCV特異性肽段刺激后,慢性丙型肝炎患者外血T淋巴細(xì)胞殺傷能力減弱,且慢性丙型肝炎患者外周血CD4T、CD8T淋巴細(xì)胞增殖能力較健康對照患者差,慢性丙型肝炎患者T細(xì)胞增殖和殺傷功能的減弱是HCV感染慢性化的重要因素。上述因素是慢性丙型肝炎患者持續(xù)病毒血癥的重要免疫學(xué)原因。
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簡介:中山大學(xué)碩士學(xué)位論文鼻咽癌高發(fā)區(qū)EB病毒環(huán)境激活物的流行病學(xué)研究及CYP1A1基因與鼻咽癌易感性的關(guān)聯(lián)分析姓名徐亞菲申請學(xué)位級別碩士專業(yè)腫瘤學(xué)指導(dǎo)教師賈衛(wèi)華20100513中山大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要示人們?nèi)粘I钏佑|的一些環(huán)境物質(zhì)或者食物中存在可以誘導(dǎo)EBV再激活的物質(zhì),這些環(huán)境因素暴露量的差異也許是導(dǎo)致血清中EBV水平差異,進(jìn)而引起鼻咽癌發(fā)病差異的主要因素之一。但是,目前尚無來自流行病學(xué)的證據(jù)支持廣東咸魚或中草藥等對EBV存在再激活作用。大量的研究表明吸煙、飲酒、食用腌制食品、傳統(tǒng)中草藥等都和鼻咽癌的發(fā)病風(fēng)險升高有關(guān),但是具體機制并不清楚。這些環(huán)境因素對EBV的再激活是否有作用目前也尚不清楚。在論文第一部分,我們通過在鼻咽癌高發(fā)區(qū)廣東省開展大規(guī)模的流行病學(xué)調(diào)查篩查可能的EBV環(huán)境激活物。另外,移民流行病學(xué)研究證據(jù)和復(fù)合分離分析研究結(jié)果均提示遺傳因素在鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用。細(xì)胞色素P450CYTOCHROMEP450,CYP是體內(nèi)代謝活化亞硝酸鹽等致癌物質(zhì)的重要代謝酶。作為CYP450超家族的亞家族之一,CYPIA遺傳多態(tài)性與頭頸腫瘤、肺癌、乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌等多種腫瘤易感性相關(guān),是煙草前致癌物如多環(huán)芳烴和芳香烴類等的主要代謝活化酶,可以將各種前致癌物質(zhì)轉(zhuǎn)化為具有致癌能力的活性中間產(chǎn)物。因此,在論文第二部分,我們以廣東鼻咽癌核心家系為研究對象,利用以家系為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)研究探討基因CYPIA上ML位點和M2位點與鼻咽癌易感性的關(guān)系。Ⅱ
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簡介:背景與目的高效抗逆轉(zhuǎn)錄病毒療法HIGHLYACTIVEANTIRETROVIRALTHERAPY,HAART被認(rèn)為是現(xiàn)今治療HIV/AIDS行之有效的辦法,從根本上改變了人類HIV感染的臨床進(jìn)程。在多藥聯(lián)合應(yīng)用過程中,個體間藥代動力學(xué)差異等諸多因素影響藥物在體內(nèi)的作用發(fā)揮。為了提高藥物的治療效果,使得藥物在有效濃度水平發(fā)揮效能,減小毒性,增大藥效,臨床開展藥物濃度監(jiān)測,幫助個體化劑量,達(dá)到抗病毒治療理想效果。我國2003年開始推廣免費高效抗病毒治療,應(yīng)用國產(chǎn)仿制藥和少部分進(jìn)口藥品對感染者進(jìn)行治療,國內(nèi)大宗前瞻性研究中證實治療效果良好,為現(xiàn)今國內(nèi)臨床廣泛應(yīng)用。目前應(yīng)用于臨床的3類抗逆轉(zhuǎn)錄病毒藥物缺少以中國人為研究對象的有效血藥濃度數(shù)據(jù),因此本研究探討HIVAIDS患者HARRT組合藥物多劑量穩(wěn)態(tài)時的藥物動力學(xué)特點,探討其藥動學(xué)規(guī)律和藥效學(xué)特點。對象與方法在藥動學(xué)研究中,隨機選取北京協(xié)和醫(yī)院內(nèi)科門診規(guī)律隨診,HARRT超過6個月,自愿簽署知情同意書并入院的HIV/AIDS患者23人,在服藥0,05,1,15,2,3,4,6,8,10,12,145,24,265小時抽取EDTA抗凝靜脈血4ML,檢測藥物血漿濃度。按照HAART用藥種類分組討論齊多夫定、拉米夫定、奈韋拉平和依非韋倫的藥動學(xué)規(guī)律。在藥效學(xué)研究中,隨機選取北京協(xié)和醫(yī)院內(nèi)科門診規(guī)律隨診,HARRT超過2個月,自愿簽署知情同意書并入院的HIVAIDS患者共計75人男38人,女37人,在服藥前和服藥后2~3小時抽取EDTA抗凝靜脈血4ML,檢測藥物血漿濃度。按照HAART用藥種類分組研究,討論齊多夫定、拉米夫定、奈韋拉平和依非韋倫的藥效學(xué)特點。結(jié)果在我國首先建立了3個適用于臨床HAART藥物濃度監(jiān)測的方法,方法檢測國內(nèi)廣泛應(yīng)用的7種3大類抗HIV藥物,操作簡便,靈敏度高,重現(xiàn)性好,檢測效率高,適合廣泛開展大樣本量監(jiān)測。齊多夫定的國產(chǎn)仿制藥在體內(nèi)吸收、分布良好;AUC024,CMAX,T12顯著高于國外研究;其血漿谷濃度與血脂異常有顯著相關(guān)。中國人口服拉米夫定較國外研究TMAX長,AUC024高;300MGQ24H與150MGQ12H的給藥方式血漿藥物CMIN,CMAX和AUC024未見顯著差異。奈韋拉平的國產(chǎn)仿制藥在體內(nèi)吸收分布良好,滿足3ΜGML有效治療濃度;CMIN,CMAX和AUC024均遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于國外研究;奈韋拉平血漿CMIN與谷丙轉(zhuǎn)氨酶和谷草轉(zhuǎn)氨酶有顯著相關(guān)。依非韋倫的血藥濃度24小時滿足治療濃度,血漿CMAX顯著高于國外研究。結(jié)論本研究建立了3個高效液相色譜法覆蓋檢測7種抗病毒治療藥物;對于4種藥物進(jìn)行臨床藥動學(xué)及藥效學(xué)討論;建立完整的臨床藥動學(xué)及藥效學(xué)研究資料,為HARRT藥物監(jiān)測奠定基礎(chǔ)。
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簡介:目的人巨細(xì)胞病毒(HUMANCYTOMEGALOVIRUS,HCMV)感染在人群中普遍存在,HCMV感染可引起患兒的神經(jīng)系統(tǒng)及消化系統(tǒng)的多種疾病,已成為引起新生兒疾病和先天畸形的重要感染因素之一,但HCMV先天感染的致病機制尚不清楚。1996年,CHATA等對HCMV實驗室株AD169株、TOWNE株及一株命名為TOLEDO的低傳代分離株進(jìn)行了核酸序列比較,發(fā)現(xiàn)TOLEDO株在ULB’區(qū)含有19個在AD169株不存在的新基因,分別命名為HCMVUL133、UL134、UL135UL151,此19個基因可能在病毒的復(fù)制、潛伏和對宿主的致病性方面起重要作用。本研究以酵母雙雜交系統(tǒng)為手段篩選與HCMVUL135蛋白相互作用人胎腦文庫的蛋白因子,進(jìn)而找出HCMV感染導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)疾病的可能途徑。該研究以這一區(qū)域片段作為誘餌蛋白,從人胎腦細(xì)胞文庫中篩選與之結(jié)合的靶蛋白,為進(jìn)一步深入研究HCMV的致病機制奠定基礎(chǔ)。實驗材料與方法一、實驗材料標(biāo)本為中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院病毒室保存的臨床低傳代分離株H;構(gòu)建表達(dá)載體的相關(guān)試劑;酵母雙雜交實驗相關(guān)試劑;常用實驗設(shè)備如BECKMAN臺式低溫高速離心機、PERKINELMERPCR循環(huán)儀、電穿孔儀(BIAD)、全溫振蕩培養(yǎng)箱等;常用數(shù)據(jù)庫及分析軟件如基因組數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)分析數(shù)據(jù)庫、凝膠成像及掃描分析軟件、引物設(shè)計軟件等。二、實驗方法從感染了人巨細(xì)胞病毒的人胚肺中提取HCMVDNA,應(yīng)用PCR技術(shù)以HCMVDNA為模板擴(kuò)增出UL135基因的序列,將UL135擴(kuò)增產(chǎn)物與載體PGBKT7同時進(jìn)行雙酶切后純化、連接,篩選鑒定重組克?。≒GBKT7UL135),測序并分析。應(yīng)用酵母雙雜交技術(shù)篩選人胎腦CDNA文庫中與HCMVUL135編碼蛋白相互作用的蛋白。1、提取文庫質(zhì)粒;2、將含有PGBKT7UL135重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到酵母細(xì)胞AH109中,然后再將提取的文庫質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到含有PGBKT7UL135質(zhì)粒的酵母細(xì)胞AH109中;3、篩選陽性克?。@色反應(yīng)及PCR技術(shù)),回轉(zhuǎn)鑒定,將與HCMVUL135相互作用的CDNA文庫基因測序;4、BLAST分析。結(jié)果采用特異性引物擴(kuò)增出HCMVUL135基因片段,片段長度為987BP,并成功將HCMVUL135片段克隆到酵母系統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄結(jié)合域PGBKT7上,命名為PGBKT7UL135。應(yīng)用PCR技術(shù)鑒定含PGBKT7UL135質(zhì)粒的陽性克隆,然后提取PGBKT7UL135質(zhì)粒,用ECⅠ和BAMHⅠ限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定,測序分析顯示結(jié)果與預(yù)期一致。轉(zhuǎn)化文庫質(zhì)粒到含有PGBKT7UL135的AH109酵母細(xì)胞中并對轉(zhuǎn)化效率進(jìn)行了測定,在二缺平板上長出260個克隆,計算轉(zhuǎn)化效率026104CFUΜG,符合要求。做顯色反應(yīng)以初篩排除一些四缺培養(yǎng)基生長的假陽性克隆,有95個菌落呈藍(lán)色,將其增值并提取酵母質(zhì)粒。將提取的酵母質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化到大腸桿菌后涂含AMP(氨芐青霉素)平板,PCR鑒定轉(zhuǎn)化的菌落(用文庫的上下游引物,以鑒定所轉(zhuǎn)化的是否為文庫信息),結(jié)果顯示PCR方法鑒定出陽性克隆DNA片段大小在500BP1500BP之間,選出陽性克隆60個,再將陽性克隆質(zhì)?;剞D(zhuǎn)含PGBKT7UL135基因的酵母細(xì)胞AH109中,在二缺和四缺培養(yǎng)基中均生長。測序及BLAST結(jié)果分析顯示有多個克隆與UL135編碼蛋白相互作用,其中2個克隆與THY1(CD90)高度同源,其同源率達(dá)到98%。結(jié)論成功應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選出與HCMVUL135編碼蛋白相互作用的蛋白,其中THY1在HCMV感染致病過程中可能起重要作用。
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簡介:分類號密級UDC學(xué)號406520511067南昌大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文小鼠小鼠FAPΑ基因重組腺病毒感染樹突狀細(xì)胞體內(nèi)基因重組腺病毒感染樹突狀細(xì)胞體內(nèi)抗小鼠抗小鼠LEWIS肺癌肺癌移植瘤移植瘤的免疫學(xué)研究的免疫學(xué)研究IMMUNOLOGICALSTUDYONMURINEBONEMARROWDERIVEDDENDRITICCELLSINFECTEDWITHMURINEFIBROBLASTACTIVATIONPROTEINΑRECOMBINANTADENOVIRALVECTSAGAINSTSUBCUTANEOUSTRANSPLANTATIONTUMOFLEWISLUNGCARCINOMA李環(huán)羽李環(huán)羽培養(yǎng)單位(院、系)南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院指導(dǎo)教師姓名、職稱況九龍教授申請學(xué)位的學(xué)科門類醫(yī)學(xué)學(xué)科專業(yè)名稱內(nèi)科學(xué)(呼吸)論文答辯日期2014年6月答辯委員會主席傅穎媛評閱人陳穎蘭熊建萍2014年6月摘要II摘要目的目的制備抗腫瘤疫苗RADFAPΑDCS,研究其抗LEWIS肺癌的預(yù)防與治療效應(yīng)。方法方法1、取C57BL6小鼠骨髓培養(yǎng)骨髓來源的樹突狀細(xì)胞,采用重組腺病毒RADFAP?。〝y帶目的基因)、RADEGFP(對照病毒)進(jìn)行感染,制備DCS疫苗并鑒定。2、制備C57BL6小鼠皮下移植瘤(LEWIS肺癌細(xì)胞)模型。3、制成的各種DCS疫苗體內(nèi)抗小鼠LEWIS肺癌的免疫學(xué)研究(1)預(yù)防實驗小鼠隨機分為3組,各組小鼠先分別接種疫苗(RADFAPΑDCS)、RADEGFPDCS、DCS,每周1次,共3次后,再在小鼠右肋腹側(cè)接種LEWIS肺癌細(xì)胞,觀察成瘤情況及小鼠的生存率;(2)治療實驗即各組小鼠先在右肋腹側(cè)皮下接種LEWIS肺癌細(xì)胞后,隨機分為3組,再分別接種RADEGFPDCS、RADFAPΑDCS、DCS,每周1次,共3次,觀察皮下腫瘤體積及小鼠的生存率。結(jié)果結(jié)果WESTERNBLOT顯示RADFAPΑDCS表達(dá)鼠成纖維細(xì)胞活化蛋白(FAP)。表明RADFAPΑDCS制備成功。CAF的WESTERNBLOT結(jié)果與其免疫組化結(jié)果相一致,說明C57BL6小鼠皮下移植瘤模型的腫瘤微環(huán)境中存在FAP。在預(yù)防實驗中通過56天的觀察免疫接種RAD一FAPΑDCS的小鼠產(chǎn)生了明顯的抗LEWIS肺癌的效果導(dǎo)致了小鼠的生存期延長與免疫接種RAD一EGFPDCS的小鼠或免疫接種DCS的小鼠生存率比較有顯著差異KAPLANMEIER分析P005。應(yīng)用RAD一FAPΑDCS疫苗雖可抑制腫瘤生長但并不能清除腫瘤荷瘤小鼠死于腫瘤。在治療實驗中,用RAD一FAPΑDCS疫苗治療能顯著抑制LEWIS肺癌的生長在24天的觀察期內(nèi)皮下接種RAD一FAPΑDCS治療對小鼠腫瘤生長的抑制作用非常明顯第10天起P005。
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上傳時間:2024-03-10
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