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1、以一維、準(zhǔn)一維DNA分子鏈及準(zhǔn)一維多鏈無序體系為研究對(duì)象,從單電子緊束縛模型的哈密頓量出發(fā),利用在負(fù)本征值理論及無限階微擾理論發(fā)展起來的多對(duì)角高階隨機(jī)厄米矩陣的求解方法及傳輸矩陣方法、重整化群方法等,研究了一維隨機(jī)二元無序DNA分子鏈、一維準(zhǔn)周期Cantor型和RS型人工DNA序列、SRY基因序列、準(zhǔn)一維多鏈無序體系、準(zhǔn)一維魚骨模型DNA分子鏈及準(zhǔn)一維Ladder模型的DNA分子鏈的電子結(jié)構(gòu)及電子輸運(yùn)特性。
(1)對(duì)于一維
2、二元隨機(jī)無序DNA分子鏈,我們發(fā)現(xiàn)DNA分子中某一堿基對(duì)的比例越高,系統(tǒng)能量態(tài)密度分布的對(duì)稱性越好,電子輸運(yùn)能力亦越強(qiáng)。由單一堿基對(duì)構(gòu)成的DNA分子的飽和電流強(qiáng)度遠(yuǎn)大于由兩種堿基對(duì)按一定的組分隨機(jī)分布的DNA分子的飽和電流強(qiáng)度,且當(dāng)DNA分子中兩種堿基對(duì)的含量相等時(shí),其飽和電流強(qiáng)度最小。同時(shí),富含C-G堿基對(duì)的DNA分子比富含A-T的DNA分子的電子輸運(yùn)能力大。金屬電極位能對(duì)DNA分子電子輸運(yùn)的影響體現(xiàn)在兩方面,一方面,當(dāng)偏壓較小時(shí)電極
3、位能具有阻礙電荷注入的效果,另一方面,當(dāng)偏壓較大時(shí),電極位能有增強(qiáng)電荷注入的效果。當(dāng)耦合強(qiáng)度與DNA分子堿基對(duì)間交互作用相等,發(fā)生共振電子注入,體系飽和電流強(qiáng)度最大。當(dāng)耦合強(qiáng)度大于DNA分子堿基對(duì)間交互作用時(shí),隨著耦合強(qiáng)度的增大,電荷注入能力減小,其飽和電流強(qiáng)度亦相應(yīng)減小。
(2)對(duì)于Cantor型和RS型人工DNA序列,采用一維隨機(jī)行走模型和Hurst分析法研究了系統(tǒng)的重標(biāo)極差函數(shù)和Hurst指數(shù)等描述統(tǒng)計(jì)屬性的物理量,
4、對(duì)序列中可能存在的關(guān)聯(lián)進(jìn)行了探討;從Anderson緊束縛模型出發(fā),用負(fù)本征值理論和無限階微擾理論研究了系統(tǒng)的電子態(tài)密度;采用重整化群方法研究了該序列的電子輸運(yùn)特性。研究發(fā)現(xiàn),這些準(zhǔn)周期序列中存在擴(kuò)展態(tài)、局域態(tài)和臨界態(tài)三者是共存狀態(tài);序列的凈位移及其標(biāo)準(zhǔn)偏差函數(shù)曲線對(duì)標(biāo)度變化的穩(wěn)定性直接證明了其標(biāo)度不變性及自相似性;Cantor序列的Hurst指數(shù)約為0.23,小于0.5,說明該系統(tǒng)具有內(nèi)在的正相關(guān)屬性,而RS序列的Hurst指數(shù)在0.
5、5附近波動(dòng),說明該序列的不同部分具有不同的關(guān)聯(lián)屬性,有些片段呈現(xiàn)正相關(guān),而有些片段則呈現(xiàn)負(fù)相關(guān);這些序列中存在相當(dāng)數(shù)量具有好的透射性的擴(kuò)展能態(tài),且隨著序列長(zhǎng)度的增加,擴(kuò)展態(tài)的能量區(qū)間變得更為細(xì)碎,共振峰的數(shù)量、高度及位置均有所改變,具有好的透射性的電子態(tài)數(shù)量略有減少,但能在相對(duì)較長(zhǎng)的序列中維持其存在,推測(cè)為Cantor型和RS型序列中存在著關(guān)聯(lián)的結(jié)果,并且,相對(duì)而言,RS型序列中的關(guān)聯(lián)比較弱。
(3)對(duì)SRY(Sex de
6、termining Region Y)基因序列的研究表明,系統(tǒng)的能量本征值分布在能量區(qū)間[7.6eV,9.1eV]中,在低能態(tài)區(qū)間有較小的態(tài)密度分布,系統(tǒng)中存在幾個(gè)寬度基本固定的能隙,當(dāng)SRY態(tài)的數(shù)量增加時(shí),增加的態(tài)極少出現(xiàn)在帶隙中,絕大部分新增的能態(tài)只是使原來能量帶的能態(tài)密度更大。在這種實(shí)際的DNA中,絕大多數(shù)情況下,系統(tǒng)中電子的局域長(zhǎng)度小于系統(tǒng)的鏈長(zhǎng),局域態(tài)占據(jù)著絕大多數(shù),擴(kuò)展態(tài)只存在于幾個(gè)孤立能量值下,說明SPY序列對(duì)電子具有一定
7、的透射性,但鑒于無連續(xù)擴(kuò)展態(tài)的存在,它們對(duì)系統(tǒng)的總的電導(dǎo)的貢獻(xiàn)是微小的,在熱力學(xué)極限之下,輸運(yùn)系數(shù)T(E)急劇減小,其導(dǎo)電性幾乎可以忽略。SRY基因序列Hurst指數(shù)不是一個(gè)單一值,在序列的不同區(qū)間可以取得大于或小于0.5的Hurst指數(shù)值,說該序列有正關(guān)聯(lián)或負(fù)關(guān)聯(lián)的存在。
(4)一維無序系統(tǒng)和準(zhǔn)一維雙鏈、三鏈無序系統(tǒng)在電子結(jié)構(gòu)上存在很大的差異,即一維與帶狀結(jié)構(gòu)的電子結(jié)構(gòu)存在本質(zhì)區(qū)別。在有序情況下,隨著系統(tǒng)鏈數(shù)的增加,電子
8、態(tài)密度的峰值數(shù)目同樣明顯增多。一維單鏈無序系統(tǒng)有2個(gè)峰值,準(zhǔn)一維雙鏈無序系統(tǒng)有4個(gè)峰值,準(zhǔn)一維三鏈無序系統(tǒng)有6個(gè)峰值;對(duì)角無序體現(xiàn)系統(tǒng)的成分無序;非對(duì)角無序體現(xiàn)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和粒子邊界效應(yīng)。非對(duì)角無序?qū)o序系統(tǒng)電子態(tài)密度的分布影響更大。態(tài)密度為零的能量區(qū)間的減少,是從一維到準(zhǔn)一維,即在向二維過渡的變化中所帶來的影響,是維數(shù)效應(yīng)的體現(xiàn)。準(zhǔn)一維無序系統(tǒng)電子可在兩個(gè)方向上運(yùn)動(dòng)帶來能帶結(jié)構(gòu)的變化,使一維情況下態(tài)密度為零的某些能量區(qū)間被覆蓋。準(zhǔn)一維三
9、鏈無序系統(tǒng)電子態(tài)密度分布底部出現(xiàn)空白,說明準(zhǔn)一維三鏈無序系統(tǒng)的這些能量區(qū)間上電子的態(tài)密度起伏比較小。
(5)準(zhǔn)一維多鏈無序體系中由于格點(diǎn)能量無序的存在,其電子波函數(shù)同樣呈現(xiàn)出局域化特性;當(dāng)體系大小及鏈數(shù)確定時(shí),格點(diǎn)能量無序度的減小會(huì)導(dǎo)致在中間能區(qū)發(fā)生退局域化現(xiàn)象,表現(xiàn)為在中間能區(qū)電子波函數(shù)的局域化程度大于體系大小,即出現(xiàn)擴(kuò)展態(tài),且出現(xiàn)擴(kuò)展態(tài)的能量區(qū)間隨著無序度的減小而呈增大的趨勢(shì),同時(shí),隨著鏈數(shù)的增加,體系有向退局域化方向
10、發(fā)展的趨勢(shì)。在中間能區(qū)電子輸運(yùn)透射系數(shù)較大,而在低能區(qū)及高能區(qū)透射系數(shù)較小,同時(shí)格點(diǎn)能量無序與維度效應(yīng)對(duì)體系的電子輸運(yùn)存在競(jìng)爭(zhēng)效應(yīng),當(dāng)體系格點(diǎn)數(shù)及鏈數(shù)一定時(shí),體系的透射系數(shù)隨著格點(diǎn)能量無序度的增大而減小,而當(dāng)體系格點(diǎn)數(shù)及格點(diǎn)能量無序度一定時(shí),準(zhǔn)一維多鏈無序體系的透射系數(shù)隨著體系鏈數(shù)的增大而增大。
(6)在準(zhǔn)一維DNA分子鏈魚骨模型中,骨架格點(diǎn)的引入極大地影響了DNA分子的這些性質(zhì),當(dāng)計(jì)入骨架格點(diǎn)的影響,隨著環(huán)境無序度W的增
11、大,電子態(tài)密度譜的峰值減小,整個(gè)能量本征值范圍展寬,能帶之間有逐漸融合趨勢(shì),能帶間隙變窄,體現(xiàn)出了一定的無序系統(tǒng)特征,并且各種無序效應(yīng)所產(chǎn)生的影響還不盡相同,其中二元無序所產(chǎn)生的影響最大;環(huán)境無序之下DNA分子中的電子態(tài)基本都是局域的,多數(shù)電子態(tài)的局域長(zhǎng)度小于系統(tǒng)的長(zhǎng)度;考慮骨架在位勢(shì)的DNA分子可能具有半導(dǎo)體屬性,存在著大小基本穩(wěn)定的閾值,且電導(dǎo)σ隨無序度W的變化呈現(xiàn)非單調(diào)性,隨著W的增大,σ先增大后變小再增大。而對(duì)準(zhǔn)一維Ladder
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