棉花鹽脅迫應答基因GhSR13的克隆和功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著土地環(huán)境不斷惡化,鹽堿地面積不斷擴大,如何有效利用這些鹽堿地,成為擺在我們面前的現(xiàn)實問題。棉花具有很高的耐鹽性和耐旱性,可是在實際的生產(chǎn)過程中,可利用的耐鹽耐旱品種并不多見,這就需要通過基因工程手段或者分子生物學手段,尋找出一些耐鹽基因,然后運用基因工程技術,培育出優(yōu)良的棉花品種。
  前期利用基因芯片測序技術,得到一條EST序列信息,通過NCBI數(shù)據(jù)庫比對分析,陸地棉數(shù)據(jù)庫公布的基因信息,成功克隆了該基因的CDS全長序列,并

2、命名為GhSR13。該基因CDS全長1476 bp,編碼492個氨基酸。隨后進行有關GhSR13序列生物信息學的分析。首先,對GhSR13的蛋白家族進行分析發(fā)現(xiàn),該基因?qū)儆贒DE_Tnp_1_6家族。隨后結合NCBI數(shù)據(jù)庫,以及最近公布的二倍體和四倍體棉花4數(shù)據(jù)庫,做了棉花同源種屬的同源性分析和不同種屬的同源性分析,并對該EST序列的開放閱讀框以及保守結構域進行了預測分析。通過同源性比對,在番茄以及擬南芥中都發(fā)現(xiàn)了與GhSR13同源的基

3、因,同源性達到了50%以上,在番茄中該同源基因已經(jīng)被證明參與鹽脅迫反應途徑,而在擬南芥中,該同源基因也被證明響應鹽脅迫途徑。在得到了該基因的CDS序列后,開展了以下實驗。
  首先對該基因是否響應鹽脅迫作了定量分析,在用200 mM NaCl處理后,在0 h,1 h,4 h,6 h,12 h,24 h,分別提取棉花的真葉和根的RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA后進行定量分析。結果表明,在根中,GhSR13的表達量發(fā)生了明顯的變化,推測測其可能

4、參與了鹽脅迫反應途徑。
  隨后,構建了GhSR13-GFP和GhSR13-GUS等一系列的載體,進一步研究該基因是否響應鹽脅迫。GFP熒光亞細胞定位結果表明,GhSR13蛋白定位于細胞核。GUS染色結果表明,該基因主要在根成熟區(qū)表達。通過構建表達有GhSR13-PYES2的酵母菌株并進行鹽處理發(fā)現(xiàn),在200 mM NaCl,10 mM LiCl處理條件下,含有目的基因的酵母菌落生長狀況均不如空白對照,進一步表明該基因是參與了鹽脅

5、迫反應途徑。在隨后的VIGS實驗中發(fā)現(xiàn),600 mM NaCl處理后的棉花葉片發(fā)生明顯的萎蔫,而且被干涉掉的基因棉花植株萎蔫程度要比對照高,表明在基因干涉掉后,加劇植物對鹽脅迫途徑的調(diào)控反應,造成植株對鹽的耐受性降低。通過將棉花基因轉(zhuǎn)入擬南芥材料獲得轉(zhuǎn)基因植株,選取了3個株系(OE-2,OE-3,OE-4)進行鹽處理的表型實驗,結果表明,(OE-2,OE-3, OE-4)這三個轉(zhuǎn)基因種子在萌發(fā)上對鹽的敏感性明顯要比野生型高,根伸長也表現(xiàn)

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