黃瓜分子遺傳圖譜構(gòu)建與整合.pdf

1、黃瓜是我國(guó)普遍栽培的主要蔬菜作物，開(kāi)展黃瓜的分子育種研究具有重要的理論和應(yīng)用意義。構(gòu)建飽和通用的黃瓜遺傳圖譜是開(kāi)展黃瓜分子育種研究的基礎(chǔ)，它將為新品種選育工作和分子標(biāo)記輔助育種提供準(zhǔn)確快捷的工具。雖然黃瓜分子遺傳圖譜的構(gòu)建已經(jīng)取得了重要進(jìn)展，但目前已經(jīng)發(fā)表的連鎖圖譜來(lái)自不同的實(shí)驗(yàn)室，利用的作圖群體和標(biāo)記各不相同，構(gòu)建的圖譜多數(shù)是以F2為作圖群體的臨時(shí)圖譜，并且圖譜的飽和度不高，缺乏通用性和實(shí)用性。本試驗(yàn)采用基于“錨定SSR標(biāo)記"的作圖策

2、略，首先利用2個(gè)F2群體，選用940對(duì)SSR引物，分別構(gòu)建了黃瓜抗白粉病和抗枯萎病分子遺傳圖譜，然后與原有的黃瓜抗病毒病遺傳圖譜進(jìn)行整合，獲得一張基于SSR標(biāo)記的黃瓜遺傳圖譜。因此，整合后的黃瓜遺傳圖譜將在黃瓜基因組學(xué)和分子育種研究中具有很強(qiáng)的實(shí)用性。在完成圖譜整合構(gòu)建的同時(shí)，對(duì)枯萎病、白粉病以及病毒病等重要的抗病性狀進(jìn)行基因定位。 本試驗(yàn)取得如下主要結(jié)果： 1.圖譜構(gòu)建與整合1.1利用WIS2757×19032的F2分

3、離群體為作圖群體構(gòu)建了黃瓜抗白粉病遺傳圖譜：該遺傳圖譜由10個(gè)連鎖組群組成，包含SSRs、AFILP、SCARs等161個(gè)標(biāo)記，其中SSRs標(biāo)記為47個(gè)，覆蓋基因組總長(zhǎng)為824 cM，標(biāo)記平均間隔5.1 cM。每個(gè)連鎖群上的標(biāo)記數(shù)在4～90之間，長(zhǎng)度在43 cM～158 cM范圍，圖譜密度1.5 cM/標(biāo)記(G1)～19 cM/標(biāo)記(G9)。SSR標(biāo)記均勻分布在10個(gè)連鎖群，連鎖群最少含有SSR標(biāo)記2個(gè)，最多含有16個(gè)標(biāo)記。 1

4、.2利用WIS2757×津研2號(hào)的F2分離群體為作圖群體構(gòu)建了黃瓜抗枯萎病遺傳圖譜：該遺傳圖譜由9個(gè)連鎖組群組成，包含SSRs、RAPDs、.AFLP、SCARs等164個(gè)標(biāo)記，其中SSRs標(biāo)記為41個(gè)，覆蓋基因組總長(zhǎng)為530 cM，標(biāo)記平均間隔3.2 cM。每個(gè)連鎖群上的標(biāo)記數(shù)在5～85之間，長(zhǎng)度在22 cM～196 cM范圍，圖譜密度1.2 cM/標(biāo)記(G7)～8.6 cM/標(biāo)記(G1)。圖譜中兩個(gè)標(biāo)記間距小于10 cM的區(qū)域覆蓋圖

5、譜長(zhǎng)度30％。有15個(gè)間隙(gaps)大于15 cM，最大的間隙在連鎖組G9(24.5 cM)。 1.3基于秋棚×歐洲八號(hào)重組自交系群體(RIL)的黃瓜抗病毒病遺傳圖譜的整合圖譜：整合后的黃瓜遺傳圖由10個(gè)連鎖組群組成，包含SSRs、AFLP、SCARs等311個(gè)標(biāo)記，其中SSR標(biāo)記為35個(gè)，覆蓋基因組總長(zhǎng)為934 cM，標(biāo)記平均間隔3.0 cM，連鎖群長(zhǎng)度范圍從40 cM-158 cM，標(biāo)記數(shù)范圍從4～110個(gè)。整合后的圖譜新

6、增加了61個(gè)SSR標(biāo)記，其中G3、G10連鎖群有較多的標(biāo)記增加。 2.抗病基因定位2.1將黃瓜對(duì).ZYMV-CH、PRSV-W、WMV三種病毒的抗性基因定位在整合遺傳圖譜的G3連鎖群上，并且簇聚在15eM的區(qū)間。本研究首次將黃瓜對(duì)ZYMV-CH、PRSV-W、WMV三種病毒的抗性基因同時(shí)在遺傳圖譜上定位，在分子水平上確認(rèn)了三種病毒的簇聚性。 2.2將黃瓜對(duì)枯萎病的抗性基因pm定位在整合遺傳圖譜的G1連鎖群上，白粉病的抗性