栽培稻秈粳亞種基因組的比較研究及藥用野生稻的比較核型分析.pdf

1、1.利用亞州栽培稻（Oryza sativa L.）的秈稻亞種“廣陸矮四號”（Oryza sativa ssp.indicacv Guangluai No.4）的基因組總DNA 作為探針，不同的洗脫嚴謹度條件下對自身和粳稻亞種“日本晴”（Oryza sativa ssp.japonica cv Nipponbare）進行基因組原位雜交（genomicin situ hybridization，GISH）分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，雜交信號在兩個亞種

2、染色體的分布相似，表明它們親緣關系較近。通過采用不同洗脫度，雜交信號出現(xiàn)明顯不同的帶型分布，尤其是在95％的洗脫嚴謹度下，秈稻和粳稻第1、7、8、9、11 染色體上的雜交信號帶型明顯不一致，說明即使在基因組親緣關系極近的亞種之間個別染色體同源性程度也較低。這幾條同源性相對比較低的染色體可能是進化中比較活躍的染色體，易于發(fā)生各種遺傳事件，是染色體組進化中的“先行者”，它們的變化可能最終導致了整個基因組水平上的差異并體現(xiàn)在亞種以及種間差異上

3、。 2. 利用同時分布在栽培稻(O. Sativa)和藥用野生稻(O. Officinalis)第9和第11 染色體上的緊密連鎖的RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)標記為探針，對藥用野生稻進行熒光原位雜交（fluorescence in situ hybridization，F(xiàn)ISH）。比較分析了栽培稻和藥用野生稻的第9和第11 染色體。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與藥用野生稻的常規(guī)核型分

4、析不同，本研究中所確定的藥用野生稻第9和第11 染色體不是遵循染色體長度隨染色體編號遞減的順序進行的，而是在比較分子遺傳圖基礎上結(jié)合染色體常規(guī)核型分析進行的，是比較基因組學細胞水平上的研究，有助于在同一個屬中對不同種作比較研究。 3.基于AA、CC基因組中高度重復序列C0t-1DNA 雜交帶型，對栽培稻、藥用野生稻進一步進行了比較核型分析，并構(gòu)建了相應的雜交帶型模式圖。研究發(fā)現(xiàn)栽培稻和藥用野生稻第9和第11 染色體著絲粒與端粒均