草菇線粒體基因組的研究.pdf

1、本論文探討了草菇線粒體DNA的提取方法并對草菇線粒體基因組進行了測序。在低溫下研磨破碎細胞，用差速離心法去除雜質并沉淀線粒體，DnaseI酶解核DNA，經(jīng)過SDS和蛋白酶K裂解、酚/氯仿抽提可得到較高純度的線粒體DNA。
　　 草菇線粒體基因組測序共得到41個scaffolds，152個contigs，序列總長度約為100kb。其中大于1kb的scaffolds和contigs分別為24和57個，其總長度分別為46678bp和3

2、8193bp。
　　 經(jīng)過序列比對共得到14個蛋白質編碼基因，2個核糖體RNA基因rns和rnl；21個tRNA基因。
　　 對序列片段進行了密碼子、堿基組成、酶切、重復序列分析，結果表明：草菇線粒體基因對第三位堿基為A或T的密碼子有較強的偏好性；2條scaffold片段共有14個單酶切位點；序列中堿基AT含量高于堿基GC；有6堿基重復序列1種，8堿基重復序列4種，9堿基重復序列1種，11和19堿基重復序列各2種，20、