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文檔簡介
1、本論文探討了草菇線粒體DNA的提取方法并對草菇線粒體基因組進行了測序。在低溫下研磨破碎細胞,用差速離心法去除雜質并沉淀線粒體,DnaseI酶解核DNA,經(jīng)過SDS和蛋白酶K裂解、酚/氯仿抽提可得到較高純度的線粒體DNA。
草菇線粒體基因組測序共得到41個scaffolds,152個contigs,序列總長度約為100kb。其中大于1kb的scaffolds和contigs分別為24和57個,其總長度分別為46678bp和3
2、8193bp。
經(jīng)過序列比對共得到14個蛋白質編碼基因,2個核糖體RNA基因rns和rnl;21個tRNA基因。
對序列片段進行了密碼子、堿基組成、酶切、重復序列分析,結果表明:草菇線粒體基因對第三位堿基為A或T的密碼子有較強的偏好性;2條scaffold片段共有14個單酶切位點;序列中堿基AT含量高于堿基GC;有6堿基重復序列1種,8堿基重復序列4種,9堿基重復序列1種,11和19堿基重復序列各2種,20、
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