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文檔簡介
1、本研究以966頭牛為樣本(包括3個品種:中國荷斯坦、魯西黃牛和渤海黑牛),通過PCR-SSCP,PCR-RFLP和DNA測序等方法檢測牛PRLR基因和STAT4基因中新的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點,并將發(fā)現(xiàn)的這些SNPs位點及其不同單倍型與牛的生產(chǎn)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析,篩查與奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,為未來培育高產(chǎn)奶量、高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供參考依據(jù)。
一.PRLR基因多態(tài)性與牛生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)性分析
催
2、乳素受體(PRLR)在從催乳素到乳蛋白基因的信號通路中起著關(guān)鍵作用。它與催乳素結(jié)合后激活JAK2激酶,進(jìn)而使得STAT5轉(zhuǎn)錄因子磷酸化隨后結(jié)合到乳蛋白基因啟動子的識別序列上。因此,PRLR可作為奶牛乳蛋白量和乳蛋白率的候選基因。
本試驗在PRLR基因中發(fā)現(xiàn)了12個SNPs位點,其中42054A>G突變產(chǎn)生了TasⅠ的識別位點,通過PCR-RFLP方法酶切分成AA,AG和GG三種基因型。在中國荷斯坦牛群體中,AG基因型為優(yōu)勢
3、基因型,而在魯西黃牛和渤海黑牛中,GG基因型為優(yōu)勢基因型。另一個42275C>T多態(tài)位點可被MspⅠ識別產(chǎn)生三種基因型CC,TC和TT。在中國荷斯坦牛中,CC為優(yōu)勢基因型,而在魯西黃牛和渤海黑牛中,TT為優(yōu)勢基因型。這2個多態(tài)位點在所研究的3個群體中均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。
將檢測的793頭中國荷斯坦奶牛的這兩個多態(tài)性位點與產(chǎn)奶性狀進(jìn)行了相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)其對產(chǎn)奶性狀均沒有顯著影響。進(jìn)一步
4、地單倍型分析表明:在構(gòu)建的8種單倍型中,AACC單倍型個體的乳脂率顯著高于AGCC、AGTC和GGTC個體(P<0.05),因此,AACC單倍型個體所生的后代其乳成分高的可能性更大,可作為選育的單倍型分子標(biāo)記。
二.STAT4基因多態(tài)性與牛生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)性分析
信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子4(STAT4)在乳蛋白基因的表達(dá)和乳腺發(fā)育中起著重要作用。本試驗通過與相關(guān)的序列比對,發(fā)現(xiàn)了4個新的SNPs位點(g.62624
5、A>Css175327225,g.60330A>G ss175327226,g.63823G>C ss175327227和g.66912C>Tss175327228)。4個位點中,有2個(g.62624A>C和g.63823G>C)沒有在所研究的三個品系中檢測到。通過PCR-RFLP方法,突變位點g.60330A>G ss175327226由內(nèi)切酶MspⅠ識別切成三種基因型AA,AG和GG。另一個位點g.66912C>T ss17532
6、7228通過PCR-SSCP方法僅檢測到兩種基因型CC和TC。
g.60330A>G位點的等位基因頻率在牛的3個品種中存在差異。將檢測的793頭中國荷斯坦奶牛的STAT4基因的多態(tài)性位點與產(chǎn)奶性狀進(jìn)行了相關(guān)性分析。g.60330A>G多態(tài)位點對奶牛的305天成年產(chǎn)奶當(dāng)量和乳脂率具有顯著性影響(P<0.05),但與乳蛋白率、乳脂量和乳蛋白量沒有相關(guān)性(P>0.05)。然而,g.66912C>T多態(tài)位點與產(chǎn)奶性狀沒有顯著相關(guān)性
7、(P>0.05)。因此,STAT4基因的g.60330A>G突變可作為一種分子標(biāo)記以區(qū)別多種群體,并在牛的育種計劃中用于產(chǎn)奶量和乳脂率的選擇。
g.60330A>G和g.66912C>T多態(tài)位點單倍型分析表明:共構(gòu)建出6種單倍型,AATC和AACC單倍型個體的乳脂率顯著高于AGCC單倍型組合個體(P<0.05);AGTC單倍型個體的乳蛋白率顯著高于AGCC單倍型組合個體(P<0.05);AGCC單倍型個體的305 d成年產(chǎn)
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